Analyse de la croissance des mutants sur différentes sources de carbone

Le phénotypage que nous avons entrepris consiste à détecter les variations de croissance, sur milieu solide, entre les différents mutants de notre collection . Ce milieu est en fait un milieu dit "minimum" auquel a été supplémenté un ou plusieurs métabolites identifiés comme intermédiaires d'une voie de biosynthèse donnée. Un phénotypage à haut débit de la collection de mutants sur 24 sources de carbone est actuellement en cours.

A gauche : Robot déposant 1152 mutants d'A. baylyi par plaque. Chacune de ces plaques de gélose contient une source de carbone particulière. A droite : Une des plaques de gélose après 24h de pousse à 30°C.

Cette analyse permettra de regrouper les mutants qui présentent, dans un même contexte métabolique, un phénotype différent de celui de la souche sauvage (i.e. voies métaboliques). Un exemple concernant les gènes impliqués dans la voie d'assimilation du glucose est illustré dans la figure ci-dessous.

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