Le Genoscope séquence le génome de Xanthomonas albilineans, une bactérie pathogène de la canne à sucre.

Le génome de cette souche est estimé à 5 Mb. Il sera séquencé à une profondeur d'environ 12X. Trois banques différentes sont utilisées :

• fragments de 3 kb clonés dans le vecteur pcdna2.1 (nombre de copies élevé);
• fragments de 10 kb clonés dans le vecteur pCNS (faible nombre de copies);
• fragments de 20-25 kb clonés dans le vecteur miniBAC pBeloBAC11.

A partir de ces trois banques seront séquencés 31 500, 10 800 et 5 400 clones, respectivement (lectures aux deux extrémités des inserts). Une étape de finition manuelle sera effectuée au Genoscope.