Le Genoscope entreprend le séquençage de 200 fosmides d'une banque métagénomique construite à partir d'ADN total issu de la fraction bactérienne associée à la muqueuse iléale humaine saine.
Pour chaque fosmide, une banque plasmidique (inserts 3 kb) sera réalisée dans pcdna2.1 et 1 500 clones de chaque banque seront séquencés aux deux extrémités, d'où un volume de séquençage prévu de 600 000 lectures.
Tous les fosmides seront assemblés en phase 2 et, après analyse, certains fosmides d'intérêt majeur passeront par une étape de finition.