Dans le cadre du projet ForEST, plusieurs banques d’ADNc
ont été construites à partir de racines mycorhizées ou non
mycorhizées, de feuilles et de bois sur des arbres soumis ou non à
une sécheresse modérée. Le Genoscope doit réaliser le séquençage en
5’ de plus de 55 000 ESTs issus de ces banques. Présentement,
près de 11 000 séquences ont été obtenues à partir des banques
issues de feuilles, et plus de 2 000 séquences à partir des
banques issues de bois. La taille des inserts varie de 0,4 à
1,8kb. Cet effort de séquençage vient en complément du projet Lignome
lancé quelques années plus tôt avec la production de 10 000 EST
de bois de peuplier et sera lui-même complété avec le séquençage de
plus de 500 ADNc pleine longueur dans le cadre de l’AIP séquençage
2006. La distribution relative des différentes séquences dans les
banques d’ADNc ainsi que des analyses globales d’expression sur puce
entière peuplier de type Affymétrix (programme Génoplante 2010
"Popsec") permettront d’identifier des gènes candidats importants pour
l’adaptation des arbres aux stress abiotiques, sur lesquels des
analyses plus poussées seront effectuées :
- Localisation fine dans le bois par des techniques
immunologiques,
- approche de la fonction par génie génétique,
- évaluation de la variabilité allélique dans les populations
naturelles de peuplier.