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It is involved in the biological process described with regulation of transcription, DNA-templated mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000002373.1.2 7719.XP_009860627.1 3.3e-70 271.6 Chordata DNM1 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It is involved in the biological process described with multicellular organismal development mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000002610.1.2 48698.ENSPFOP00000004076 3.8e-12 79.7 Actinopterygii SH3BP2 GO:0001784,GO:0003674,GO:0005070,GO:0005488,GO:0005515,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009987,GO:0010646,GO:0010647,GO:0017124,GO:0019904,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0030674,GO:0035591,GO:0045309,GO:0048518,GO:0048522,GO:0048583,GO:0048584,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051219,GO:0051716,GO:0060090,GO:0065007 ko:K07984 ko04650,map04650 ko00000,ko00001 Metazoa 2982H@1,2RF2Z@2759,38SIE@33154,3BBPF@33208,3CVS9@33213,488VW@7711,48YMT@7742,49RJ3@7898 NA|NA|NA T SH3-domain binding protein 2 mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000002613.1.5 144197.XP_008287825.1 8.1e-28 131.0 Actinopterygii HTR2C 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It is involved in the biological process described with regulation of developmental process mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000003479.1.3 7719.XP_009857921.1 2.7e-63 250.0 Metazoa ko:K19326 ko00000,ko03036 Metazoa 38C3M@33154,3BCXH@33208,COG5069@1,KOG0516@2759 NA|NA|NA Z cytoskeletal anchoring at nuclear membrane mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000003480.1.1 7719.XP_009861521.1 4.4e-21 108.2 Eukaryota ko:K11800 ko00000,ko04121 Eukaryota KOG3637@1,KOG3637@2759 NA|NA|NA M integrin-mediated signaling pathway mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000003484.1.1 126957.SMAR008549-PA 2e-07 61.6 Bilateria ko:K05665 ko01523,ko02010,ko04071,ko04977,ko05206,map01523,map02010,map04071,map04977,map05206 ko00000,ko00001,ko02000 3.A.1.208.8 Metazoa 38CH6@33154,3BA19@33208,3CSDY@33213,COG1132@1,KOG0054@2759 NA|NA|NA Q ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000003487.1.1 7719.XP_009859761.1 2.2e-49 202.2 Chordata ABCA5 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3.A.1.211 Metazoa 38BPG@33154,3BBB4@33208,3CSBI@33213,487YJ@7711,COG1131@1,KOG0059@2759 NA|NA|NA I ATP-binding cassette sub-family A mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000003488.2.1 6087.XP_002165941.2 1.3e-40 173.3 Metazoa OSTF1 GO:0001503,GO:0001775,GO:0002252,GO:0002263,GO:0002274,GO:0002275,GO:0002283,GO:0002366,GO:0002376,GO:0002443,GO:0002444,GO:0002446,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006810,GO:0006887,GO:0006955,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0009987,GO:0012505,GO:0016192,GO:0017124,GO:0019904,GO:0023052,GO:0030141,GO:0031410,GO:0031974,GO:0031982,GO:0031983,GO:0032501,GO:0032940,GO:0034774,GO:0036230,GO:0042119,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043233,GO:0043299,GO:0043312,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044433,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045055,GO:0045321,GO:0046903,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051716,GO:0060205,GO:0065007,GO:0070013,GO:0097708,GO:0099503,GO:0101002,GO:1904813 Metazoa 28MFX@1,2QTZB@2759,38HH2@33154,3BDYP@33208 NA|NA|NA T SH3 domain binding mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000003494.1.1 3712.Bo05753s010.1 2.3e-06 60.1 Eukaryota Eukaryota KOG0800@1,KOG0800@2759 NA|NA|NA O ubiquitin-protein transferase activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000003494.3.1 6326.BUX.s00119.39 3.2e-13 80.1 Chromadorea ko:K13108 ko00000,ko03041 Nematoda 1KVVW@119089,392I3@33154,3BCT5@33208,3CZB6@33213,40CSV@6231,KOG1882@1,KOG1882@2759,KOG3639@1,KOG3639@2759 NA|NA|NA T Forkhead associated domain mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000003498.1.1 7719.XP_009860337.1 1.8e-36 159.1 Chordata KIF26B 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oligomeric assembly and quality control in the ER via the calreticulin calnexin cycle. This lectin may interact transiently with almost all of the monoglucosylated glycoproteins that are synthesized in the ER (By similarity) mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000003599.1.1 51511.ENSCSAVP00000016769 1.5e-31 142.9 Chordata 3.2.1.14 ko:K01183 ko00520,ko01100,map00520,map01100 R01206,R02334 RC00467 ko00000,ko00001,ko01000 GH18 Metazoa 38BJK@33154,3BA7Q@33208,3CS5K@33213,4857F@7711,COG3325@1,KOG2806@2759 NA|NA|NA G endochitinase activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000003603.1.3 7719.XP_002129141.1 3.9e-67 261.2 Chordata ISY1 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The CBC complex is involved in miRNA-mediated RNA interference and is required for primary microRNAs (miRNAs) processing. Also involved in innate immunity via the short interfering RNAs (siRNAs) processing machinery by restricting the viral RNA production. In the CBC complex, Cbp20 recognizes and binds capped RNAs (m7GpppG-capped RNA) but requires Cbp80 to stabilize the movement of its N-terminal loop and lock the CBC into a high affinity cap-binding state with the cap structure mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000003954.1.2 51511.ENSCSAVP00000008022 2.6e-38 165.6 Chordata RNF24 GO:0000209,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004842,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005794,GO:0006464,GO:0006508,GO:0006511,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009057,GO:0009987,GO:0010498,GO:0012505,GO:0016567,GO:0016740,GO:0019538,GO:0019787,GO:0019941,GO:0030163,GO:0032446,GO:0036211,GO:0043161,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0043632,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044248,GO:0044257,GO:0044260,GO:0044265,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0051603,GO:0061630,GO:0061659,GO:0070647,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564,GO:1901565,GO:1901575 ko:K15699 ko00000,ko04121 Metazoa 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Mediator is recruited to promoters by direct interactions with regulatory proteins and serves as a scaffold for the assembly of a functional preinitiation complex with RNA polymerase II and the general transcription factors mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004151.1.1 1392244.V5F0M7 2.9e-21 109.8 Ustilaginomycotina LKH1 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This is a prerequisite for the S- specific NAD(P)H-hydrate dehydratase to allow the repair of both epimers of NAD(P)HX mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004437.1.1 7719.XP_002122193.1 4.7e-12 77.8 Chordata PTK7 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It is involved in the biological process described with proteolysis mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004485.1.2 7719.XP_002126969.1 1.4e-68 266.5 Eukaryota NHLRC3 GO:0000323,GO:0001775,GO:0002252,GO:0002263,GO:0002274,GO:0002275,GO:0002283,GO:0002366,GO:0002376,GO:0002443,GO:0002444,GO:0002446,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005764,GO:0005766,GO:0005773,GO:0005775,GO:0006810,GO:0006887,GO:0006955,GO:0008150,GO:0009987,GO:0012505,GO:0016192,GO:0030141,GO:0031410,GO:0031974,GO:0031982,GO:0031983,GO:0032940,GO:0034774,GO:0035578,GO:0036230,GO:0042119,GO:0042582,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0043299,GO:0043312,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044433,GO:0044437,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045055,GO:0045321,GO:0046903,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0060205,GO:0070013,GO:0097708,GO:0099503 2.3.2.27 ko:K12035 ko05206,map05206 ko00000,ko00001,ko01000,ko03019,ko04121 Eukaryota KOG2177@1,KOG2177@2759 NA|NA|NA O zinc ion binding mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004488.1.1 8364.ENSXETP00000058408 8.6e-18 98.2 Vertebrata KLHL18 GO:0000151,GO:0002009,GO:0002165,GO:0003674,GO:0003779,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006464,GO:0006807,GO:0007275,GO:0007444,GO:0007552,GO:0007560,GO:0008092,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009653,GO:0009791,GO:0009886,GO:0009887,GO:0009888,GO:0009987,GO:0016567,GO:0019538,GO:0031461,GO:0031463,GO:0032446,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032991,GO:0035239,GO:0035295,GO:0036211,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046528,GO:0046529,GO:0046983,GO:0048513,GO:0048563,GO:0048569,GO:0048707,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048856,GO:0051865,GO:0060429,GO:0060562,GO:0070647,GO:0071704,GO:1901564,GO:1902494,GO:1990234 ko:K10455 ko00000,ko04121 Metazoa 38CWG@33154,3BH03@33208,3D1IW@33213,48917@7711,48W27@7742,KOG4441@1,KOG4441@2759 NA|NA|NA T Kelch-like protein 18 mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004502.1.2 7719.XP_002124949.1 1.5e-08 67.4 Eukaryota Eukaryota KOG3656@1,KOG3656@2759 NA|NA|NA O G-protein coupled receptor activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004503.1.1 7719.XP_002122766.1 1.2e-32 146.4 Chordata plb1 3.1.1.4,3.1.1.5 ko:K14621 ko00564,ko00565,ko00590,ko00591,ko00592,ko01100,ko01110,ko04977,map00564,map00565,map00590,map00591,map00592,map01100,map01110,map04977 R01315,R01317,R02053,R02746,R02747,R03416,R03417,R07064,R07379,R07387,R07859 RC00020,RC00037,RC00041,RC00094 ko00000,ko00001,ko01000,ko04131 Metazoa 39S44@33154,3BG0H@33208,3CRAV@33213,48118@7711,KOG3670@1,KOG3670@2759 NA|NA|NA I retinyl-palmitate esterase activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004507.1.1 51511.ENSCSAVP00000005743 1.3e-40 172.9 Chordata ATP6V1C2 GO:0000003,GO:0000041,GO:0000221,GO:0000323,GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005764,GO:0005765,GO:0005773,GO:0005774,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006826,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007166,GO:0007167,GO:0007169,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007292,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008286,GO:0008324,GO:0008553,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009790,GO:0009894,GO:0009966,GO:0009967,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0010506,GO:0010646,GO:0010647,GO:0015031,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015078,GO:0015318,GO:0015399,GO:0015405,GO:0015662,GO:0015672,GO:0015682,GO:0015833,GO:0015988,GO:0015991,GO:0016020,GO:0016241,GO:0016462,GO:0016469,GO:0016471,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019222,GO:0019829,GO:0019953,GO:0022414,GO:0022804,GO:0022853,GO:0022857,GO:0022890,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023056,GO:0030001,GO:0030111,GO:0030177,GO:0030728,GO:0031090,GO:0031323,GO:0031329,GO:0031410,GO:0031982,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032868,GO:0032869,GO:0032870,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033176,GO:0033178,GO:0033180,GO:0033181,GO:0033572,GO:0034220,GO:0036442,GO:0042221,GO:0042623,GO:0042625,GO:0042626,GO:0042886,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043434,GO:0043492,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044437,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044703,GO:0044769,GO:0045177,GO:0045184,GO:0046961,GO:0046983,GO:0048518,GO:0048522,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048609,GO:0048856,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051704,GO:0051716,GO:0055085,GO:0065007,GO:0070887,GO:0071310,GO:0071375,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071702,GO:0071705,GO:0071944,GO:0072512,GO:0090662,GO:0097708,GO:0098588,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098805,GO:0098852,GO:0099131,GO:0099132,GO:1901652,GO:1901653,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1902600 ko:K02148 ko00190,ko01100,ko04145,ko04150,ko04721,ko04966,ko05110,ko05120,ko05323,map00190,map01100,map04145,map04150,map04721,map04966,map05110,map05120,map05323 M00160 ko00000,ko00001,ko00002 3.A.2.2 Metazoa 38C54@33154,3BBW4@33208,3CTY9@33213,47YWY@7711,COG5127@1,KOG2909@2759 NA|NA|NA C Subunit of the peripheral V1 complex of vacuolar ATPase. Subunit C is necessary for the assembly of the catalytic sector of the enzyme and is likely to have a specific function in its catalytic activity. V-ATPase is responsible for acidifying a variety of intracellular compartments in eukaryotic cells mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004508.1.1 45351.EDO42992 1.3e-12 81.3 Metazoa ko:K10443 ko00000,ko04121 Metazoa 38FPI@33154,3BB3K@33208,KOG4441@1,KOG4441@2759 NA|NA|NA T distal tubule morphogenesis mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004517.2.5 7719.XP_009859967.1 5.8e-21 107.8 Chordata GRIPAP1 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70.5 Bilateria Metazoa 38BUP@33154,3BA2W@33208,3CUNH@33213,KOG1217@1,KOG1217@2759,KOG3649@1,KOG3649@2759 NA|NA|NA T sequestering of TGFbeta in extracellular matrix mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004626.2.1 45351.EDO42992 4.1e-14 86.7 Metazoa ko:K10443 ko00000,ko04121 Metazoa 38FPI@33154,3BB3K@33208,KOG4441@1,KOG4441@2759 NA|NA|NA T distal tubule morphogenesis mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004630.1.1 9978.XP_004581752.1 5.7e-14 85.9 Euarchontoglires KBTBD12 GO:0000151,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0031461,GO:0031463,GO:0032991,GO:0044424,GO:0044464,GO:1902494,GO:1990234 ko:K21912 ko00000,ko04121 Mammalia 3597C@314146,39R2B@33154,3BCNA@33208,3CVVH@33213,3JEY6@40674,480U1@7711,490I3@7742,KOG4441@1,KOG4441@2759 NA|NA|NA T Kelch repeat and BTB mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004632.1.1 7994.ENSAMXP00000016275 5.4e-08 64.3 Actinopterygii GLCCI1 GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0044424,GO:0044464 Metazoa 2CB6W@1,2QRQF@2759,38I5D@33154,3BKSC@33208,3CYNJ@33213,486G9@7711,497SV@7742,49WFQ@7898 NA|NA|NA S transcript 1 mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004636.1.1 27923.ML06223a-PA 3.5e-08 64.3 Metazoa Metazoa 2AI1Z@1,2RZ3S@2759,3A87B@33154,3BV9Z@33208 NA|NA|NA mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004637.1.1 10224.XP_006820380.1 2.2e-30 139.4 Bilateria CFAP46 GO:0000226,GO:0001539,GO:0001578,GO:0003341,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005856,GO:0005929,GO:0005930,GO:0006928,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007017,GO:0007018,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0022607,GO:0030030,GO:0030031,GO:0032838,GO:0035082,GO:0040011,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044085,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044441,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044782,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0060271,GO:0060285,GO:0060294,GO:0070925,GO:0071840,GO:0097014,GO:0099568,GO:0120025,GO:0120031,GO:0120036,GO:0120038 ko:K18626 ko00000,ko04812 Metazoa 2C6EK@1,2QS2Z@2759,38GQR@33154,3BDJD@33208,3CYCN@33213 NA|NA|NA S Cilia and flagella associated protein 46 mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004644.1.1 51511.ENSCSAVP00000019185 3.5e-60 238.8 Chordata MMADHC GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005829,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006766,GO:0006767,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009108,GO:0009235,GO:0009987,GO:0017144,GO:0033013,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044237,GO:0044249,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051186,GO:0051188,GO:0071704,GO:1901360,GO:1901564 Metazoa 38DZK@33154,3BISY@33208,3CVP8@33213,480FG@7711,KOG3994@1,KOG3994@2759 NA|NA|NA S Methylmalonic aciduria and homocystinuria type D mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004645.1.1 51511.ENSCSAVP00000003778 4.1e-23 116.3 Chordata Metazoa 2EYW2@1,2T0AY@2759,3ASDI@33154,3C3CC@33208,3DKQB@33213,48MIM@7711 NA|NA|NA S Death domain mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004645.5.2 51511.ENSCSAVP00000002743 2.5e-167 595.9 Chordata INTS4 GO:0000428,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006366,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009301,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016073,GO:0016180,GO:0016591,GO:0018130,GO:0019438,GO:0030880,GO:0031123,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032039,GO:0032774,GO:0032991,GO:0034470,GO:0034472,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0034660,GO:0042795,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0043628,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044451,GO:0044464,GO:0046483,GO:0055029,GO:0061695,GO:0070013,GO:0071704,GO:0090304,GO:0097659,GO:0098781,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576,GO:1902494,GO:1990234 ko:K13141 ko00000,ko03041 Metazoa 38GR0@33154,3BFYF@33208,3CUUR@33213,486YQ@7711,KOG2259@1,KOG2259@2759 NA|NA|NA S integrator complex subunit 4 mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004652.1.1 7425.NV22809-PA 3.5e-11 76.3 Insecta Arthropoda 38CWG@33154,3BH03@33208,3D1IW@33213,3SH7V@50557,41XID@6656,KOG4441@1,KOG4441@2759 NA|NA|NA T Kelch motif mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000004653.2.1 7719.XP_004227296.2 2.1e-17 94.7 Chordata BIRC2 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2.3.1.108 ko:K19573 ko00000,ko01000,ko03036 Metazoa 38HFT@33154,3BGSF@33208,3CUW2@33213,47YTU@7711,KOG4601@1,KOG4601@2759 NA|NA|NA I this activity may be independent of acetylation activity. 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ko00000,ko01000,ko04121,ko04131 Viridiplantae 37WV3@33090,3GKU8@35493,3IJRS@38820,3M83F@4447,KOG0800@1,KOG0800@2759 NA|NA|NA O RING-like zinc finger mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000005450.3.1 13735.ENSPSIP00000000104 5.9e-19 100.5 Testudines ko:K04257 ko04740,map04740 ko00000,ko00001,ko04030 Metazoa 39TZY@33154,3BI15@33208,3CYKV@33213,487I3@7711,4962T@7742,4CKCN@8459,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA S Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000005455.1.1 7719.XP_002123965.2 1.1e-16 93.6 Chordata FAM65A 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2.3.2.27 ko:K11982 ko00000,ko01000,ko04121,ko04131 Metazoa 38F90@33154,3BCP6@33208,3D2EB@33213,48BPD@7711,495PY@7742,49XGT@7898,KOG0800@1,KOG0800@2759 NA|NA|NA O E3 ubiquitin-protein ligase mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000005457.1.1 7668.SPU_024039-tr 4.3e-09 68.2 Bilateria LIX1L GO:0002009,GO:0002165,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005911,GO:0006914,GO:0007275,GO:0007444,GO:0007472,GO:0007476,GO:0007552,GO:0007560,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009653,GO:0009791,GO:0009886,GO:0009887,GO:0009888,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016236,GO:0022411,GO:0030054,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032984,GO:0032991,GO:0035003,GO:0035107,GO:0035114,GO:0035120,GO:0035220,GO:0035239,GO:0035295,GO:0043296,GO:0043933,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0048513,GO:0048563,GO:0048569,GO:0048707,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048736,GO:0048737,GO:0048856,GO:0060429,GO:0060562,GO:0061919,GO:0071840,GO:0071944,GO:0097352,GO:0098796,GO:0098797 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M16 family mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000005664.3.1 7719.XP_002123260.1 2.7e-57 229.6 Chordata PRIMPOL 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Metazoa 28JNI@1,2QS1Q@2759,38DPV@33154,3BFKS@33208,3CS66@33213,485ER@7711 NA|NA|NA S DNA primase activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000005667.2.4 7719.XP_009859320.1 3.1e-11 75.1 Chordata NADK2 GO:0003674,GO:0003824,GO:0003951,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005759,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009117,GO:0009987,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0019362,GO:0019637,GO:0019674,GO:0031974,GO:0034641,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044429,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046496,GO:0046983,GO:0051186,GO:0055086,GO:0070013,GO:0071704,GO:0072524,GO:1901360,GO:1901564 2.7.1.23 ko:K00858 ko00760,ko01100,map00760,map01100 R00104 RC00002,RC00078 ko00000,ko00001,ko01000 Metazoa 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Crucial regulator of the mitotic cell cycle and development. Required for the correct dynein-dynactin perinuclear localization important for nucleus-centrosome coupling that occur upon meiotic progression of primary spermatocytes. Crucial regulator of the mitotic cell cycle and development. Plays a role in sperm motility and fertility. May have a role in the PNG PLU GNU pathway (By similarity) mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000006669.1.1 400682.PAC_15703241 3.7e-11 74.3 Metazoa Metazoa 38HJW@33154,3BCG5@33208,KOG3105@1,KOG3105@2759 NA|NA|NA BD Jerky protein mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000006670.1.2 51511.ENSCSAVP00000010642 2.5e-53 215.7 Chordata SLC2A8 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The scissile phosphodiester is attacked by the catalytic tyrosine of the enzyme, resulting in the formation of a DNA-(5'-phosphotyrosyl)-enzyme intermediate and the expulsion of a 3'-OH DNA strand mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000007826.1.1 6087.XP_004212682.1 1.5e-09 68.6 Metazoa Metazoa 3AK06@33154,3BZV1@33208,COG2801@1,KOG0017@2759 NA|NA|NA L Integrase core domain mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000007831.1.5 10224.XP_002741156.1 5.2e-83 314.3 Bilateria PFAS 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Involved in centrosome migration to the apical cell surface during early ciliogenesis. Required for ciliary structure and function, including a role in regulating length and appropriate number through modulating centrosome duplication. Required for cell branching morphology. Essential for endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) of surfactant protein C (sftpc) mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000008376.1.1 51511.ENSCSAVP00000012337 2e-13 80.9 Chordata PRKAR1A 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which is converted to ADP. Together with NAD(P)HX epimerase, which catalyzes the epimerization of the S- and R-forms, the enzyme allows the repair of both epimers of NAD(P)HX, a damaged form of NAD(P)H that is a result of enzymatic or heat-dependent hydration mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000008615.1.1 6087.XP_002165941.2 1.3e-10 72.8 Metazoa OSTF1 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May also have a chaperone function in the assembly of inner membrane protein complexes. Participates in the regulation of mitochondrial gene expression and in the maintenance of the integrity of the mitochondrial genome. 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). Can use both ATP or inorganic polyphosphate as the phosphoryl donor mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000009866.1.1 7029.ACYPI39586-PA 4.6e-17 94.4 Bilateria Metazoa 2CYJA@1,2S4S7@2759,3A62Z@33154,3BTAY@33208,3E403@33213 NA|NA|NA S MULE transposase domain mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000009869.3.1 27923.ML31986a-PA 8.3e-08 63.2 Opisthokonta Opisthokonta 2D72K@1,2T3ZC@2759,3AA4C@33154 NA|NA|NA mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000009872.1.1 51511.ENSCSAVP00000012892 8.1e-17 93.6 Chordata Metazoa 28H96@1,2QPMV@2759,39RYA@33154,3BKE5@33208,3CTFU@33213,487ZQ@7711 NA|NA|NA S Domain present in PSD-95, Dlg, and ZO-1/2. mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000009876.1.1 8364.ENSXETP00000032422 8.9e-15 87.0 Vertebrata FAM65B 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neurotransmitter release, gene expression, cell motility, cell division and cell death. The isoform alpha-1C gives rise to L-type calcium currents. Long-lasting (L-type) calcium channels belong to the 'high-voltage activated' (HVA) group. They are blocked by dihydropyridines (DHP), phenylalkylamines, benzothiazepines, and by omega-agatoxin-IIIA (omega-Aga-IIIA). They are however insensitive to omega-conotoxin- GVIA (omega-CTx-GVIA) and omega-agatoxin-IVA (omega-Aga-IVA). Calcium channels containing the alpha-1C subunit play an important role in excitation-contraction coupling in the heart. Binding of calmodulin or CABP1 at the same regulatory sites results in an opposit effects on the channel function mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000010925.1.1 8479.XP_008166973.1 6.4e-26 124.0 Testudines SVEP1 GO:0003674,GO:0003682,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005576 ko:K17495 ko00000,ko01009 Metazoa 38B50@33154,3BCEG@33208,3CRUF@33213,489FW@7711,4955D@7742,4CDHU@8459,KOG1217@1,KOG1217@2759,KOG4297@1,KOG4297@2759 NA|NA|NA T HYR domain mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000010926.1.1 7739.XP_002603048.1 8.7e-63 246.5 Chordata SIRT1 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The reaction takes place in the presence of glutamine and ATP through an activated gamma-phospho-Glu- tRNA(Gln) mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000012198.9.4 7719.XP_009862143.1 3.3e-30 140.6 Chordata KDM5A 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ko00000,ko00001,ko01000,ko01003 GT49,GT8 Arthropoda 38GQG@33154,3BB4S@33208,3CTYH@33213,3SFRK@50557,41TDQ@6656,4476B@7088,KOG3765@1,KOG3765@2759 NA|NA|NA G Glycosyl-transferase for dystroglycan mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000012793.1.1 1121428.DESHY_120029___1 3.5e-52 211.5 Peptococcaceae lon 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that mediates the selective degradation of mutant and abnormal proteins as well as certain short-lived regulatory proteins. Required for cellular homeostasis and for survival from DNA damage and developmental changes induced by stress. Degrades polypeptides processively to yield small peptide fragments that are 5 to 10 amino acids long. Binds to DNA in a double-stranded, site-specific manner mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000012794.1.1 181119.XP_005528253.1 7.4e-69 266.9 Aves CSNK2A2 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Complex I functions in the transfer of electrons from NADH to the respiratory chain. 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It is involved in the biological process described with transmembrane transport mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000013360.1.2 6500.XP_005089198.1 7.7e-139 501.1 Bilateria Metazoa 28JXF@1,2QSBS@2759,39RXE@33154,3BMGQ@33208,3D04W@33213 NA|NA|NA mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000013362.1.5 52644.XP_010580133.1 2.6e-59 235.7 Aves TMEM181 GO:0003674,GO:0005488,GO:0008150,GO:0009405,GO:0015643,GO:0044419,GO:0051704 Metazoa 28HK3@1,2QPXU@2759,38HV8@33154,3B96D@33208,3CXR3@33213,485KP@7711,48VN5@7742,4GJJH@8782 NA|NA|NA S Transmembrane protein 181 mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000013365.1.1 7719.XP_009860162.1 5.4e-50 205.3 Bilateria Metazoa 38CC3@33154,3BCC2@33208,3CZ7Q@33213,KOG1215@1,KOG1215@2759,KOG2087@1,KOG2087@2759 NA|NA|NA T G-protein coupled receptor activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000013366.1.1 7719.XP_002128293.1 1.5e-25 121.7 Chordata CTSH 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This protein may mediate formation of the complex between cytochromes c and c1 mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000013381.1.1 7719.XP_002121367.1 7.7e-113 414.1 Chordata SLC5A8 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Required for maturation of extramitochondrial Fe-S proteins. The NUBP1-NUBP2 heterotetramer forms a Fe-S scaffold complex, mediating the de novo assembly of an Fe-S cluster and its transfer to target apoproteins mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000013740.1.1 400682.PAC_15720411 1.2e-13 84.0 Metazoa ko:K17495 ko00000,ko01009 Metazoa 38B50@33154,3BCEG@33208,KOG4297@1,KOG4297@2759 NA|NA|NA TV complement activation, classical pathway mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000013743.1.1 34373.CCU74280 5e-07 61.6 Leotiomycetes 2.3.2.27 ko:K11982 ko00000,ko01000,ko04121,ko04131 Fungi 20ZEH@147548,39XEI@33154,3P1HX@4751,3QQV8@4890,KOG0800@1,KOG0800@2759 NA|NA|NA O RING-like zinc finger mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000013745.1.3 7719.XP_009862371.1 1.9e-39 168.7 Chordata CASK 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Catalyzes the first two steps of cap formation by removing the gamma-phosphate from the 5'-triphosphate end of nascent mRNA to yield a diphosphate end, and by transferring the gmp moiety of GTP to the 5'-diphosphate terminus mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000013900.1.1 27923.ML06223a-PA 4.9e-07 60.5 Metazoa Metazoa 2AI1Z@1,2RZ3S@2759,3A87B@33154,3BV9Z@33208 NA|NA|NA mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000013906.1.2 7370.XP_005176977.1 1.6e-39 169.9 Diptera GO:0000003,GO:0000981,GO:0001654,GO:0001744,GO:0001745,GO:0001746,GO:0002009,GO:0002165,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003700,GO:0003705,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0006355,GO:0006357,GO:0006928,GO:0007275,GO:0007276,GO:0007283,GO:0007399,GO:0007423,GO:0007444,GO:0007455,GO:0007552,GO:0007560,GO:0007623,GO:0008134,GO:0008150,GO:0008347,GO:0009605,GO:0009649,GO:0009653,GO:0009791,GO:0009886,GO:0009887,GO:0009888,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016477,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019953,GO:0022008,GO:0022414,GO:0030154,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0035214,GO:0035239,GO:0035270,GO:0035271,GO:0035295,GO:0040011,GO:0042063,GO:0042752,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043565,GO:0044424,GO:0044464,GO:0044703,GO:0045893,GO:0045935,GO:0045944,GO:0048232,GO:0048511,GO:0048513,GO:0048518,GO:0048522,GO:0048563,GO:0048569,GO:0048592,GO:0048609,GO:0048646,GO:0048707,GO:0048729,GO:0048731,GO:0048732,GO:0048749,GO:0048856,GO:0048869,GO:0048870,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051179,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051674,GO:0051704,GO:0055034,GO:0060255,GO:0060429,GO:0060562,GO:0060788,GO:0065007,GO:0071696,GO:0071697,GO:0080090,GO:0090596,GO:0097159,GO:0140110,GO:1901363,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:2000112,GO:2001141 ko:K15614,ko:K19472 ko05202,map05202 ko00000,ko00001,ko03000 Arthropoda 38CWW@33154,3BENU@33208,3CVHT@33213,3SJ71@50557,41VQK@6656,44YYS@7147,KOG0775@1,KOG0775@2759 NA|NA|NA K Sequence-specific DNA binding. It is involved in the biological process described with regulation of transcription, DNA-templated mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000013910.1.2 7739.XP_002604716.1 4.1e-58 232.6 Chordata ko:K06560 ko04145,ko05152,map04145,map05152 ko00000,ko00001,ko04090,ko04091,ko04131 Metazoa 38GR9@33154,3BBE1@33208,3CTZ0@33213,4803E@7711,KOG4297@1,KOG4297@2759,KOG4729@1,KOG4729@2759 NA|NA|NA TV mannose binding mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000013912.1.1 81824.XP_001748181.1 2.2e-09 69.7 Opisthokonta YWHAB 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2.3.1.199 ko:K10203 ko00062,ko01040,ko01110,ko01212,map00062,map01040,map01110,map01212 M00415 R07758,R07762,R09419,R10825 RC00004,RC00039,RC02728,RC02888,RC02997 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 Metazoa 38H3H@33154,3BGKB@33208,3D0ZP@33213,KOG3071@1,KOG3072@2759 NA|NA|NA I Catalyzes the first and rate-limiting reaction of the four that constitute the long-chain fatty acids elongation cycle. This endoplasmic reticulum-bound enzymatic process, allows the addition of 2 carbons to the chain of long- and very long-chain fatty acids VLCFAs per cycle. Condensing enzyme that elongates fatty acids with 12, 14 and 16 carbons with higher activity toward C16 0 acyl-CoAs. Catalyzes the synthesis of unsaturated C16 long chain fatty acids and, to a lesser extent, C18 0 and those with low desaturation degree. May participate to the production of saturated and monounsaturated VLCFAs of different chain lengths that are involved in multiple biological processes as precursors of membrane lipids and lipid mediators mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000013941.1.3 7994.ENSAMXP00000001049 2.4e-48 199.1 Actinopterygii PIM3 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Methyltransferase required for the conversion of 2- polyprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol (DDMQH2) to 2-polyprenyl-3- methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol (DMQH2) mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015077.1.1 7719.XP_009860152.1 2.3e-36 157.9 Chordata hecd-1 GO:0007044,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0022607,GO:0031581,GO:0034329,GO:0034330,GO:0044085,GO:0071840 2.3.2.26 ko:K12231 ko00000,ko01000,ko04121 Metazoa 39M9X@33154,3B97M@33208,3CXRM@33213,484BS@7711,COG5021@1,KOG4276@2759 NA|NA|NA O HECT domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015098.1.1 31234.CRE00758 2.4e-10 71.6 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015108.1.3 7719.XP_009859264.1 1.2e-89 337.0 Chordata XPC 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ko:K10838 ko03420,map03420 ko00000,ko00001,ko03400 Metazoa 38BBG@33154,3BEHR@33208,3CT44@33213,485R2@7711,COG5535@1,KOG2179@2759 NA|NA|NA L UV-damage excision repair mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015114.4.1 10042.XP_006992233.1 3.1e-12 78.2 Rodentia AVL9 GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005768,GO:0006928,GO:0008150,GO:0009987,GO:0012505,GO:0016477,GO:0031410,GO:0031982,GO:0040011,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0055037,GO:0097708 Mammalia 35GJT@314146,39R4P@33154,3BCIS@33208,3CWGE@33213,3J2DF@40674,487XA@7711,48Z1F@7742,4Q4CF@9989,KOG3823@1,KOG3823@2759 NA|NA|NA S Uncharacterized conserved protein (DUF2347) mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015117.1.1 7719.XP_002130444.1 5.2e-32 144.1 Bilateria Metazoa 2RXWD@2759,3A8EK@33154,3C23A@33208,3DI4Y@33213,COG0589@1 NA|NA|NA T Universal stress protein family mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015120.1.1 10224.XP_002742123.1 1.2e-11 76.6 Bilateria IFRD1 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Metazoa 38EW2@33154,3B9K5@33208,3CYQ8@33213,KOG2842@1,KOG2842@2759 NA|NA|NA Z Interferon-related developmental regulator mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015123.1.2 12957.ACEP21357-PA 1.6e-25 122.5 Hymenoptera GO:0005575,GO:0006464,GO:0006486,GO:0006487,GO:0006488,GO:0006490,GO:0006629,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009100,GO:0009101,GO:0009987,GO:0016020,GO:0016021,GO:0019538,GO:0031224,GO:0034645,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0043413,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044255,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044425,GO:0070085,GO:0071704,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 ko:K09660 ko00000,ko01003 Arthropoda 38E44@33154,3BJGB@33208,3CUU0@33213,3SFTG@50557,41XKW@6656,46HMY@7399,KOG3211@1,KOG3211@2759 NA|NA|NA S Repeated motif present between transmembrane helices in cystinosin, yeast ERS1p, mannose-P-dolichol utilization defect 1, and other hypothetical proteins. mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015126.1.1 6087.XP_004208188.1 3.1e-08 64.7 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133.7 Bilateria GSTD6 2.5.1.18 ko:K00799 ko00480,ko00980,ko00982,ko00983,ko01524,ko05200,ko05204,ko05225,ko05418,map00480,map00980,map00982,map00983,map01524,map05200,map05204,map05225,map05418 R03522,R07002,R07003,R07004,R07023,R07024,R07025,R07026,R07069,R07070,R07083,R07084,R07091,R07092,R07093,R07094,R07100,R07113,R07116,R08280,R09409,R11905 RC00004,RC00069,RC00840,RC00948,RC01704,RC01705,RC01706,RC01758,RC01759,RC01765,RC01767,RC01769,RC02243,RC02527,RC02939,RC02940,RC02942,RC02943,RC02944 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000 1.A.12.2.2,1.A.12.3.2 Metazoa 3A046@33154,3BQ1T@33208,3D6RP@33213,COG0625@1,KOG0867@2759 NA|NA|NA O glutathione transferase activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015144.1.1 43151.ADAC009216-PA 2.7e-23 115.2 Nematocera 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It is involved in the biological process described with ubiquitin-dependent protein catabolic process mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015933.1.1 7719.XP_009857919.1 4.6e-13 81.3 Bilateria Metazoa 3AAQY@33154,3BV79@33208,3D9Y8@33213,COG5069@1,KOG0516@2759 NA|NA|NA Z Spectrin repeats mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015947.1.1 32264.tetur36g01170.1 1.3e-06 60.5 Bilateria Metazoa 38VH9@33154,3C5S7@33208,3DCI5@33213,KOG1911@1,KOG1911@2759 NA|NA|NA B Chromatin organization modifier domain mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015949.1.1 7719.XP_002126157.1 6.2e-33 146.4 Chordata RAP2C 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28MAY@1,2QTUD@2759,39RAY@33154,3BC0H@33208,3D0IM@33213,482WA@7711 NA|NA|NA S regulation of modification of synaptic structure mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015954.1.1 7719.XP_002124366.1 1.8e-121 443.4 Chordata ko:K04601 ko00000,ko04030,ko04516 Metazoa 38E9P@33154,3BB9S@33208,3CRQ5@33213,486TY@7711,KOG3594@1,KOG4289@2759 NA|NA|NA T protein localization involved in establishment of planar polarity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015958.1.3 7719.XP_002123030.2 2.2e-144 518.8 Chordata ko:K10447 ko04120,map04120 ko00000,ko00001,ko04121 Metazoa 38GZ8@33154,3BCJV@33208,3CR80@33213,481F0@7711,KOG4441@1,KOG4441@2759 NA|NA|NA T kelch-like mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015960.1.1 7719.XP_009861852.1 4.5e-34 150.6 Chordata DEPDC5 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mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000015962.1.1 51511.ENSCSAVP00000015324 1.6e-35 156.0 Chordata COPZ1 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This channel gives rise to T-type calcium currents. T-type calcium channels belong to the low-voltage activated (LVA) group and are strongly blocked by nickel and mibefradil. A particularity of this type of channels is an opening at quite negative potentials, and a voltage- dependent inactivation. T-type channels serve pacemaking functions in both central neurons and cardiac nodal cells and support calcium signaling in secretory cells and vascular smooth muscle. They may also be involved in the modulation of firing patterns of neurons which is important for information processing as well as in cell growth processes mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000016014.1.1 7719.XP_002131753.1 1e-56 226.9 Chordata WRN 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It is involved in the biological process described with chitin metabolic process mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000016054.1.1 5932.XP_004035295.1 3.2e-10 72.4 Ciliophora Eukaryota 3ZEPV@5878,KOG0800@1,KOG0800@2759 NA|NA|NA O RING-like zinc finger mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000016054.3.1 51511.ENSCSAVP00000016212 1.4e-10 72.0 Chordata C12orf29 GO:0002244,GO:0002376,GO:0002520,GO:0007275,GO:0008150,GO:0009987,GO:0030097,GO:0030154,GO:0032501,GO:0032502,GO:0048513,GO:0048534,GO:0048731,GO:0048856,GO:0048869 Metazoa 28PPN@1,2QWBV@2759,39SS2@33154,3BGYK@33208,3CW16@33213,482WC@7711 NA|NA|NA S hematopoietic progenitor cell differentiation mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000016067.1.1 7719.XP_004225805.1 3.3e-57 229.2 Chordata ARID2 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Adaptor protein complexes function in protein transport via transport vesicles in different membrane traffic pathways. Adaptor protein complexes are vesicle coat components and appear to be involved in cargo selection and vesicle formation. AP-2 is involved in clathrin-dependent endocytosis in which cargo proteins are incorporated into vesicles surrounded by clathrin (clathrin- coated vesicles, CCVs) which are destined for fusion with the early endosome. The clathrin lattice serves as a mechanical scaffold but is itself unable to bind directly to membrane components. Clathrin-associated adaptor protein (AP) complexes which can bind directly to both the clathrin lattice and to the lipid and protein components of membranes are considered to be the major clathrin adaptors contributing the CCV formation. AP-2 also serves as a cargo receptor to selectively sort the membrane proteins involved in receptor-mediated endocytosis. AP-2 seems to play a role in the recycling of synaptic vesicle membranes from the presynaptic surface. AP-2 recognizes Y-X-X- FILMV (Y-X-X-Phi) and ED -X-X-X-L- LI endocytosis signal motifs within the cytosolic tails of transmembrane cargo molecules. AP-2 may also play a role in maintaining normal post-endocytic trafficking through the ARF6-regulated, non-clathrin pathway. The AP-2 alpha subunit binds polyphosphoinositide-containing lipids, positioning AP-2 on the membrane. The AP-2 alpha subunit acts via its C- terminal appendage domain as a scaffolding platform for endocytic accessory proteins. The AP-2 alpha and AP-2 sigma subunits are thought to contribute to the recognition of the ED -X-X-X-L- LI motif mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000016602.1.1 7719.XP_009858744.1 7.3e-09 66.6 Eukaryota 3.1.3.8 ko:K01083 ko00562,map00562 R03371 RC00078 ko00000,ko00001,ko01000 Eukaryota KOG1225@1,KOG1225@2759 NA|NA|NA L regulation of canonical Wnt signaling pathway involved in osteoblast differentiation mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000016609.1.1 51511.ENSCSAVP00000002440 7.6e-22 110.2 Chordata DDX24 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When covalently bound, it is conjugated to target proteins via an isopeptide bond either as a monomer (monoubiquitin), a polymer linked via different Lys residues of the ubiquitin (polyubiquitin chains) or a linear polymer linked via the initiator Met of the ubiquitin (linear polyubiquitin chains). Polyubiquitin chains, when attached to a target protein, have different functions depending on the Lys residue of the ubiquitin that is linked Lys-6-linked may be involved in DNA repair mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000016759.1.1 7719.XP_004226631.2 1.7e-31 142.9 Metazoa Metazoa 38CCC@33154,3BHHK@33208,KOG2287@1,KOG2287@2759 NA|NA|NA G galactosyltransferase activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000016761.1.1 51511.ENSCSAVP00000007785 1.9e-18 98.2 Chordata GSR 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Deubiquitination of histone H2A is a prerequisite for subsequent phosphorylation at 'Ser-11' of histone H3 (H3S10ph), and is required for chromosome segregation when cells enter into mitosis. In resting B- and T- lymphocytes, phosphorylation by AURKB leads to enhance its activity, thereby maintaining transcription in resting lymphocytes. Regulates Hox gene expression via histone H2A deubiquitination. Prefers nucleosomal substrates. Does not deubiquitinate histone H2B mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000017127.1.1 7719.XP_002131418.1 5e-26 124.0 Chordata PCMT1 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the initiation of protein synthesis. 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The eIF-3 complex specifically targets and initiates translation of a subset of mRNAs involved in cell proliferation, including cell cycling, differentiation and apoptosis, and uses different modes of RNA stem-loop binding to exert either translational activation or repression mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000017270.1.2 51511.ENSCSAVP00000019072 1.5e-12 80.9 Chordata ko:K19013 ko00000,ko00536 Metazoa 38CGW@33154,3BEXX@33208,3CV8Y@33213,47Z98@7711,KOG1218@1,KOG1218@2759 NA|NA|NA T low-density lipoprotein particle receptor activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000017271.1.1 7739.XP_002606978.1 6.6e-08 63.9 Chordata ko:K10450 ko00000,ko04121 Metazoa 38PKY@33154,3BFCS@33208,3CSAR@33213,482W5@7711,KOG4441@1,KOG4441@2759 NA|NA|NA T neural crest formation mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000017272.1.2 10228.TriadP50976 2.5e-27 128.6 Metazoa ZFAND2B 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ko:K12581 ko03018,map03018 ko00000,ko00001,ko03019 Eukaryota COG5228@1,KOG0304@2759 NA|NA|NA A exonucleolytic nuclear-transcribed mRNA catabolic process involved in deadenylation-dependent decay mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000017848.1.1 7719.XP_009860162.1 1.7e-24 120.2 Bilateria Metazoa 38CC3@33154,3BCC2@33208,3CZ7Q@33213,KOG1215@1,KOG1215@2759,KOG2087@1,KOG2087@2759 NA|NA|NA T G-protein coupled receptor activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000017850.5.4 7719.XP_002125762.1 1.2e-273 949.1 Chordata HID1 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Metazoa 38DJJ@33154,3BGP5@33208,3CXYF@33213,47ZU1@7711,KOG2226@1,KOG2226@2759 NA|NA|NA S response to brefeldin A mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000017853.1.1 7955.ENSDARP00000022896 4.2e-22 110.5 Actinopterygii GCHFR 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It is involved in the biological process described with ATP synthesis coupled proton transport mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000017855.1.1 7719.XP_009861381.1 9.1e-10 71.6 Chordata TONSL 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Recognizes and binds to the DNA sequence 5'-GCG(T G)GGGCG-3'(EGR-site) in the promoter region of target genes. Binds double-stranded target DNA, irrespective of the cytosine methylation status. Regulates the transcription of numerous target genes, and thereby plays an important role in regulating the response to growth factors, DNA damage, and ischemia. Plays a role in the regulation of cell survival, proliferation and cell death mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000018025.2.1 51511.ENSCSAVP00000000863 2.6e-119 436.0 Chordata PICALM 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It is involved in the biological process described with carbohydrate metabolic process mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000018259.1.1 7719.XP_002119502.1 1.6e-07 61.6 Chordata PPM1G GO:0003674,GO:0003824,GO:0004721,GO:0004722,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0006464,GO:0006470,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0007049,GO:0007050,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0016791,GO:0019538,GO:0022402,GO:0031974,GO:0031981,GO:0035970,GO:0036211,GO:0042578,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045786,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051726,GO:0065007,GO:0070013,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 3.1.3.16 ko:K17499 ko00000,ko01000,ko01009 Metazoa 38CQG@33154,3B9BA@33208,3CY5N@33213,481MX@7711,COG0631@1,KOG0699@2759 NA|NA|NA T protein serine/threonine phosphatase activity 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It is involved in the biological process described with metabolic process mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000018661.2.3 51511.ENSCSAVP00000016306 4.5e-66 258.1 Chordata SFXN2 Metazoa 38FD4@33154,3B9EI@33208,3CZKI@33213,4881M@7711,KOG3767@1,KOG3767@2759 NA|NA|NA S iron ion homeostasis mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000018662.1.1 51511.ENSCSAVP00000011877 5.8e-24 119.4 Chordata anxa13 ko:K17099 ko00000,ko04147 1.A.31 Metazoa 38DK0@33154,3BDIV@33208,3CYDF@33213,48APB@7711,KOG0819@1,KOG0819@2759 NA|NA|NA U positive regulation of Golgi to plasma membrane protein transport mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000018663.1.33 7719.XP_002127725.1 3.5e-87 329.7 Chordata GO:0000375,GO:0000377,GO:0000398,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006397,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008380,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016071,GO:0034641,GO:0043170,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:1901360 ko:K12824 ko03040,ko04212,map03040,map04212 ko00000,ko00001,ko03041 Metazoa 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It is involved in the biological process described with small GTPase mediated signal transduction mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000018704.1.1 51511.ENSCSAVP00000003721 1.2e-61 242.7 Chordata KDELC1 GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005783,GO:0005788,GO:0006629,GO:0006643,GO:0006664,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0012505,GO:0016740,GO:0016757,GO:0016758,GO:0031974,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044255,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044432,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046527,GO:0070013,GO:0071704,GO:1901135,GO:1903509 Metazoa 38DMY@33154,3BC6Z@33208,3CV80@33213,4860D@7711,KOG2458@1,KOG2458@2759 NA|NA|NA S KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 1 mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000018711.1.1 8128.ENSONIP00000026565 5.5e-17 94.4 Vertebrata Metazoa 39Y6T@33154,3BEGN@33208,3CZ7K@33213,48DPU@7711,49A9G@7742,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA S Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) 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ko:K20402 ko04140,ko04150,map04140,map04150 ko00000,ko00001,ko04131 Eukaryota KOG3529@1,KOG3529@2759 NA|NA|NA O actin binding mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000018723.1.11 121225.PHUM284050-PA 5e-29 135.6 Paraneoptera Arthropoda 38E1N@33154,3BAXS@33208,3CSDF@33213,3E8YE@33342,3SJ87@50557,41WK3@6656,COG0554@1,KOG0732@2759 NA|NA|NA O ATPase family associated with various cellular activities (AAA) mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000018725.5.1 7029.ACYPI061278-PA 9.5e-08 62.4 Bilateria Metazoa 28ZQM@1,2R6J9@2759,39SUH@33154,3BF4U@33208,3D3MP@33213 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4371) mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000018726.1.2 51511.ENSCSAVP00000016631 2e-53 215.3 Chordata VILL 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ko:K05761,ko:K08017 ko00000,ko04812 Metazoa 38BDF@33154,3B9RZ@33208,3CXQR@33213,4865S@7711,KOG0443@1,KOG0443@2759 NA|NA|NA Z cytoplasmic actin-based contraction involved in cell motility mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000018729.2.1 7719.XP_002127646.1 2e-19 102.4 Chordata IMMP1L 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ko:K11341 ko00000,ko03036 Metazoa 38HA6@33154,3BCH1@33208,3CRFC@33213,COG5033@1,KOG3149@2759 NA|NA|NA K chromatin organization mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000019448.1.1 7719.XP_002132114.1 7.1e-20 103.2 Chordata DHRS12 ko:K11168 ko00000,ko01000 Metazoa 38GDU@33154,3BEJT@33208,3CXNV@33213,486WC@7711,COG1028@1,KOG1208@2759 NA|NA|NA Q oxidoreductase activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000019453.1.1 8010.XP_010889736.1 3.5e-25 121.3 Actinopterygii SNRPC 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39W5M@33154,3BSPY@33208,3CRWZ@33213,487N7@7711,48XAM@7742,4A1AF@7898,COG5136@1,KOG3454@2759 NA|NA|NA A Component of the spliceosomal U1 snRNP, which is essential for recognition of the pre-mRNA 5' splice-site and the subsequent assembly of the spliceosome. snrpc U1-C is directly involved in initial 5' splice-site recognition for both constitutive and regulated alternative splicing. The interaction with the 5' splice-site seems to precede base-pairing between the pre-mRNA and the U1 snRNA. Stimulates commitment or early (E) complex formation by stabilizing the base pairing of the 5' end of the U1 snRNA and the 5' splice-site region mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000019454.1.6 7739.XP_002597202.1 1.6e-41 177.2 Chordata BTBD17 GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0008150,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009615,GO:0016020,GO:0043207,GO:0043900,GO:0043901,GO:0043903,GO:0044464,GO:0045069,GO:0045071,GO:0048519,GO:0048525,GO:0050789,GO:0050792,GO:0050896,GO:0051704,GO:0051707,GO:0065007,GO:0071944,GO:1903900,GO:1903901 Metazoa 39GDW@33154,3BD4K@33208,3CZCJ@33213,4862M@7711,KOG2075@1,KOG2075@2759 NA|NA|NA S BTB/POZ domain mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000019457.1.5 7719.XP_009862407.1 1.6e-44 188.0 Chordata HERC1 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This channel gives rise to T-type calcium currents. T-type calcium channels belong to the low-voltage activated (LVA) group and are strongly blocked by nickel and mibefradil. A particularity of this type of channels is an opening at quite negative potentials, and a voltage- dependent inactivation. T-type channels serve pacemaking functions in both central neurons and cardiac nodal cells and support calcium signaling in secretory cells and vascular smooth muscle. They may also be involved in the modulation of firing patterns of neurons which is important for information processing as well as in cell growth processes mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000019477.1.1 7719.XP_002131996.1 2.1e-95 355.5 Chordata ko:K10447 ko04120,map04120 ko00000,ko00001,ko04121 Metazoa 38GZ8@33154,3BCJV@33208,3CR80@33213,481F0@7711,KOG4441@1,KOG4441@2759 NA|NA|NA T kelch-like mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000019478.1.1 6087.XP_004210125.1 5.8e-14 83.6 Eukaryota ko:K14312,ko:K16547 ko03013,map03013 M00427 ko00000,ko00001,ko00002,ko03019,ko03036,ko04812 1.I.1 Eukaryota KOG1121@1,KOG1121@2759 NA|NA|NA E protein dimerization activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000019481.1.1 51511.ENSCSAVP00000018713 1.3e-38 165.6 Chordata SGMS1 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Adaptor protein complexes function in protein transport via transport vesicles in different membrane traffic pathways. Adaptor protein complexes are vesicle coat components and appear to be involved in cargo selection and vesicle formation. AP-2 is involved in clathrin-dependent endocytosis in which cargo proteins are incorporated into vesicles surrounded by clathrin (clathrin- coated vesicles, CCVs) which are destined for fusion with the early endosome. The clathrin lattice serves as a mechanical scaffold but is itself unable to bind directly to membrane components. Clathrin-associated adaptor protein (AP) complexes which can bind directly to both the clathrin lattice and to the lipid and protein components of membranes are considered to be the major clathrin adaptors contributing the CCV formation. AP-2 also serves as a cargo receptor to selectively sort the membrane proteins involved in receptor-mediated endocytosis. AP-2 seems to play a role in the recycling of synaptic vesicle membranes from the presynaptic surface. AP-2 recognizes Y-X-X- FILMV (Y-X-X-Phi) and ED -X-X-X-L- LI endocytosis signal motifs within the cytosolic tails of transmembrane cargo molecules. AP-2 may also play a role in maintaining normal post-endocytic trafficking through the ARF6-regulated, non-clathrin pathway. The AP-2 alpha subunit binds polyphosphoinositide-containing lipids, positioning AP-2 on the membrane. The AP-2 alpha subunit acts via its C- terminal appendage domain as a scaffolding platform for endocytic accessory proteins. The AP-2 alpha and AP-2 sigma subunits are thought to contribute to the recognition of the ED -X-X-X-L- LI motif mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000020290.1.1 45351.EDO42992 1.7e-07 63.9 Metazoa ko:K10443 ko00000,ko04121 Metazoa 38FPI@33154,3BB3K@33208,KOG4441@1,KOG4441@2759 NA|NA|NA T distal tubule morphogenesis mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000020295.1.4 7719.XP_009862417.1 4.1e-47 194.5 Chordata SLC25A12 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ko:K11393 ko00000,ko01000 Metazoa 38CXU@33154,3B9ID@33208,3CWUD@33213,4802Y@7711,48ZTC@7742,4A2IW@7898,COG3129@1,KOG2912@2759 NA|NA|NA J RNA N6-methyltransferase that methylates adenosine residues of a subset of RNAs and plays a key role in S-adenosyl-L- methionine homeostasis by regulating expression of MAT2A transcripts. Able to N6-methylate a subset of mRNAs and U6 small nuclear RNAs (U6 snRNAs). In contrast to the METTL3-METTL14 heterodimer, only able to methylate a limited number of RNAs requires both a 5'UACAGAGAA-3' nonamer sequence and a specific RNA structure. In presence of S-adenosyl-L-methionine, binds the 3'- UTR region of MAT2A mRNA and specifically N6-methylates the first hairpin of MAT2A mRNA, leading to intron retention and preventing MAT2A mRNA splicing. In S-adenosyl-L-methionine-limiting conditions, binds the 3'-UTR region of MAT2A mRNA but stalls due to the lack of a methyl donor, leading to stimulate splicing of the MAT2A retained intron, and promoting expression of MAT2A. In addition to mRNAs, also able to mediate N6-methylation of U6 small nuclear RNA (U6 snRNA) specifically N6-methylates adenine in position 43 of U6 snRNAs mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000021090.1.2 7955.ENSDARP00000090972 2.2e-17 97.1 Actinopterygii MFAP4 GO:0001527,GO:0005575,GO:0005576,GO:0008150,GO:0009314,GO:0009411,GO:0009416,GO:0009628,GO:0009650,GO:0009987,GO:0010224,GO:0010712,GO:0016043,GO:0019222,GO:0022607,GO:0030198,GO:0031012,GO:0034644,GO:0043062,GO:0044085,GO:0044420,GO:0044421,GO:0048251,GO:0050789,GO:0050896,GO:0051716,GO:0065007,GO:0071214,GO:0071478,GO:0071482,GO:0071493,GO:0071840,GO:0071953,GO:0085029,GO:0097435,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099512,GO:0104004 Metazoa 38EP2@33154,3BMRH@33208,3D2BI@33213,485I8@7711,48Z56@7742,4A0EN@7898,KOG2579@1,KOG2579@2759 NA|NA|NA S Microfibrillar-associated protein 4 mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000021102.1.1 51511.ENSCSAVP00000010662 7.7e-13 79.3 Chordata TOMM40L 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It binds two moles of GTP, one at an exchangeable site on the beta chain and one at a non-exchangeable site on the alpha chain mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000021212.1.1 7719.XP_002131825.2 1e-42 181.4 Chordata Metazoa 38EWQ@33154,3BGCR@33208,3D2CP@33213,489G4@7711,KOG3656@1,KOG3656@2759 NA|NA|NA S 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000021215.1.1 7719.XP_002125003.2 1.2e-30 141.0 Chordata TRIO 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2.7.11.1 ko:K08810,ko:K15048,ko:K20690 ko00000,ko01000,ko01001,ko04131,ko04147 Metazoa 38F7D@33154,3B94R@33208,3CSUG@33213,487YS@7711,KOG4240@1,KOG4240@2759 NA|NA|NA T neurotransmitter receptor localization to postsynaptic specialization membrane mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000021217.1.2 10224.XP_002735368.1 1.1e-29 135.6 Bilateria UBE2W 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It is involved in the biological process described with glycolytic process mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000022345.2.1 7719.XP_002125866.1 1.4e-56 226.1 Chordata MTHFS 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It is involved in the biological process described with oxidation-reduction process mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000022544.1.1 7719.XP_002131760.1 5e-24 117.1 Chordata MAD2L1 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The NBP35-CFD1 heterotetramer forms a Fe-S scaffold complex, mediating the de novo assembly of an Fe-S cluster and its transfer to target apoproteins mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000023766.1.1 9818.XP_007939367.1 5.5e-09 69.3 Afrotheria CFH 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Adaptor protein complexes function in protein transport via transport vesicles in different membrane traffic pathways. Adaptor protein complexes are vesicle coat components and appear to be involved in cargo selection and vesicle formation. AP-2 is involved in clathrin-dependent endocytosis in which cargo proteins are incorporated into vesicles surrounded by clathrin (clathrin- coated vesicles, CCVs) which are destined for fusion with the early endosome. The clathrin lattice serves as a mechanical scaffold but is itself unable to bind directly to membrane components. Clathrin-associated adaptor protein (AP) complexes which can bind directly to both the clathrin lattice and to the lipid and protein components of membranes are considered to be the major clathrin adaptors contributing the CCV formation. AP-2 also serves as a cargo receptor to selectively sort the membrane proteins involved in receptor-mediated endocytosis. AP-2 seems to play a role in the recycling of synaptic vesicle membranes from the presynaptic surface. AP-2 recognizes Y-X-X- FILMV (Y-X-X-Phi) and ED -X-X-X-L- LI endocytosis signal motifs within the cytosolic tails of transmembrane cargo molecules. AP-2 may also play a role in maintaining normal post-endocytic trafficking through the ARF6-regulated, non-clathrin pathway. The AP-2 alpha subunit binds polyphosphoinositide-containing lipids, positioning AP-2 on the membrane. The AP-2 alpha subunit acts via its C- terminal appendage domain as a scaffolding platform for endocytic accessory proteins. The AP-2 alpha and AP-2 sigma subunits are thought to contribute to the recognition of the ED -X-X-X-L- LI motif mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000024254.1.1 13735.ENSPSIP00000001758 1.3e-16 92.4 Vertebrata Metazoa 3A35Z@33154,3BQYF@33208,3D7GC@33213,48HSD@7711,49FJM@7742,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA S Ribonuclease H protein mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000024255.1.1 8364.ENSXETP00000032952 7.6e-12 78.2 Vertebrata KLHL35 GO:0000151,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0031461,GO:0031463,GO:0032991,GO:0044424,GO:0044464,GO:1902494,GO:1990234 ko:K10461 ko00000,ko04121 Metazoa 39S8Z@33154,3BAA4@33208,3CU4E@33213,481B9@7711,4924D@7742,KOG1721@1,KOG1721@2759,KOG4441@1,KOG4441@2759 NA|NA|NA T Kelch-like family member 35 mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000024263.2.1 7719.XP_002130757.1 3e-16 94.4 Chordata Metazoa 28MNG@1,2QU6C@2759,39EE5@33154,3BI2K@33208,3D1MQ@33213,486GW@7711 NA|NA|NA S response to nematode mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000024265.3.1 7719.XP_002129163.1 2.6e-256 891.0 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2.7.11.17 ko:K00908,ko:K05215,ko:K07359 ko04020,ko04080,ko04140,ko04152,ko04211,ko04611,ko04920,ko04921,ko05034,map04020,map04080,map04140,map04152,map04211,map04611,map04920,map04921,map05034 ko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko04040 1.A.7.1.1 Metazoa 38C0I@33154,3BB86@33208,3CUWI@33213,485CU@7711,KOG0585@1,KOG0585@2759 NA|NA|NA T calmodulin-dependent protein kinase activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000025341.1.1 7719.XP_002122051.1 4.9e-79 302.0 Chordata Metazoa 2BFTC@1,2S17S@2759,39MPG@33154,3BS19@33208,3D87K@33213,48JYY@7711 NA|NA|NA S Glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000025344.1.1 653948.CCA20663 1.5e-19 102.4 Eukaryota 3.4.24.71 ko:K01415 ko00000,ko01000,ko01002,ko04147 Eukaryota COG3590@1,KOG3624@2759 NA|NA|NA O metalloendopeptidase activity. It is involved in the biological process described with proteolysis mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000025352.2.1 72019.SARC_03202T0 4.3e-47 194.1 Opisthokonta ko:K11253,ko:K11254 ko05034,ko05202,ko05203,ko05322,map05034,map05202,map05203,map05322 ko00000,ko00001,ko03036,ko04147 Opisthokonta 39ZTV@33154,COG2036@1,KOG1745@2759 NA|NA|NA B protein heterodimerization activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000025352.6.1 27679.XP_010336410.1 1.2e-08 64.7 Primates ko:K11253 ko05034,ko05202,ko05322,map05034,map05202,map05322 ko00000,ko00001,ko03036,ko04147 Mammalia 35T38@314146,39ZTV@33154,3BPDH@33208,3D6BK@33213,3JEM2@40674,48E1W@7711,49B7M@7742,4MJEA@9443,COG2036@1,KOG1745@2759 NA|NA|NA B protein heterodimerization activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000025354.2.1 7719.XP_009860162.1 1.2e-46 195.7 Bilateria Metazoa 38CC3@33154,3BCC2@33208,3CZ7Q@33213,KOG1215@1,KOG1215@2759,KOG2087@1,KOG2087@2759 NA|NA|NA T G-protein coupled receptor activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000025355.1.1 7719.XP_002130194.1 2.3e-100 372.5 Chordata MKLN1 GO:0000003,GO:0001556,GO:0001726,GO:0001952,GO:0003006,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005938,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007154,GO:0007155,GO:0007160,GO:0007165,GO:0007276,GO:0007281,GO:0007292,GO:0008150,GO:0008360,GO:0009987,GO:0009994,GO:0010810,GO:0016043,GO:0019953,GO:0021700,GO:0022412,GO:0022414,GO:0022603,GO:0022604,GO:0022610,GO:0023052,GO:0030029,GO:0030036,GO:0030154,GO:0030155,GO:0031252,GO:0031532,GO:0031589,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0042802,GO:0042995,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044703,GO:0048468,GO:0048469,GO:0048477,GO:0048599,GO:0048609,GO:0048856,GO:0048869,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051704,GO:0051716,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071695,GO:0071840,GO:0071944,GO:0099568,GO:0120025 Metazoa 38E9J@33154,3BFKC@33208,3CUEM@33213,4851E@7711,KOG2437@1,KOG2437@2759 NA|NA|NA T actin cytoskeleton reorganization mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000025359.1.3 30611.ENSOGAP00000014169 1.1e-63 250.4 Primates GART GO:0003674,GO:0003824,GO:0004637,GO:0004641,GO:0004644,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009126,GO:0009127,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009167,GO:0009168,GO:0009987,GO:0016740,GO:0016741,GO:0016742,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016882,GO:0018130,GO:0019438,GO:0019637,GO:0034641,GO:0034654,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0055086,GO:0071704,GO:0090407,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901576 2.1.2.2,6.3.3.1,6.3.4.13 ko:K11787 ko00230,ko00670,ko01100,ko01110,ko01130,ko01523,map00230,map00670,map01100,map01110,map01130,map01523 M00048 R04144,R04208,R04325,R04326 RC00026,RC00090,RC00166,RC00197,RC01100,RC01128 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Mammalia 35IPU@314146,38BPB@33154,3BDXA@33208,3CXAA@33213,3JB9Y@40674,4819S@7711,48WR7@7742,4M6PV@9443,COG0151@1,COG0299@1,KOG0237@2759,KOG3076@2759 NA|NA|NA F Phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp (A) domain mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000025367.1.3 991.IW20_21430 3.7e-08 65.5 Flavobacterium 3.4.16.4 ko:K01286 ko00000,ko01000 Bacteria 1HXU8@117743,2P04C@237,4NI1Z@976,COG1680@1,COG1680@2 NA|NA|NA V Beta-lactamase mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000025370.1.1 59538.XP_005977527.1 3.5e-17 94.4 Cetartiodactyla ZBED8 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release, gene expression, cell motility, cell division and cell death. The isoform alpha-1C gives rise to L-type calcium currents. Long-lasting (L-type) calcium channels belong to the 'high-voltage activated' (HVA) group. They are blocked by dihydropyridines (DHP), phenylalkylamines, benzothiazepines, and by omega-agatoxin-IIIA (omega-Aga-IIIA). They are however insensitive to omega-conotoxin- GVIA (omega-CTx-GVIA) and omega-agatoxin-IVA (omega-Aga-IVA). Calcium channels containing the alpha-1C subunit play an important role in excitation-contraction coupling in the heart. Binding of calmodulin or CABP1 at the same regulatory sites results in an opposit effects on the channel function mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000026487.1.1 6087.XP_002165941.2 9.5e-08 63.2 Metazoa OSTF1 GO:0001503,GO:0001775,GO:0002252,GO:0002263,GO:0002274,GO:0002275,GO:0002283,GO:0002366,GO:0002376,GO:0002443,GO:0002444,GO:0002446,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006810,GO:0006887,GO:0006955,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008150,GO:0009987,GO:0012505,GO:0016192,GO:0017124,GO:0019904,GO:0023052,GO:0030141,GO:0031410,GO:0031974,GO:0031982,GO:0031983,GO:0032501,GO:0032940,GO:0034774,GO:0036230,GO:0042119,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043233,GO:0043299,GO:0043312,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044433,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045055,GO:0045321,GO:0046903,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051716,GO:0060205,GO:0065007,GO:0070013,GO:0097708,GO:0099503,GO:0101002,GO:1904813 Metazoa 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processing involved in protein targeting to mitochondrion mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000027253.1.1 128390.XP_009464398.1 2.4e-06 60.5 Aves LRRN3 GO:0001932,GO:0001934,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0008150,GO:0009893,GO:0010562,GO:0010604,GO:0016020,GO:0019220,GO:0019222,GO:0030117,GO:0030118,GO:0030119,GO:0030131,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031399,GO:0031401,GO:0032268,GO:0032270,GO:0032991,GO:0042325,GO:0042327,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044421,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044444,GO:0044464,GO:0044877,GO:0045937,GO:0048475,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050803,GO:0050807,GO:0051094,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051174,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051246,GO:0051247,GO:0051960,GO:0051962,GO:0051963,GO:0051965,GO:0060255,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071944,GO:0080090,GO:0098796,GO:2000026 Metazoa 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Acetylates only long old microtubules because of its slow acetylation rate since it does not have time to act on dynamically unstable microtubules before the enzyme is released mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000027345.3.1 7719.XP_004226161.1 4.3e-173 614.4 Chordata ZMPSTE24 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Cytochrome c then transfers this electron to the cytochrome oxidase complex, the final protein carrier in the mitochondrial electron-transport chain mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000027692.1.1 13735.ENSPSIP00000016981 2.1e-13 81.6 Testudines OGFOD2 Metazoa 38HYK@33154,3BEZF@33208,3CZ82@33213,484CA@7711,48XD8@7742,4C7TY@8459,KOG1971@1,KOG1971@2759 NA|NA|NA O 2-oxoglutarate and mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000027696.2.3 7719.XP_002129030.2 2.6e-42 178.3 Chordata B4GALT7 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Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000027792.4.1 7719.XP_002121990.1 9.1e-17 93.2 Chordata Hsp67Bb 2.8.1.1,2.8.1.2 ko:K01011 ko00270,ko00920,ko01100,ko01120,ko04122,map00270,map00920,map01100,map01120,map04122 R01931,R03105,R03106 RC00214 ko00000,ko00001,ko01000 Metazoa 3A884@33154,3BUJ0@33208,3DARJ@33213,48EAX@7711,COG0607@1,KOG1530@2759 NA|NA|NA P Thiosulfate sulfurtransferase rhodanese-like domain-containing protein 3 mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000027794.1.1 3760.EMJ24291 8.8e-09 68.6 fabids GO:0000151,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0031461,GO:0031463,GO:0032991,GO:0044424,GO:0044464,GO:1902494,GO:1990234 Viridiplantae 37JJH@33090,3G9EH@35493,4JJFR@91835,KOG1072@1,KOG1072@2759 NA|NA|NA S F-box kelch-repeat protein mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000027796.2.6 7719.XP_002128171.1 5.1e-20 104.4 Bilateria 2.5.1.18,5.3.99.2 ko:K04097 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Releases the supercoiling and torsional tension of DNA introduced during the DNA replication and transcription by transiently cleaving and rejoining one strand of the DNA duplex. The scissile phosphodiester is attacked by the catalytic tyrosine of the enzyme, resulting in the formation of a DNA-(5'-phosphotyrosyl)-enzyme intermediate and the expulsion of a 3'-OH DNA strand mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000028385.1.1 7719.XP_002130401.1 1.8e-08 65.1 Chordata IP6K1 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Protects formylmethionyl-tRNA from spontaneous hydrolysis and promotes its binding to the 30S ribosomal subunits. Also involved in the hydrolysis of GTP during the formation of the 70S ribosomal complex mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000028439.1.9 7719.NP_001027599.1 1.1e-144 520.0 Chordata RDX 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It is involved in the biological process described with oxidation-reduction process mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000030401.1.1 7719.XP_009860162.1 6.5e-55 222.6 Bilateria Metazoa 38CC3@33154,3BCC2@33208,3CZ7Q@33213,KOG1215@1,KOG1215@2759,KOG2087@1,KOG2087@2759 NA|NA|NA T G-protein coupled receptor activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000030403.1.1 51511.ENSCSAVP00000005881 6e-10 69.7 Chordata 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Recognizes GPI anchors structural remodeled in the ER by PGAP1 and MPPE1. In COPI vesicle-mediated retrograde transport involved in the biogenesis of COPI vesicles and vesicle coat recruitment. On Golgi membranes, acts as primary receptor for ARF1-GDP which is involved in COPI-vesicle formation. Increases coatomer-dependent GTPase-activating activity of ARFGAP2. Involved in trafficking of G protein-coupled receptors (GPCRs). Regulates F2LR1, OPRM1 and P2RY4 exocytic trafficking from the Golgi to the plasma membrane thus contributing to receptor resensitization. Involved in trafficking of amyloid beta A4 protein and soluble APP-beta release (independent of modulation of gamma-secretase activity). As part of the presenilin-dependent gamma-secretase complex regulates gamma-cleavages of the amyloid beta A4 protein to yield amyloid-beta 40 (Abeta40). Involved in organization of the Golgi apparatus (By similarity) mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000030594.1.1 7719.XP_002125633.1 1.5e-46 192.6 Chordata FIG4 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Releases the supercoiling and torsional tension of DNA introduced during the DNA replication and transcription by transiently cleaving and rejoining one strand of the DNA duplex. The scissile phosphodiester is attacked by the catalytic tyrosine of the enzyme, resulting in the formation of a DNA-(5'-phosphotyrosyl)-enzyme intermediate and the expulsion of a 3'-OH DNA strand mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000030922.1.1 51511.ENSCSAVP00000009477 5.5e-73 282.0 Chordata 2.4.1.155 ko:K00744 ko00510,ko01100,map00510,map01100 M00075 R05991,R07622 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003 GT18 Metazoa 28M5P@1,2QTNG@2759,38U27@33154,3BI4Y@33208,3CWZJ@33213,481BA@7711 NA|NA|NA S alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase activity mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000030923.1.1 9555.ENSPANP00000014395 6.2e-10 71.6 Cercopithecoidea KLHL25 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Required for normal induction of mutations by physical and chemical agents mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000031369.1.1 7719.XP_002125446.3 6.7e-16 89.4 Chordata THOC3 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It is involved in the biological process described with oxidation-reduction process mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000031554.2.1 45351.EDO34872 1.1e-08 67.0 Metazoa IPP GO:0000151,GO:0003674,GO:0003779,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005856,GO:0008092,GO:0015629,GO:0031461,GO:0031463,GO:0032991,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044424,GO:0044464,GO:1902494,GO:1990234 ko:K13956 ko00000,ko04121 Metazoa 38JQV@33154,3B98J@33208,KOG4441@1,KOG4441@2759 NA|NA|NA T actin binding mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000031557.1.1 7719.XP_002130160.1 4.7e-13 82.4 Chordata LRRC63 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ko:K11373 ko00000,ko03016,ko03036 Mammalia 35FDJ@314146,39DM9@33154,3BD96@33208,3CYHV@33213,3J7KX@40674,47ZTU@7711,4949J@7742,4MA7D@9443,COG5290@1,KOG1920@2759 NA|NA|NA K Acts as subunit of the RNA polymerase II elongator complex, which is a histone acetyltransferase component of the RNA polymerase II (Pol II) holoenzyme and is involved in transcriptional elongation mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000032099.1.1 160860.XP_007356455.1 3.7e-12 78.2 Agaricomycetes incertae sedis toa2 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It is involved in the biological process described with protein glycosylation mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000034240.2.3 7719.XP_002125834.2 1e-72 280.8 Chordata ZC3H12C 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When covalently bound, it is conjugated to target proteins via an isopeptide bond either as a monomer (monoubiquitin), a polymer linked via different Lys residues of the ubiquitin (polyubiquitin chains) or a linear polymer linked via the initiator Met of the ubiquitin (linear polyubiquitin chains). Polyubiquitin chains, when attached to a target protein, have different functions depending on the Lys residue of the ubiquitin that is linked Lys-6-linked may be involved in DNA repair mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000035494.1.2 8128.ENSONIP00000012772 1.7e-15 89.4 Actinopterygii PTK7 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degradation of misfolded, unassembled or oxidatively damaged polypeptides as well as certain short-lived regulatory proteins in the mitochondrial matrix. May also have a chaperone function in the assembly of inner membrane protein complexes. Participates in the regulation of mitochondrial gene expression and in the maintenance of the integrity of the mitochondrial genome. Binds to mitochondrial mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000036073.2.1 10224.XP_006814587.1 6e-09 68.6 Bilateria KLHL31 GO:0000151,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0031461,GO:0031463,GO:0032991,GO:0044424,GO:0044464,GO:1902494,GO:1990234 ko:K10467 ko00000,ko04121 Metazoa 38GZ8@33154,3BCJV@33208,3CR80@33213,KOG4441@1,KOG4441@2759 NA|NA|NA T protein modification by small protein conjugation mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000036075.3.1 7739.XP_002604308.1 5.1e-33 147.5 Chordata ko:K10104 ko00000,ko04091,ko04516 Metazoa 38D9J@33154,3BAVE@33208,3CSRR@33213,47ZAC@7711,KOG2579@1,KOG2579@2759 NA|NA|NA S cell surface pattern recognition receptor signaling pathway mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000036080.2.1 51511.ENSCSAVP00000003412 1.6e-09 68.9 Chordata ZEB2 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the initiation of protein synthesis. 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It is involved in the biological process described with transport mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000036244.3.1 7719.XP_002129019.1 3e-10 71.2 Chordata ACOT7 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Adaptor protein complexes function in protein transport via transport vesicles in different membrane traffic pathways. Adaptor protein complexes are vesicle coat components and appear to be involved in cargo selection and vesicle formation. AP-2 is involved in clathrin-dependent endocytosis in which cargo proteins are incorporated into vesicles surrounded by clathrin (clathrin- coated vesicles, CCVs) which are destined for fusion with the early endosome. The clathrin lattice serves as a mechanical scaffold but is itself unable to bind directly to membrane components. Clathrin-associated adaptor protein (AP) complexes which can bind directly to both the clathrin lattice and to the lipid and protein components of membranes are considered to be the major clathrin adaptors contributing the CCV formation. AP-2 also serves as a cargo receptor to selectively sort the membrane proteins involved in receptor-mediated endocytosis. AP-2 seems to play a role in the recycling of synaptic vesicle membranes from the presynaptic surface. AP-2 recognizes Y-X-X- FILMV (Y-X-X-Phi) and ED -X-X-X-L- LI endocytosis signal motifs within the cytosolic tails of transmembrane cargo molecules. AP-2 may also play a role in maintaining normal post-endocytic trafficking through the ARF6-regulated, non-clathrin pathway. The AP-2 alpha subunit binds polyphosphoinositide-containing lipids, positioning AP-2 on the membrane. The AP-2 alpha subunit acts via its C- terminal appendage domain as a scaffolding platform for endocytic accessory proteins. The AP-2 alpha and AP-2 sigma subunits are thought to contribute to the recognition of the ED -X-X-X-L- LI motif mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000036439.1.1 7719.XP_009862279.1 1.1e-164 587.0 Chordata DUOX2 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In ovulation, weakens the walls of the Graafian follicle. It activates the urokinase-type plasminogen activator, collagenases and several complement zymogens, such as C1 and C5. Cleavage of fibronectin and laminin leads to cell detachment and apoptosis. Also cleaves fibrin, thrombospondin and von Willebrand factor. Its role in tissue remodeling and tumor invasion may be modulated by CSPG4. 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ko:K19530 ko00000 Metazoa 38BJX@33154,3BCF0@33208,3CWIS@33213,47ZQB@7711,495UG@7742,49Z2I@7898,COG4642@1,KOG0231@2759 NA|NA|NA S Junctophilin-1-like mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000038235.1.1 7719.XP_002122637.3 1.2e-58 233.4 Chordata C12orf4 GO:0002682,GO:0002684,GO:0002694,GO:0002697,GO:0002699,GO:0002703,GO:0002886,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0008150,GO:0017157,GO:0032386,GO:0032879,GO:0033003,GO:0033006,GO:0043300,GO:0043304,GO:0044424,GO:0044464,GO:0048518,GO:0048583,GO:0050776,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050865,GO:0051046,GO:0051049,GO:0060341,GO:0060627,GO:0065007,GO:1903305,GO:1903530 Metazoa 38F8Q@33154,3BI66@33208,3CVB8@33213,483SM@7711,KOG4506@1,KOG4506@2759 NA|NA|NA S regulation of mast cell degranulation mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000038237.1.1 7213.XP_004526276.1 1.6e-14 85.5 Diptera ap 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ko:K09373 ko00000,ko03000 Arthropoda 38BZF@33154,3BD2S@33208,3CTZ6@33213,3SIAI@50557,41YA0@6656,45065@7147,KOG0490@1,KOG0490@2759 NA|NA|NA K binding. It is involved in the biological process described with regulation of transcription, DNA-templated mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000038238.1.2 7719.XP_009859014.1 1.7e-61 242.7 Chordata TM9SF4 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Catalyzes the first two steps of cap formation by removing the gamma-phosphate from the 5'-triphosphate end of nascent mRNA to yield a diphosphate end, and by transferring the gmp moiety of GTP to the 5'-diphosphate terminus mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000039310.2.2 51511.ENSCSAVP00000008926 4.3e-25 121.3 Chordata MFI2 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It is involved in the biological process described with mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000039633.1.4 7719.XP_002125730.1 6.8e-32 144.1 Chordata BBS4 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M00687 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01001,ko03036,ko04147 Metazoa 38BZX@33154,3BAI5@33208,3CT2F@33213,483CE@7711,KOG0660@1,KOG0660@2759 NA|NA|NA T regulation of apolipoprotein binding mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000039958.1.1 7719.XP_002122414.1 7.2e-31 140.6 Bilateria COX4I1 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35922@314146,36701@314294,38EKD@33154,3BH1Z@33208,3CTJR@33213,3J2VQ@40674,4822X@7711,491I0@7742,4M7IT@9443,COG4354@1,KOG1077@2759 NA|NA|NA U Component of the adaptor protein complex 2 (AP-2). Adaptor protein complexes function in protein transport via transport vesicles in different membrane traffic pathways. Adaptor protein complexes are vesicle coat components and appear to be involved in cargo selection and vesicle formation. AP-2 is involved in clathrin-dependent endocytosis in which cargo proteins are incorporated into vesicles surrounded by clathrin (clathrin- coated vesicles, CCVs) which are destined for fusion with the early endosome. The clathrin lattice serves as a mechanical scaffold but is itself unable to bind directly to membrane components. Clathrin-associated adaptor protein (AP) complexes which can bind directly to both the clathrin lattice and to the lipid and protein components of membranes are considered to be the major clathrin adaptors contributing the CCV formation. AP-2 also serves as a cargo receptor to selectively sort the membrane proteins involved in receptor-mediated endocytosis. AP-2 seems to play a role in the recycling of synaptic vesicle membranes from the presynaptic surface. AP-2 recognizes Y-X-X- FILMV (Y-X-X-Phi) and ED -X-X-X-L- LI endocytosis signal motifs within the cytosolic tails of transmembrane cargo molecules. AP-2 may also play a role in maintaining normal post-endocytic trafficking through the ARF6-regulated, non-clathrin pathway. The AP-2 alpha subunit binds polyphosphoinositide-containing lipids, positioning AP-2 on the membrane. The AP-2 alpha subunit acts via its C- terminal appendage domain as a scaffolding platform for endocytic accessory proteins. The AP-2 alpha and AP-2 sigma subunits are thought to contribute to the recognition of the ED -X-X-X-L- LI motif mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000039981.1.9 7719.XP_009860790.1 2e-97 364.0 Chordata FAT1 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Releases the supercoiling and torsional tension of DNA introduced during the DNA replication and transcription by transiently cleaving and rejoining one strand of the DNA duplex. The scissile phosphodiester is attacked by the catalytic tyrosine of the enzyme, resulting in the formation of a DNA-(5'-phosphotyrosyl)-enzyme intermediate and the expulsion of a 3'-OH DNA strand mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000040737.1.1 7719.XP_004225559.2 5.6e-50 204.5 Chordata 3.4.21.7 ko:K01315 ko04080,ko04610,ko05150,ko05164,map04080,map04610,map05150,map05164 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002,ko04147,ko04516 Metazoa 2QVNP@2759,38ER1@33154,3BEHU@33208,3CXYM@33213,47Z7W@7711,COG5640@1 NA|NA|NA O Plasmin dissolves the fibrin of blood clots and acts as a proteolytic factor in a variety of other processes including embryonic development, tissue remodeling, tumor invasion, and inflammation. In ovulation, weakens the walls of the Graafian follicle. It activates the urokinase-type plasminogen activator, collagenases and several complement zymogens, such as C1 and C5. Cleavage of fibronectin and laminin leads to cell detachment and apoptosis. Also cleaves fibrin, thrombospondin and von Willebrand factor. Its role in tissue remodeling and tumor invasion may be modulated by CSPG4. Binds to cells mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000040738.1.1 7719.XP_002130755.1 2.2e-87 328.6 Chordata SLC5A3 GO:0003674,GO:0005215,GO:0005365,GO:0005367,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005975,GO:0006020,GO:0006066,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006814,GO:0007275,GO:0007399,GO:0007422,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008324,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015077,GO:0015081,GO:0015166,GO:0015291,GO:0015293,GO:0015294,GO:0015318,GO:0015370,GO:0015672,GO:0015791,GO:0015798,GO:0015850,GO:0016020,GO:0016021,GO:0019751,GO:0022804,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0031224,GO:0031226,GO:0032501,GO:0032502,GO:0034220,GO:0035725,GO:0043576,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044262,GO:0044281,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0046873,GO:0048731,GO:0048856,GO:0050789,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051239,GO:0055085,GO:0065007,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071944,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:1901615,GO:1901618 ko:K14158,ko:K14383 ko04973,ko04976,ko04978,map04973,map04976,map04978 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It cleaves pre-tRNA at the 5'- and 3'-splice sites to release the intron. The products are an intron and two tRNA half-molecules bearing 2',3'-cyclic phosphate and 5'-OH termini. 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2.4.1.1 ko:K00688 ko00500,ko01100,ko01110,ko02026,ko04217,ko04910,ko04922,ko04931,map00500,map01100,map01110,map02026,map04217,map04910,map04922,map04931 R02111 ko00000,ko00001,ko01000 GT35 Metazoa 38F0I@33154,3BD45@33208,3CSQ6@33213,4869N@7711,COG0058@1,KOG2099@2759 NA|NA|NA G Phosphorylase is an important allosteric enzyme in carbohydrate metabolism. Enzymes from different sources differ in their regulatory mechanisms and in their natural substrates. However, all known phosphorylases share catalytic and structural properties mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000041048.1.1 31033.ENSTRUP00000043948 2e-10 71.2 Vertebrata FAM200A Metazoa 2CN11@1,2QT83@2759,38D3X@33154,3BDRF@33208,3CX54@33213,482YQ@7711,494V4@7742 NA|NA|NA S DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000041048.2.2 51511.ENSCSAVP00000000641 1.2e-43 183.3 Chordata PREX2 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Arf family mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000041184.1.1 641143.HMPREF9331_00276 5e-09 68.2 Capnocytophaga dnaJ GO:0000988,GO:0000989,GO:0003674,GO:0003756,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006457,GO:0006458,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008270,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009266,GO:0009408,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010556,GO:0015035,GO:0015036,GO:0016020,GO:0016032,GO:0016043,GO:0016491,GO:0016667,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016864,GO:0016989,GO:0019219,GO:0019222,GO:0022607,GO:0031323,GO:0031326,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0042026,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044403,GO:0044419,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0046872,GO:0046914,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051082,GO:0051084,GO:0051085,GO:0051087,GO:0051171,GO:0051252,GO:0051704,GO:0055114,GO:0060255,GO:0061077,GO:0065003,GO:0065007,GO:0071704,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090304,GO:0140096,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901576,GO:1903506,GO:2001141 ko:K03686 ko00000,ko03029,ko03110 Bacteria 1ER0H@1016,1HXKY@117743,4NF41@976,COG0484@1,COG0484@2 NA|NA|NA O ATP binding to DnaK triggers the release of the substrate protein, thus completing the reaction cycle. Several rounds of ATP-dependent interactions between DnaJ, DnaK and GrpE are required for fully efficient folding. Also involved, together with DnaK and GrpE, in the DNA replication of plasmids through activation of initiation proteins mRNA.TARA_PSE_93_MAG_00215_000000041187.1.2 7719.XP_002127296.1 6.7e-71 273.5 Chordata GNB4 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