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an ATP-dependent manner to modulate DNA topology and maintain chromosomes in an underwound state. Negative supercoiling favors strand separation, and DNA replication, transcription, recombination and repair, all of which involve strand separation. Also able to catalyze the interconversion of other topological isomers of dsDNA rings, including catenanes and knotted rings. Type II topoisomerases break and join 2 DNA strands simultaneously in an ATP-dependent manner mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000112.1.1 1285586.H131_10473 3e-07 61.6 Bacilli ko:K03933 ko00000 AA10,CBM73 Bacteria 1TT45@1239,4HEJN@91061,COG3397@1,COG3397@2 NA|NA|NA G Protein conserved in bacteria mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000116.7.1 7668.SPU_015241-tr 6.6e-07 60.5 Bilateria GNPAT 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38D0R@33154,3NTXG@4751,3UXX0@5204,3VEPJ@5234,COG5190@1,KOG1605@2759 NA|NA|NA K catalytic domain of ctd-like phosphatases mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000132.1.1 4792.ETI30681 1.5e-18 100.5 Peronosporales Eukaryota 3QIXE@4776,COG5184@1,KOG1426@2759 NA|NA|NA H Domain first found in C1r, C1s, uEGF, and bone morphogenetic protein. mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000133.2.1 3218.PP1S22_343V6.1 1.1e-68 266.2 Streptophyta 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factors, stimulates binding of mRNA and methionyl-tRNAi to the 40S ribosome mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000160.3.1 7029.ACYPI003409-PA 2.8e-13 82.0 Paraneoptera 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Source PGD mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000217.2.1 5888.CAK85728 3.7e-50 204.5 Ciliophora ttll-11 GO:0003674,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0006464,GO:0006807,GO:0008092,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0015631,GO:0016874,GO:0016879,GO:0016881,GO:0018095,GO:0018193,GO:0018200,GO:0019538,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0070739,GO:0070740,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 ko:K16582,ko:K16602,ko:K16604 ko00000,ko01000,ko03036,ko04812 Eukaryota 3ZD35@5878,KOG2158@1,KOG2158@2759 NA|NA|NA O Tubulin-tyrosine ligase family protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000221.1.1 6412.HelroP119050 9.7e-13 80.9 Bilateria CAC GO:0000003,GO:0001505,GO:0001508,GO:0002027,GO:0003008,GO:0003674,GO:0005215,GO:0005216,GO:0005244,GO:0005245,GO:0005261,GO:0005262,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0005891,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006816,GO:0006836,GO:0006873,GO:0006874,GO:0006875,GO:0006887,GO:0006914,GO:0006950,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007204,GO:0007267,GO:0007268,GO:0007269,GO:0007275,GO:0007368,GO:0007389,GO:0007399,GO:0007600,GO:0007601,GO:0007602,GO:0007610,GO:0007617,GO:0007618,GO:0007619,GO:0007626,GO:0007632,GO:0008016,GO:0008049,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008324,GO:0008331,GO:0008332,GO:0008344,GO:0008582,GO:0009056,GO:0009266,GO:0009314,GO:0009408,GO:0009416,GO:0009581,GO:0009582,GO:0009583,GO:0009584,GO:0009605,GO:0009628,GO:0009799,GO:0009855,GO:0009966,GO:0009968,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010522,GO:0010524,GO:0010646,GO:0010648,GO:0010959,GO:0015075,GO:0015085,GO:0015267,GO:0015318,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016043,GO:0016057,GO:0016192,GO:0016236,GO:0016322,GO:0016323,GO:0016324,GO:0016545,GO:0017015,GO:0019098,GO:0019722,GO:0019725,GO:0019932,GO:0019953,GO:0021700,GO:0022008,GO:0022411,GO:0022414,GO:0022803,GO:0022832,GO:0022836,GO:0022838,GO:0022839,GO:0022843,GO:0022857,GO:0022890,GO:0023051,GO:0023052,GO:0023057,GO:0023061,GO:0030001,GO:0030003,GO:0030154,GO:0030182,GO:0030512,GO:0030534,GO:0031224,GO:0031594,GO:0031667,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032504,GO:0032879,GO:0032940,GO:0032984,GO:0032991,GO:0034220,GO:0034702,GO:0034703,GO:0034704,GO:0035545,GO:0035556,GO:0040008,GO:0042044,GO:0042045,GO:0042391,GO:0042551,GO:0042592,GO:0042594,GO:0042734,GO:0043269,GO:0043270,GO:0043933,GO:0044057,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044237,GO:0044248,GO:0044425,GO:0044456,GO:0044459,GO:0044464,GO:0044703,GO:0045177,GO:0045202,GO:0045433,GO:0045887,GO:0045927,GO:0046873,GO:0046903,GO:0046928,GO:0048065,GO:0048468,GO:0048469,GO:0048518,GO:0048519,GO:0048522,GO:0048523,GO:0048583,GO:0048585,GO:0048609,GO:0048638,GO:0048639,GO:0048666,GO:0048699,GO:0048731,GO:0048786,GO:0048787,GO:0048856,GO:0048869,GO:0048878,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050801,GO:0050803,GO:0050804,GO:0050807,GO:0050877,GO:0050896,GO:0050906,GO:0050908,GO:0050953,GO:0050962,GO:0051046,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051094,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051480,GO:0051588,GO:0051606,GO:0051641,GO:0051649,GO:0051704,GO:0051716,GO:0051899,GO:0051924,GO:0051928,GO:0051960,GO:0051962,GO:0051963,GO:0051965,GO:0055065,GO:0055074,GO:0055080,GO:0055082,GO:0055085,GO:0060179,GO:0060249,GO:0060341,GO:0061919,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070050,GO:0070588,GO:0070633,GO:0070838,GO:0071695,GO:0071840,GO:0071944,GO:0072503,GO:0072507,GO:0072511,GO:0086010,GO:0090092,GO:0090101,GO:0090287,GO:0090288,GO:0097060,GO:0097352,GO:0097458,GO:0098590,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098771,GO:0098793,GO:0098796,GO:0098797,GO:0098916,GO:0099177,GO:0099536,GO:0099537,GO:0099643,GO:1902495,GO:1903522,GO:1903530,GO:1903844,GO:1903845,GO:1904396,GO:1904398,GO:1990351,GO:2000026 ko:K04849 ko04010,ko04020,ko04721,ko04723,ko04725,ko04726,ko04727,ko04728,ko04930,ko05032,ko05033,map04010,map04020,map04721,map04723,map04725,map04726,map04727,map04728,map04930,map05032,map05033 ko00000,ko00001,ko04040 1.A.1.11.9 Metazoa 38BYK@33154,3BAHQ@33208,3CSUW@33213,KOG2301@1,KOG2301@2759 NA|NA|NA P high voltage-gated calcium channel activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000221.2.1 115417.EPrPW00000014133 4.3e-14 84.7 Pythiales ko:K04851,ko:K04857 ko04010,ko04020,ko04022,ko04024,ko04218,ko04260,ko04261,ko04270,ko04530,ko04713,ko04723,ko04724,ko04725,ko04726,ko04727,ko04728,ko04911,ko04912,ko04921,ko04924,ko04925,ko04927,ko04930,ko04934,ko04973,ko05010,ko05031,ko05410,ko05412,ko05414,map04010,map04020,map04022,map04024,map04218,map04260,map04261,map04270,map04530,map04713,map04723,map04724,map04725,map04726,map04727,map04728,map04911,map04912,map04921,map04924,map04925,map04927,map04930,map04934,map04973,map05010,map05031,map05410,map05412,map05414 ko00000,ko00001,ko04040 1.A.1.11.1,1.A.1.11.2,1.A.1.11.20,1.A.1.11.21 Eukaryota 1MF0I@121069,KOG2301@1,KOG2301@2759 NA|NA|NA PT Voltage-gated Ion Channel (VIC) Superfamily. Source PGD mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000223.3.1 5860.XP_008622497.1 7.4e-09 67.0 Haemosporida Apicomplexa 3KA4V@422676,3Y9QC@5794,3YZ77@5819,COG5183@1,KOG1609@2759 NA|NA|NA A The RING-variant domain is a C4HC3 zinc-finger like motif found in a number of cellular and viral proteins. Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000224.2.1 580340.Tlie_0702 5.6e-14 84.0 Synergistetes leuS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004823,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006429,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.4 ko:K01869 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03657 RC00055,RC00523 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko03016,ko03029 iAF987.Gmet_2300 Bacteria 3TA2I@508458,COG0495@1,COG0495@2 NA|NA|NA J Belongs to the class-I aminoacyl-tRNA synthetase family mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000229.1.1 5911.EAS07222 1.7e-21 109.0 Ciliophora 2.7.11.1 ko:K08857,ko:K20879 ko00000,ko01000,ko01001,ko03036,ko03400 Eukaryota 3ZATB@5878,KOG0589@1,KOG0589@2759 NA|NA|NA T Serine/Threonine protein kinases, catalytic domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000229.2.1 5911.EAR94643 1.2e-08 66.2 Ciliophora 2.7.11.1 ko:K08857,ko:K20879 ko00000,ko01000,ko01001,ko03036,ko03400 Eukaryota 3ZATB@5878,KOG0589@1,KOG0589@2759 NA|NA|NA T Serine/Threonine protein kinases, catalytic domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000235.1.1 42099.EPrPV00000023337 7.1e-08 65.5 Pythiales ko:K11494 ko00000,ko03036 Eukaryota 1MGJJ@121069,COG5184@1,KOG1426@2759 NA|NA|NA DZ RCC1 and BTB domain-containing protein. Source PGD mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000236.1.1 44689.DDB0215381 1.1e-17 96.7 Amoebozoa ATP13A1 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The scissile phosphodiester is attacked by the catalytic tyrosine of the enzyme, resulting in the formation of a DNA-(5'-phosphotyrosyl)-enzyme intermediate and the expulsion of a 3'-OH DNA strand mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000310.6.1 112098.XP_008608194.1 1.4e-11 75.5 Eukaryota ko:K19944 ko00000,ko04131 Eukaryota COG5210@1,KOG1102@2759 NA|NA|NA K regulation of vesicle fusion mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000316.1.1 5911.EAR89267 1.6e-22 112.8 Ciliophora Eukaryota 2E2E5@1,2SHPD@2759,3ZB0E@5878 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000317.14.1 5888.CAK89755 1.8e-21 109.0 Ciliophora Eukaryota 28I6C@1,2QQGI@2759,3ZB70@5878 NA|NA|NA S DUF1704 mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000317.24.1 5911.EAR92528 1.1e-12 79.3 Ciliophora Eukaryota 2CAUU@1,2R2S3@2759,3ZERR@5878 NA|NA|NA S Forkhead associated domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000317.29.1 104355.XP_007863219.1 7.3e-46 190.3 Agaricomycetes incertae sedis ryh1 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It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000326.19.1 3649.evm.model.supercontig_50.66 7.8e-19 100.5 Brassicales 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Coatomer complex is required for budding from Golgi membranes, and is essential for the retrograde Golgi-to-ER transport of dilysine-tagged proteins mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000338.7.1 5888.CAK64296 6.7e-19 100.5 Ciliophora Eukaryota 2CPT2@1,2R2KS@2759,3ZE0F@5878 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000340.2.1 5932.XP_004039828.1 1.9e-12 79.3 Ciliophora Eukaryota 3ZD6B@5878,COG1131@1,KOG0059@2759 NA|NA|NA Q ATPases associated with a variety of cellular activities mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000340.9.1 1396.DJ87_3021 8.2e-14 82.8 Bacillus yfiL ko:K01990 M00254 ko00000,ko00002,ko02000 3.A.1 Bacteria 1TPMQ@1239,1ZAYW@1386,4HA8K@91061,COG1131@1,COG1131@2 NA|NA|NA V COG1131 ABC-type multidrug transport system, ATPase component mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000343.1.1 4006.Lus10036590 7.2e-31 141.4 fabids ko:K07019,ko:K13696 ko00000 Viridiplantae 37M39@33090,3GCBH@35493,4JKV1@91835,COG0429@1,KOG1838@2759 NA|NA|NA S Embryogenesis-associated protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000348.3.1 81824.XP_001742267.1 1.1e-22 114.4 Opisthokonta DDX21 GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003724,GO:0003725,GO:0003824,GO:0004004,GO:0004386,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005886,GO:0006139,GO:0006351,GO:0006366,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008026,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008186,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009605,GO:0009607,GO:0009615,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010501,GO:0010604,GO:0010628,GO:0014070,GO:0016020,GO:0016070,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017069,GO:0017111,GO:0018130,GO:0019222,GO:0019438,GO:0019843,GO:0030515,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032774,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0035198,GO:0040029,GO:0042221,GO:0042623,GO:0043170,GO:0043207,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043330,GO:0043331,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044271,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045815,GO:0046483,GO:0048518,GO:0050789,GO:0050896,GO:0051704,GO:0051707,GO:0060255,GO:0061980,GO:0065007,GO:0070013,GO:0070035,GO:0071704,GO:0071944,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097322,GO:0097659,GO:0140098,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901576,GO:1901698 3.6.4.13 ko:K13183,ko:K16911 ko01110,map01110 ko00000,ko01000,ko03009,ko03036,ko03041 Opisthokonta 38HSV@33154,COG0513@1,KOG0331@2759 NA|NA|NA A 7SK snRNA binding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000348.6.1 5911.EAR92013 7.4e-82 310.8 Ciliophora 3.6.4.13 ko:K16911 ko01110,map01110 ko00000,ko01000,ko03009,ko03036 Eukaryota 3ZBAW@5878,COG0513@1,KOG0331@2759 NA|NA|NA A GUCT (NUC152) domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000350.2.1 5911.EAS07673 8.8e-09 68.6 Ciliophora Eukaryota 2CMXF@1,2QSJ2@2759,3ZAW7@5878 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000350.4.1 5888.CAK92117 4.1e-14 85.1 Ciliophora Eukaryota 2CMXF@1,2QSJ2@2759,3ZAW7@5878 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000352.1.1 42099.EPrPV00000020900 5e-11 73.9 Pythiales Eukaryota 1MF9D@121069,COG2866@1,KOG3641@2759 NA|NA|NA E Zinc carboxypeptidase family protein. 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OT Calpain family cysteine protease mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000397.2.1 5911.EAR85013 2.5e-08 66.2 Ciliophora CCDC96 Eukaryota 28MPJ@1,2QS75@2759,3ZCYA@5878 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF4201) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000399.1.2 5022.CBX98730 1.6e-54 219.9 Pleosporales SPB1 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The isoform alpha-1C gives rise to L-type calcium currents. Long-lasting (L-type) calcium channels belong to the 'high-voltage activated' (HVA) group. They are blocked by dihydropyridines (DHP), phenylalkylamines, benzothiazepines, and by omega-agatoxin-IIIA (omega-Aga-IIIA). They are however insensitive to omega-conotoxin- GVIA (omega-CTx-GVIA) and omega-agatoxin-IVA (omega-Aga-IVA). Calcium channels containing the alpha-1C subunit play an important role in excitation-contraction coupling in the heart. Binding of calmodulin or CABP1 at the same regulatory sites results in an opposit effects on the channel function mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000476.1.1 5911.EAR85157 7.3e-17 94.0 Ciliophora GO:0000003,GO:0000018,GO:0000070,GO:0000228,GO:0000278,GO:0000280,GO:0000793,GO:0000794,GO:0000803,GO:0000805,GO:0000819,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005694,GO:0006996,GO:0007049,GO:0007059,GO:0007135,GO:0008150,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010520,GO:0010564,GO:0010605,GO:0010639,GO:0010948,GO:0016043,GO:0019219,GO:0019222,GO:0022402,GO:0022414,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032991,GO:0033043,GO:0040020,GO:0043073,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044427,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045128,GO:0045132,GO:0045144,GO:0045786,GO:0045835,GO:0045910,GO:0045934,GO:0046536,GO:0048285,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051052,GO:0051053,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051276,GO:0051321,GO:0051445,GO:0051447,GO:0051726,GO:0051783,GO:0051784,GO:0060255,GO:0060631,GO:0061983,GO:0065007,GO:0070013,GO:0070192,GO:0071840,GO:0080090,GO:0098813,GO:0110029,GO:0140013,GO:0140014,GO:1903046,GO:1903047,GO:2000241,GO:2000242 ko:K06677 ko04111,map04111 ko00000,ko00001,ko03036 Eukaryota 3ZAKI@5878,COG5098@1,KOG0414@2759 NA|NA|NA BD non-SMC mitotic condensation complex subunit 1 mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000476.2.1 32264.tetur01g08780.1 7.3e-08 63.5 Arthropoda GO:0000003,GO:0000070,GO:0000228,GO:0000278,GO:0000280,GO:0000785,GO:0000793,GO:0000794,GO:0000796,GO:0000799,GO:0000819,GO:0003674,GO:0003682,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005694,GO:0005737,GO:0006323,GO:0006996,GO:0007049,GO:0007059,GO:0007076,GO:0008150,GO:0009987,GO:0010032,GO:0016043,GO:0022402,GO:0022414,GO:0030261,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032991,GO:0042393,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044427,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044454,GO:0044464,GO:0044815,GO:0048285,GO:0051276,GO:0051304,GO:0051321,GO:0070013,GO:0070192,GO:0071103,GO:0071840,GO:0098813,GO:0140014,GO:1903046,GO:1903047 ko:K06677 ko04111,map04111 ko00000,ko00001,ko03036 Arthropoda 38EKE@33154,3BBY8@33208,3CW7S@33213,41U0N@6656,COG5098@1,KOG0414@2759 NA|NA|NA BD Regulatory subunit of the condensin complex, a complex required for conversion of interphase chromatin into mitotic-like condense chromosomes. The condensin complex probably introduces positive supercoils into relaxed DNA in the presence of type I topoisomerases and converts nicked DNA into positive knotted forms in the presence of type II topoisomerases mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000477.2.1 5911.EAS02657 7e-20 103.6 Eukaryota Eukaryota COG2866@1,KOG3641@2759 NA|NA|NA E protein deglutamylation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000478.1.1 5932.XP_004023950.1 1.7e-13 81.3 Ciliophora GO:0003674,GO:0003824,GO:0004177,GO:0006508,GO:0006807,GO:0007275,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008233,GO:0008238,GO:0008239,GO:0009553,GO:0009561,GO:0016787,GO:0019538,GO:0032501,GO:0032502,GO:0043170,GO:0044238,GO:0048229,GO:0048856,GO:0070011,GO:0071704,GO:0140096,GO:1901564 ko:K16603,ko:K20899 ko04621,map04621 ko00000,ko00001,ko01000,ko04812 Eukaryota 3ZDUD@5878,KOG2037@1,KOG2037@2759,KOG2182@1,KOG2182@2759 NA|NA|NA S Guanylate-binding protein, C-terminal domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000478.2.1 5888.CAK76507 1.7e-13 82.4 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Source PGD mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000526.3.1 5911.EAR90253 5.9e-10 70.1 Ciliophora 2.3.2.27 ko:K10662 ko00000,ko01000,ko04121 Eukaryota 3ZD7K@5878,COG5183@1,KOG1609@2759 NA|NA|NA A The RING-variant domain is a C4HC3 zinc-finger like motif found in a number of cellular and viral proteins. Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000531.1.2 109760.SPPG_01562T0 6e-29 134.8 Fungi Fungi 38H2W@33154,3PD0B@4751,KOG1587@1,KOG1587@2759 NA|NA|NA Z WD40 repeats mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000531.11.1 5911.EAR97047 5.3e-43 181.4 Ciliophora WDR63 GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005856,GO:0005875,GO:0006928,GO:0007017,GO:0007018,GO:0008150,GO:0009987,GO:0015630,GO:0030286,GO:0032991,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045503,GO:0045504,GO:1902494 2.7.11.12 ko:K07376,ko:K10409,ko:K10415,ko:K11143,ko:K17770 ko04022,ko04145,ko04270,ko04540,ko04611,ko04713,ko04714,ko04730,ko04740,ko04923,ko04962,ko04970,ko05016,ko05132,map04022,map04145,map04270,map04540,map04611,map04713,map04714,map04730,map04740,map04923,map04962,map04970,map05016,map05132 M00694 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described with cellular protein modification process mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000628.1.1 5888.CAK91470 5.2e-19 101.7 Eukaryota ko:K21867 ko00000,ko02000 1.A.1.4 Eukaryota KOG0498@1,KOG0498@2759 NA|NA|NA U voltage-gated potassium channel activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000630.1.1 227086.JGI_V11_89146 2.4e-26 125.6 Eukaryota RFA1 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Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000734.4.1 4959.XP_002770111.1 3.5e-73 281.6 Debaryomycetaceae THS1 GO:0002181,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004829,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006435,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0019538,GO:0019752,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.3 ko:K01868 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03663 RC00055,RC00523 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ko00000,ko01000,ko01009,ko03021 Eukaryota 3ZCYR@5878,COG5190@1,KOG1605@2759 NA|NA|NA K NLI interacting factor-like phosphatase family protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000752.2.1 78898.MVEG_04238T0 5.4e-65 254.2 Fungi incertae sedis RPB2 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Binds to DNA in a double-stranded, site-specific manner mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000788.16.1 1041826.FCOL_06405 3.5e-104 385.2 Flavobacterium atoB 2.3.1.9 ko:K00626 ko00071,ko00072,ko00280,ko00310,ko00362,ko00380,ko00620,ko00630,ko00640,ko00650,ko00720,ko00900,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01212,ko02020,map00071,map00072,map00280,map00310,map00362,map00380,map00620,map00630,map00640,map00650,map00720,map00900,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01212,map02020 M00088,M00095,M00373,M00374,M00375 R00238,R01177 RC00004,RC00326 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 iJN746.PP_2215 Bacteria 1HX7B@117743,2NU35@237,4NE3Q@976,COG0183@1,COG0183@2 NA|NA|NA I Catalyzes the synthesis of acetoacetyl coenzyme A from two molecules of acetyl coenzyme A. It can also act as a thiolase, catalyzing the reverse reaction and generating two-carbon units from the four-carbon product of fatty acid oxidation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000796.8.1 5911.EAS06537 9.6e-16 90.5 Ciliophora Eukaryota 2ERC6@1,2SU6C@2759,3ZF1W@5878 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000000797.4.1 5932.XP_004039880.1 3e-17 95.1 Ciliophora SYNJ2 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28K0M@1,2QSF3@2759,3ZDE0@5878 NA|NA|NA S Short calmodulin-binding motif containing conserved Ile and Gln residues. mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000001459.7.1 5762.XP_002674884.1 1.2e-18 99.4 Eukaryota IQCH Eukaryota 28K0M@1,2QSF3@2759 NA|NA|NA S Short calmodulin-binding motif containing conserved Ile and Gln residues. mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000001463.7.1 5932.XP_004034605.1 5.5e-32 144.4 Ciliophora Eukaryota 3ZAMC@5878,KOG0045@1,KOG0045@2759 NA|NA|NA OT Calpain family cysteine protease mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000001464.2.1 5888.CAK83639 1.1e-21 109.8 Ciliophora Eukaryota 2FC17@1,2TD96@2759,3ZD2Y@5878 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000001464.6.1 3659.XP_004151002.1 2.5e-21 108.2 fabids MKP2 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The oxidized form of the cytochrome c heme group can accept an electron from the heme group of the cytochrome c1 subunit of cytochrome reductase. 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201MM@147541,38FJA@33154,3MGJU@451867,3P1V0@4751,3QNBH@4890,KOG4046@1,KOG4046@2759 NA|NA|NA A Domain of unknown function UPF0086 mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000001583.10.1 5911.EAR99285 4.6e-54 217.6 Ciliophora 2.7.11.1 ko:K08857,ko:K20879 ko00000,ko01000,ko01001,ko03036,ko03400 Eukaryota 3ZATX@5878,KOG0589@1,KOG0589@2759 NA|NA|NA T Protein kinase domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000001586.2.1 1007105.PT7_3025 1.3e-67 263.8 Alcaligenaceae mccA 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The isoform alpha-1C gives rise to L-type calcium currents. Long-lasting (L-type) calcium channels belong to the 'high-voltage activated' (HVA) group. They are blocked by dihydropyridines (DHP), phenylalkylamines, benzothiazepines, and by omega-agatoxin-IIIA (omega-Aga-IIIA). They are however insensitive to omega-conotoxin- GVIA (omega-CTx-GVIA) and omega-agatoxin-IVA (omega-Aga-IVA). Calcium channels containing the alpha-1C subunit play an important role in excitation-contraction coupling in the heart. Binding of calmodulin or CABP1 at the same regulatory sites results in an opposit effects on the channel function mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000001799.1.1 6669.EFX70381 8.3e-33 147.5 Arthropoda 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Type IV subfamily mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000001881.1.1 51511.ENSCSAVP00000001309 4.6e-21 108.2 Chordata DNAH7 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Source PGD mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000001916.2.1 5911.EAR94847 3.1e-11 74.7 Ciliophora Eukaryota 3ZAWD@5878,COG0642@1,KOG0519@2759 NA|NA|NA T ATPase, histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like domain containing protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000001917.2.1 5911.EAR89198 4.4e-25 120.9 Ciliophora 4.6.1.1 ko:K11265 ko00230,ko04024,ko04371,ko04713,ko04714,map00230,map04024,map04371,map04713,map04714 R00089,R00434 RC00295 ko00000,ko00001,ko01000 Eukaryota 2QPPT@2759,3ZDA8@5878,COG2114@1 NA|NA|NA T Adenylyl- / guanylyl cyclase, catalytic domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000001919.1.1 5911.EAR84738 4.8e-56 224.2 Ciliophora rpl3 GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0009507,GO:0009526,GO:0009532,GO:0009536,GO:0009570,GO:0009941,GO:0016020,GO:0031967,GO:0031975,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044434,GO:0044435,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464 ko:K02906 ko03010,map03010 M00178,M00179 br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011 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38BYK@33154,3BAHQ@33208,KOG2301@1,KOG2301@2759 NA|NA|NA P Voltage-sensitive calcium channels (VSCC) mediate the entry of calcium ions into excitable cells and are also involved in a variety of calcium-dependent processes, including muscle contraction, hormone or neurotransmitter release, gene expression, cell motility, cell division and cell death. The isoform alpha-1C gives rise to L-type calcium currents. Long-lasting (L-type) calcium channels belong to the 'high-voltage activated' (HVA) group. They are blocked by dihydropyridines (DHP), phenylalkylamines, benzothiazepines, and by omega-agatoxin-IIIA (omega-Aga-IIIA). They are however insensitive to omega-conotoxin- GVIA (omega-CTx-GVIA) and omega-agatoxin-IVA (omega-Aga-IVA). Calcium channels containing the alpha-1C subunit play an important role in excitation-contraction coupling in the heart. Binding of calmodulin or CABP1 at the same regulatory sites results in an opposit effects on the channel function mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000002098.4.1 38833.XP_003062267.1 1.8e-14 85.5 Chlorophyta TPC1 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ko00000,ko00001,ko01000,ko01002,ko04121,ko04131 Eukaryota 3ZBD1@5878,COG5560@1,KOG1870@2759 NA|NA|NA O Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000002114.1.1 5888.CAK87936 1e-84 320.5 Ciliophora ATP9A 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cytoplasmic and mitochondrial tRNAs. Methylation is not dependent on the nature of the nucleoside 5' of the target nucleoside. This is the first step in the biosynthesis of wybutosine (yW), a modified base adjacent to the anticodon of tRNAs and required for accurate decoding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000002209.8.1 5888.CAK85590 2.8e-12 79.3 Ciliophora Eukaryota 2EC1I@1,2SI09@2759,3ZFU9@5878 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000002211.8.1 5888.CAK85282 8.9e-14 82.8 Ciliophora 2.7.11.1,2.7.11.17 ko:K08794,ko:K08811 ko04921,ko04925,map04921,map04925 ko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko03036 Eukaryota 3ZDAZ@5878,KOG0583@1,KOG0583@2759 NA|NA|NA T Protein tyrosine kinase mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000002215.2.1 5932.XP_004032522.1 2e-38 165.6 Ciliophora GPN3 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2.7.11.1 ko:K08333 ko04136,ko04138,ko04140,ko04371,map04136,map04138,map04140,map04371 ko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko04131 Arthropoda 38C2I@33154,3BC53@33208,3CWDJ@33213,3SJQ1@50557,41UMK@6656,4526G@7147,KOG1240@1,KOG1240@2759 NA|NA|NA T It is involved in the biological process described with protein phosphorylation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000002324.2.1 5932.XP_004037571.1 2.8e-30 139.8 Ciliophora 3.1.3.64,3.1.3.95 ko:K18081 ko00562,ko01100,ko04070,map00562,map01100,map04070 ko00000,ko00001,ko01000,ko01009 Eukaryota 3ZBHZ@5878,KOG4471@1,KOG4471@2759 NA|NA|NA IU Belongs to the protein-tyrosine phosphatase family. 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This channel gives rise to T-type calcium currents. T-type calcium channels belong to the low-voltage activated (LVA) group and are strongly blocked by nickel and mibefradil. A particularity of this type of channels is an opening at quite negative potentials, and a voltage- dependent inactivation. T-type channels serve pacemaking functions in both central neurons and cardiac nodal cells and support calcium signaling in secretory cells and vascular smooth muscle. They may also be involved in the modulation of firing patterns of neurons which is important for information processing as well as in cell growth processes mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000002440.2.1 38833.XP_003062267.1 1.7e-08 65.9 Chlorophyta TPC1 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The isoform alpha-1C gives rise to L-type calcium currents. Long-lasting (L-type) calcium channels belong to the 'high-voltage activated' (HVA) group. They are blocked by dihydropyridines (DHP), phenylalkylamines, benzothiazepines, and by omega-agatoxin-IIIA (omega-Aga-IIIA). They are however insensitive to omega-conotoxin- GVIA (omega-CTx-GVIA) and omega-agatoxin-IVA (omega-Aga-IVA). Calcium channels containing the alpha-1C subunit play an important role in excitation-contraction coupling in the heart. 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like motif found in a number of cellular and viral proteins. Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000002707.1.1 45351.EDO38650 0.0 1098.6 Metazoa IARS GO:0003674,GO:0003824,GO:0004812,GO:0004822,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006399,GO:0006412,GO:0006418,GO:0006428,GO:0006518,GO:0006520,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016874,GO:0016875,GO:0017101,GO:0019538,GO:0019752,GO:0019899,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0043038,GO:0043039,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043436,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051020,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576 6.1.1.5 ko:K01870 ko00970,map00970 M00359,M00360 R03656 RC00055,RC00523 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Source PGD mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000002852.4.1 44056.XP_009036369.1 5.7e-07 60.5 Eukaryota ko:K04851,ko:K04857 ko04010,ko04020,ko04022,ko04024,ko04218,ko04260,ko04261,ko04270,ko04530,ko04713,ko04723,ko04724,ko04725,ko04726,ko04727,ko04728,ko04911,ko04912,ko04921,ko04924,ko04925,ko04927,ko04930,ko04934,ko04973,ko05010,ko05031,ko05410,ko05412,ko05414,map04010,map04020,map04022,map04024,map04218,map04260,map04261,map04270,map04530,map04713,map04723,map04724,map04725,map04726,map04727,map04728,map04911,map04912,map04921,map04924,map04925,map04927,map04930,map04934,map04973,map05010,map05031,map05410,map05412,map05414 ko00000,ko00001,ko04040 1.A.1.11.1,1.A.1.11.2,1.A.1.11.20,1.A.1.11.21 Eukaryota KOG2301@1,KOG2301@2759 NA|NA|NA U membrane depolarization during action potential mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000002852.5.1 7668.SPU_025997-tr 4e-14 84.3 Bilateria 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Source PGD mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003037.2.1 5932.XP_004035037.1 9e-29 133.7 Ciliophora ko:K04851,ko:K04857 ko04010,ko04020,ko04022,ko04024,ko04218,ko04260,ko04261,ko04270,ko04530,ko04713,ko04723,ko04724,ko04725,ko04726,ko04727,ko04728,ko04911,ko04912,ko04921,ko04924,ko04925,ko04927,ko04930,ko04934,ko04973,ko05010,ko05031,ko05410,ko05412,ko05414,map04010,map04020,map04022,map04024,map04218,map04260,map04261,map04270,map04530,map04713,map04723,map04724,map04725,map04726,map04727,map04728,map04911,map04912,map04921,map04924,map04925,map04927,map04930,map04934,map04973,map05010,map05031,map05410,map05412,map05414 ko00000,ko00001,ko04040 1.A.1.11.1,1.A.1.11.2,1.A.1.11.20,1.A.1.11.21 Eukaryota 3ZDR3@5878,KOG2301@1,KOG2301@2759 NA|NA|NA P Polycystin cation channel mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003037.4.1 55529.EKX44430 1.4e-12 79.3 Eukaryota ko:K04851,ko:K04857 ko04010,ko04020,ko04022,ko04024,ko04218,ko04260,ko04261,ko04270,ko04530,ko04713,ko04723,ko04724,ko04725,ko04726,ko04727,ko04728,ko04911,ko04912,ko04921,ko04924,ko04925,ko04927,ko04930,ko04934,ko04973,ko05010,ko05031,ko05410,ko05412,ko05414,map04010,map04020,map04022,map04024,map04218,map04260,map04261,map04270,map04530,map04713,map04723,map04724,map04725,map04726,map04727,map04728,map04911,map04912,map04921,map04924,map04925,map04927,map04930,map04934,map04973,map05010,map05031,map05410,map05412,map05414 ko00000,ko00001,ko04040 1.A.1.11.1,1.A.1.11.2,1.A.1.11.20,1.A.1.11.21 Eukaryota KOG2301@1,KOG2301@2759 NA|NA|NA U membrane depolarization during action potential mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003040.1.1 42099.EPrPV00000014532 3.3e-16 92.0 Pythiales GFPT1 GO:0000271,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004360,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005975,GO:0005976,GO:0005979,GO:0006002,GO:0006022,GO:0006023,GO:0006030,GO:0006031,GO:0006037,GO:0006038,GO:0006040,GO:0006041,GO:0006042,GO:0006047,GO:0006048,GO:0006082,GO:0006091,GO:0006109,GO:0006112,GO:0006139,GO:0006464,GO:0006486,GO:0006487,GO:0006520,GO:0006541,GO:0006725,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006986,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007623,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008483,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009064,GO:0009100,GO:0009101,GO:0009225,GO:0009226,GO:0009272,GO:0009719,GO:0009725,GO:0009743,GO:0009744,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010033,GO:0010243,GO:0010383,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010675,GO:0010677,GO:0010906,GO:0010962,GO:0015980,GO:0016043,GO:0016051,GO:0016597,GO:0016740,GO:0016769,GO:0017144,GO:0018130,GO:0019222,GO:0019438,GO:0019538,GO:0019637,GO:0019752,GO:0022607,GO:0023052,GO:0030246,GO:0030447,GO:0030448,GO:0030968,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031406,GO:0032501,GO:0032868,GO:0032869,GO:0032870,GO:0032881,GO:0032885,GO:0032922,GO:0033554,GO:0033692,GO:0034097,GO:0034221,GO:0034285,GO:0034620,GO:0034637,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0034976,GO:0035690,GO:0035966,GO:0035967,GO:0036094,GO:0036211,GO:0036498,GO:0040007,GO:0042221,GO:0042493,GO:0042546,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043177,GO:0043255,GO:0043412,GO:0043413,GO:0043434,GO:0043436,GO:0043467,GO:0043933,GO:0044036,GO:0044038,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044262,GO:0044264,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045229,GO:0045719,GO:0045912,GO:0046349,GO:0046483,GO:0048511,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051259,GO:0051260,GO:0051262,GO:0051278,GO:0051289,GO:0051716,GO:0055086,GO:0055114,GO:0060255,GO:0062012,GO:0065003,GO:0065007,GO:0070085,GO:0070548,GO:0070589,GO:0070592,GO:0070873,GO:0070874,GO:0070887,GO:0071310,GO:0071345,GO:0071375,GO:0071417,GO:0071495,GO:0071554,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071852,GO:0071966,GO:0080090,GO:1901071,GO:1901073,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901605,GO:1901652,GO:1901653,GO:1901698,GO:1901699,GO:1901700,GO:1901701,GO:1990823,GO:1990830,GO:2000112,GO:2000113 2.6.1.16 ko:K00820 ko00250,ko00520,ko01100,ko01130,ko04931,map00250,map00520,map01100,map01130,map04931 R00768 RC00010,RC00163,RC02752 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 iMM904.YKL104C,iND750.YKL104C Eukaryota 1MDGS@121069,COG0449@1,KOG1268@2759 NA|NA|NA M Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase isomerizing . Source PGD mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003043.5.1 159749.K0T631 4.9e-19 103.2 Bacillariophyta Eukaryota 2BZ3N@1,2S2IQ@2759,2XFMW@2836 NA|NA|NA U Peroxidase mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003044.2.1 135651.CBN05292 9.1e-27 126.7 Rhabditida Nematoda 1KTR9@119089,38HET@33154,3BETD@33208,3CWFN@33213,40C5Q@6231,410CY@6236,COG5210@1,KOG4567@2759 NA|NA|NA S Domain in Tre-2, BUB2p, and Cdc16p. 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The FACT complex is involved in multiple processes that require DNA as a template such as mRNA elongation, DNA replication and DNA repair. During transcription elongation the FACT complex acts as a histone chaperone that both destabilizes and restores nucleosomal structure. It facilitates the passage of RNA polymerase II and transcription by promoting the dissociation of one histone H2A-H2B dimer from the nucleosome, then subsequently promotes the reestablishment of the nucleosome following the passage of RNA polymerase II (By similarity) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003090.1.1 6500.XP_005110691.1 1.7e-48 199.1 Bilateria WDR35 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Adaptor protein complexes function in protein transport via transport vesicles in different membrane traffic pathways. Adaptor protein complexes are vesicle coat components and appear to be involved in cargo selection and vesicle formation. AP-2 is involved in clathrin-dependent endocytosis in which cargo proteins are incorporated into vesicles surrounded by clathrin (clathrin-coated vesicles, CCVs) which are destined for fusion with the early endosome mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003210.1.1 185453.XP_006834147.1 3.8e-16 90.5 Afrotheria NUAK2 GO:0000166,GO:0000287,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004672,GO:0004674,GO:0005488,GO:0005524,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006464,GO:0006468,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007154,GO:0007165,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009267,GO:0009605,GO:0009987,GO:0009991,GO:0010941,GO:0016043,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016773,GO:0017076,GO:0019538,GO:0023052,GO:0030029,GO:0030036,GO:0030554,GO:0031667,GO:0031668,GO:0031669,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032559,GO:0033554,GO:0035556,GO:0035639,GO:0036094,GO:0036211,GO:0042149,GO:0042594,GO:0042981,GO:0043066,GO:0043067,GO:0043069,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043169,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044424,GO:0044464,GO:0046872,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0060548,GO:0065007,GO:0071496,GO:0071704,GO:0071840,GO:0097159,GO:0097367,GO:0140096,GO:1901265,GO:1901363,GO:1901564 2.7.11.1 ko:K08800 ko00000,ko01000,ko01001 Mammalia 34WG7@311790,38BH2@33154,3BA9M@33208,3CXYR@33213,3J4C0@40674,487UB@7711,49634@7742,KOG0611@1,KOG0611@2759 NA|NA|NA T NUAK family, SNF1-like kinase, 2 mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003212.9.1 5888.CAK62238 9.2e-11 72.8 Ciliophora ARPC4 GO:0000001,GO:0000147,GO:0000902,GO:0001667,GO:0002009,GO:0002252,GO:0002253,GO:0002376,GO:0002429,GO:0002431,GO:0002433,GO:0002682,GO:0002684,GO:0002757,GO:0002764,GO:0002768,GO:0003674,GO:0003779,GO:0005198,GO:0005200,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005885,GO:0005938,GO:0006810,GO:0006887,GO:0006897,GO:0006909,GO:0006928,GO:0006950,GO:0006996,GO:0007005,GO:0007010,GO:0007015,GO:0007154,GO:0007155,GO:0007165,GO:0007166,GO:0007167,GO:0007169,GO:0007275,GO:0008064,GO:0008092,GO:0008150,GO:0008154,GO:0008360,GO:0009611,GO:0009653,GO:0009790,GO:0009888,GO:0009987,GO:0010631,GO:0010638,GO:0012506,GO:0015629,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016192,GO:0016331,GO:0016477,GO:0019899,GO:0022603,GO:0022604,GO:0022607,GO:0022610,GO:0023052,GO:0030029,GO:0030030,GO:0030031,GO:0030036,GO:0030041,GO:0030139,GO:0030175,GO:0030479,GO:0030659,GO:0030666,GO:0030670,GO:0030832,GO:0030833,GO:0030838,GO:0030863,GO:0030864,GO:0030865,GO:0030866,GO:0031090,GO:0031143,GO:0031252,GO:0031334,GO:0031410,GO:0031982,GO:0032271,GO:0032273,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032535,GO:0032940,GO:0032956,GO:0032970,GO:0032989,GO:0032991,GO:0033043,GO:0033627,GO:0034314,GO:0034622,GO:0038093,GO:0038094,GO:0038096,GO:0040011,GO:0042060,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043254,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044087,GO:0044089,GO:0044396,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044433,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044448,GO:0044464,GO:0045010,GO:0045335,GO:0046903,GO:0048013,GO:0048308,GO:0048311,GO:0048518,GO:0048522,GO:0048583,GO:0048584,GO:0048598,GO:0048729,GO:0048856,GO:0048869,GO:0048870,GO:0050776,GO:0050778,GO:0050789,GO:0050793,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051128,GO:0051130,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051258,GO:0051493,GO:0051495,GO:0051640,GO:0051641,GO:0051646,GO:0051674,GO:0051716,GO:0060429,GO:0061024,GO:0061645,GO:0065003,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090066,GO:0090130,GO:0090132,GO:0097435,GO:0097708,GO:0098588,GO:0098657,GO:0098805,GO:0098858,GO:0099568,GO:0110053,GO:0120025,GO:1902903,GO:1902905 1.4.3.5 ko:K00275,ko:K05755,ko:K16608 ko00750,ko01100,ko01120,ko04144,ko04666,ko04810,ko05100,ko05130,ko05131,ko05132,map00750,map01100,map01120,map04144,map04666,map04810,map05100,map05130,map05131,map05132 M00124 R00277,R00278,R01710,R01711 RC00048,RC00116 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04131,ko04812 Eukaryota 3ZCRS@5878,KOG1876@1,KOG1876@2759 NA|NA|NA Z Functions as actin-binding component of the Arp2 3 complex which is involved in regulation of actin polymerization and together with an activating nucleation-promoting factor (NPF) mediates the formation of branched actin networks. Seems to contact the mother actin filament mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003215.2.1 5911.EAR85075 1.2e-16 93.6 Ciliophora KIAA1751 GO:0000226,GO:0001539,GO:0001578,GO:0003341,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005856,GO:0005929,GO:0005930,GO:0006928,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007017,GO:0007018,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0022607,GO:0030030,GO:0030031,GO:0032838,GO:0035082,GO:0040011,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044085,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044441,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044782,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0060271,GO:0060285,GO:0060294,GO:0070925,GO:0071840,GO:0097014,GO:0099568,GO:0120025,GO:0120031,GO:0120036,GO:0120038 Eukaryota 2CMB2@1,2QPUP@2759,3ZB4C@5878 NA|NA|NA S axoneme assembly mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003215.6.1 5932.XP_004037024.1 8.3e-11 73.9 Ciliophora KIAA1751 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1.1.1.22 ko:K00012 ko00040,ko00053,ko00520,ko01100,map00040,map00053,map00520,map01100 M00014,M00129,M00361,M00362 R00286 RC00291 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Metazoa 38BE6@33154,3BE6X@33208,COG1004@1,KOG2666@2759 NA|NA|NA GT UDP-glucose 6-dehydrogenase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003615.4.1 5888.CAK88850 4.6e-15 88.2 Ciliophora Eukaryota 2BR4Y@1,2S1VU@2759,3ZBF9@5878 NA|NA|NA A The RING-variant domain is a C4HC3 zinc-finger like motif found in a number of cellular and viral proteins. Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003616.1.1 115417.EPrPW00000014133 4.3e-14 84.7 Pythiales ko:K04851,ko:K04857 ko04010,ko04020,ko04022,ko04024,ko04218,ko04260,ko04261,ko04270,ko04530,ko04713,ko04723,ko04724,ko04725,ko04726,ko04727,ko04728,ko04911,ko04912,ko04921,ko04924,ko04925,ko04927,ko04930,ko04934,ko04973,ko05010,ko05031,ko05410,ko05412,ko05414,map04010,map04020,map04022,map04024,map04218,map04260,map04261,map04270,map04530,map04713,map04723,map04724,map04725,map04726,map04727,map04728,map04911,map04912,map04921,map04924,map04925,map04927,map04930,map04934,map04973,map05010,map05031,map05410,map05412,map05414 ko00000,ko00001,ko04040 1.A.1.11.1,1.A.1.11.2,1.A.1.11.20,1.A.1.11.21 Eukaryota 1MF0I@121069,KOG2301@1,KOG2301@2759 NA|NA|NA PT Voltage-gated Ion Channel (VIC) Superfamily. Source PGD mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003616.3.1 2880.D8LI93 7.1e-17 94.4 Eukaryota ko:K04851,ko:K04857 ko04010,ko04020,ko04022,ko04024,ko04218,ko04260,ko04261,ko04270,ko04530,ko04713,ko04723,ko04724,ko04725,ko04726,ko04727,ko04728,ko04911,ko04912,ko04921,ko04924,ko04925,ko04927,ko04930,ko04934,ko04973,ko05010,ko05031,ko05410,ko05412,ko05414,map04010,map04020,map04022,map04024,map04218,map04260,map04261,map04270,map04530,map04713,map04723,map04724,map04725,map04726,map04727,map04728,map04911,map04912,map04921,map04924,map04925,map04927,map04930,map04934,map04973,map05010,map05031,map05410,map05412,map05414 ko00000,ko00001,ko04040 1.A.1.11.1,1.A.1.11.2,1.A.1.11.20,1.A.1.11.21 Eukaryota KOG2301@1,KOG2301@2759 NA|NA|NA U membrane depolarization during action potential mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003616.4.1 5932.XP_004035037.1 7e-24 117.1 Ciliophora ko:K04851,ko:K04857 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release, gene expression, cell motility, cell division and cell death. The isoform alpha-1C gives rise to L-type calcium currents. Long-lasting (L-type) calcium channels belong to the 'high-voltage activated' (HVA) group. They are blocked by dihydropyridines (DHP), phenylalkylamines, benzothiazepines, and by omega-agatoxin-IIIA (omega-Aga-IIIA). They are however insensitive to omega-conotoxin- GVIA (omega-CTx-GVIA) and omega-agatoxin-IVA (omega-Aga-IVA). Calcium channels containing the alpha-1C subunit play an important role in excitation-contraction coupling in the heart. Binding of calmodulin or CABP1 at the same regulatory sites results in an opposit effects on the channel function mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003629.3.1 5888.CAK85661 4.2e-38 164.9 Ciliophora SCN4A 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The isoform alpha-1B gives rise to N-type calcium currents. N-type calcium channels belong to the 'high-voltage activated' (HVA) group and are blocked by omega-conotoxin-GVIA (omega-CTx-GVIA) and by omega-agatoxin- IIIA (omega-Aga-IIIA). They are however insensitive to dihydropyridines (DHP), and omega-agatoxin-IVA (omega-Aga-IVA). Calcium channels containing alpha-1B subunit may play a role in directed migration of immature neurons mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003773.2.1 6239.C54D2.5d 6.5e-08 63.2 Rhabditida cca-1 GO:0003674,GO:0005215,GO:0005216,GO:0005244,GO:0005245,GO:0005261,GO:0005262,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006816,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008332,GO:0015075,GO:0015085,GO:0015267,GO:0015318,GO:0022803,GO:0022832,GO:0022836,GO:0022838,GO:0022839,GO:0022843,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0034220,GO:0042391,GO:0043051,GO:0045760,GO:0046873,GO:0048518,GO:0050789,GO:0050795,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051899,GO:0055085,GO:0060259,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070588,GO:0070838,GO:0072511,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662,GO:0098900,GO:1903998 ko:K04854 ko04010,ko04020,ko04713,ko04925,ko04927,ko04930,ko04934,map04010,map04020,map04713,map04925,map04927,map04930,map04934 ko00000,ko00001,ko04040 1.A.1.11.12,1.A.1.11.28 Nematoda 1KTKR@119089,3ARFA@33154,3C2IT@33208,3DHPC@33213,40BCJ@6231,40WNM@6236,KOG2301@1,KOG2302@2759 NA|NA|NA P Voltage-sensitive calcium channels (VSCC) mediate the entry of calcium ions into excitable cells and are also involved in a variety of calcium-dependent processes, including muscle contraction, hormone or neurotransmitter release, gene expression, cell motility, cell division and cell death. This channel gives rise to T-type calcium currents. T-type calcium channels belong to the low-voltage activated (LVA) group and are strongly blocked by nickel and mibefradil. A particularity of this type of channels is an opening at quite negative potentials, and a voltage- dependent inactivation. T-type channels serve pacemaking functions in both central neurons and cardiac nodal cells and support calcium signaling in secretory cells and vascular smooth muscle. They may also be involved in the modulation of firing patterns of neurons which is important for information processing as well as in cell growth processes mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003774.5.1 60711.ENSCSAP00000001020 1.7e-12 79.7 Cercopithecoidea FAR1 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Requires a tRNA-binding adapter protein for full tRNA acetyltransferase activity but not for 18S rRNA acetylation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003791.14.1 144197.XP_008277137.1 8.2e-113 413.7 Actinopterygii NAT10 GO:0000049,GO:0000154,GO:0002097,GO:0002101,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005697,GO:0005730,GO:0006139,GO:0006325,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006464,GO:0006473,GO:0006475,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008033,GO:0008080,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010639,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016072,GO:0016407,GO:0016410,GO:0016569,GO:0016570,GO:0016573,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0018193,GO:0018205,GO:0018393,GO:0018394,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019899,GO:0022613,GO:0030490,GO:0030496,GO:0030684,GO:0030686,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032204,GO:0032205,GO:0032210,GO:0032211,GO:0032991,GO:0033043,GO:0033044,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0036211,GO:0042254,GO:0042274,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043412,GO:0043543,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045934,GO:0046483,GO:0048519,GO:0048523,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051052,GO:0051053,GO:0051128,GO:0051129,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051276,GO:0051391,GO:0051392,GO:0060255,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070013,GO:0070182,GO:0071704,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1904356,GO:1904357,GO:1904812,GO:1990882,GO:1990883,GO:1990884,GO:1990904,GO:2000112,GO:2000113,GO:2000278,GO:2000279,GO:2001251 ko:K14521 ko03008,map03008 ko00000,ko00001,ko01000,ko03009 Metazoa 38FQJ@33154,3B9XC@33208,3CUWZ@33213,484CZ@7711,493R5@7742,49XUA@7898,COG1444@1,KOG2036@2759 NA|NA|NA S RNA cytidine acetyltransferase with specificity toward both 18S rRNA and tRNAs. 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Requires the tRNA-binding adapter protein THUMBD1 for full tRNA acetyltransferase activity but not for 18S rRNA acetylation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003795.11.1 5888.CAK91470 1e-20 107.5 Eukaryota ko:K21867 ko00000,ko02000 1.A.1.4 Eukaryota KOG0498@1,KOG0498@2759 NA|NA|NA U voltage-gated potassium channel activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003797.22.1 112098.XP_008614859.1 1.6e-53 215.7 Eukaryota GO:0000375,GO:0000377,GO:0000398,GO:0000413,GO:0001775,GO:0002252,GO:0002263,GO:0002274,GO:0002275,GO:0002283,GO:0002366,GO:0002376,GO:0002443,GO:0002444,GO:0002446,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003727,GO:0003729,GO:0003755,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005681,GO:0005684,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006281,GO:0006283,GO:0006289,GO:0006355,GO:0006396,GO:0006397,GO:0006464,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006887,GO:0006950,GO:0006955,GO:0006974,GO:0008143,GO:0008144,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008380,GO:0009889,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0012505,GO:0016018,GO:0016070,GO:0016071,GO:0016192,GO:0016604,GO:0016607,GO:0016853,GO:0016859,GO:0018193,GO:0018208,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019538,GO:0030141,GO:0031323,GO:0031326,GO:0031410,GO:0031974,GO:0031981,GO:0031982,GO:0031983,GO:0032940,GO:0032991,GO:0033218,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034774,GO:0036211,GO:0036230,GO:0042119,GO:0042277,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0043299,GO:0043312,GO:0043412,GO:0043900,GO:0043902,GO:0043903,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044433,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044451,GO:0044464,GO:0045055,GO:0045069,GO:0045070,GO:0045321,GO:0046483,GO:0046903,GO:0048518,GO:0048524,GO:0050789,GO:0050792,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051171,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051252,GO:0051716,GO:0060205,GO:0060255,GO:0065007,GO:0070013,GO:0070717,GO:0071007,GO:0071013,GO:0071704,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:0097708,GO:0099503,GO:0101002,GO:0140096,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1902494,GO:1903506,GO:1903900,GO:1903902,GO:1904813,GO:1990904,GO:2000112,GO:2001141 5.2.1.8 ko:K01802,ko:K09568 ko00000,ko01000,ko03110 Eukaryota COG0545@1,COG0652@1,KOG0543@2759,KOG0865@2759 NA|NA|NA O FK506 binding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003798.1.1 40149.OMERI08G15070.1 4.2e-24 117.9 Poales GO:0006810,GO:0006913,GO:0008150,GO:0046907,GO:0051168,GO:0051169,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051641,GO:0051649 Viridiplantae 37M31@33090,3GFKS@35493,3IAUM@38820,3KW85@4447,COG1293@1,KOG2030@2759 NA|NA|NA K Zinc knuckle mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003798.11.1 4641.GSMUA_Achr3P24450_001 1.9e-20 105.9 Liliopsida GO:0006810,GO:0006913,GO:0008150,GO:0046907,GO:0051168,GO:0051169,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051641,GO:0051649 Viridiplantae 37M31@33090,3GFKS@35493,3KW85@4447,COG1293@1,KOG2030@2759 NA|NA|NA K Domain of unknown function (DUF3441) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003799.6.1 5888.CAK72351 2.7e-19 100.9 Ciliophora 6.3.2.25 ko:K06047,ko:K16603 ko00000,ko01000,ko04812 Eukaryota 3ZD5B@5878,KOG2157@1,KOG2157@2759 NA|NA|NA O Tubulin-tyrosine ligase family protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003799.9.1 244447.XP_008314179.1 2.2e-39 168.7 Actinopterygii VPS29 GO:0003674,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005768,GO:0005770,GO:0005829,GO:0006810,GO:0006886,GO:0006892,GO:0006896,GO:0007034,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008270,GO:0010008,GO:0012505,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016192,GO:0016197,GO:0016482,GO:0030904,GO:0030906,GO:0031090,GO:0031410,GO:0031902,GO:0031982,GO:0032991,GO:0033036,GO:0034613,GO:0042147,GO:0042886,GO:0043167,GO:0043169,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044433,GO:0044440,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045184,GO:0046872,GO:0046907,GO:0046914,GO:0048193,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051641,GO:0051649,GO:0070727,GO:0071702,GO:0071705,GO:0097708,GO:0098588,GO:0098796,GO:0098805,GO:0098876,GO:1990126 ko:K18467 ko04144,map04144 ko00000,ko00001,ko04131 Metazoa 38G09@33154,3BCY0@33208,3CU0R@33213,48BUN@7711,4928J@7742,49Q04@7898,COG0622@1,KOG3325@2759 NA|NA|NA U Acts as component of the retromer cargo-selective complex (CSC). The CSC is believed to be the core functional component of retromer or respective retromer complex variants acting to prevent missorting of selected transmembrane cargo proteins into the lysosomal degradation pathway mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003800.2.1 67593.Physo140823 1.1e-06 60.1 Peronosporales Eukaryota 3QB4Q@4776,KOG0498@1,KOG0498@2759 NA|NA|NA P Cyclic nucleotide-monophosphate binding domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003802.1.1 5932.XP_004029951.1 3.8e-98 365.5 Ciliophora 3.6.1.1 ko:K01507 ko00190,map00190 ko00000,ko00001,ko01000 Eukaryota 2QPJC@2759,3ZDEE@5878,COG3808@1 NA|NA|NA C Inorganic H+ pyrophosphatase mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003802.9.1 5932.XP_004029951.1 3.2e-47 194.5 Ciliophora 3.6.1.1 ko:K01507 ko00190,map00190 ko00000,ko00001,ko01000 Eukaryota 2QPJC@2759,3ZDEE@5878,COG3808@1 NA|NA|NA C Inorganic H+ pyrophosphatase mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003802.15.1 5855.PVX_100710 3.1e-42 177.9 Haemosporida 3.6.1.1 ko:K01507 ko00190,map00190 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Binds to mitochondrial ribosomes in a GTP-dependent manner mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003889.13.1 5888.CAK73494 2.5e-42 178.7 Ciliophora RPL17 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Involved in pre-assembly of dynein arm complexes in the cytoplasm before intraflagellar transport loads them for the ciliary compartment mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003898.1.1 5888.CAK63684 7.3e-50 203.8 Ciliophora Eukaryota 3ZAMY@5878,KOG0580@1,KOG0580@2759 NA|NA|NA T kinase domain containing protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003900.9.1 281687.CJA04873 3.4e-26 124.8 Rhabditida ko:K05849 ko04020,ko04022,ko04371,ko04740,ko04974,map04020,map04022,map04371,map04740,map04974 ko00000,ko00001,ko00536,ko02000 2.A.19.3 Nematoda 1KY0X@119089,38CSX@33154,3BAVY@33208,3CSR1@33213,40ATH@6231,40ZAR@6236,KOG1306@1,KOG1306@2759 NA|NA|NA P Belongs to the Ca(2 ) cation antiporter (CaCA) (TC 2.A.19) family mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003900.15.1 7739.XP_002607154.1 1.3e-15 90.1 Chordata ko:K05849 ko04020,ko04022,ko04371,ko04740,ko04974,map04020,map04022,map04371,map04740,map04974 ko00000,ko00001,ko00536,ko02000 2.A.19.3 Metazoa 38CSX@33154,3BAVY@33208,3CSR1@33213,48J58@7711,KOG1306@1,KOG1306@2759 NA|NA|NA P Sodium/calcium exchanger protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003903.2.1 5888.CAK86275 1.7e-128 467.2 Ciliophora Eukaryota 3ZAKA@5878,COG0308@1,KOG1046@2759 NA|NA|NA EO Peptidase family M1 containing protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003907.1.1 5888.CAK91591 1.1e-07 62.8 Ciliophora ko:K04851,ko:K04857 ko04010,ko04020,ko04022,ko04024,ko04218,ko04260,ko04261,ko04270,ko04530,ko04713,ko04723,ko04724,ko04725,ko04726,ko04727,ko04728,ko04911,ko04912,ko04921,ko04924,ko04925,ko04927,ko04930,ko04934,ko04973,ko05010,ko05031,ko05410,ko05412,ko05414,map04010,map04020,map04022,map04024,map04218,map04260,map04261,map04270,map04530,map04713,map04723,map04724,map04725,map04726,map04727,map04728,map04911,map04912,map04921,map04924,map04925,map04927,map04930,map04934,map04973,map05010,map05031,map05410,map05412,map05414 ko00000,ko00001,ko04040 1.A.1.11.1,1.A.1.11.2,1.A.1.11.20,1.A.1.11.21 Eukaryota 3ZDR3@5878,KOG2301@1,KOG2301@2759 NA|NA|NA P Polycystin cation channel mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003907.3.1 115417.EPrPW00000014927 8e-14 83.6 Pythiales ko:K04851,ko:K04857 ko04010,ko04020,ko04022,ko04024,ko04218,ko04260,ko04261,ko04270,ko04530,ko04713,ko04723,ko04724,ko04725,ko04726,ko04727,ko04728,ko04911,ko04912,ko04921,ko04924,ko04925,ko04927,ko04930,ko04934,ko04973,ko05010,ko05031,ko05410,ko05412,ko05414,map04010,map04020,map04022,map04024,map04218,map04260,map04261,map04270,map04530,map04713,map04723,map04724,map04725,map04726,map04727,map04728,map04911,map04912,map04921,map04924,map04925,map04927,map04930,map04934,map04973,map05010,map05031,map05410,map05412,map05414 ko00000,ko00001,ko04040 1.A.1.11.1,1.A.1.11.2,1.A.1.11.20,1.A.1.11.21 Eukaryota 1MJ9S@121069,KOG2301@1,KOG2301@2759 NA|NA|NA PT Voltage-gated Ion Channel (VIC) Superfamily. Source PGD mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003907.4.1 8128.ENSONIP00000000441 6.6e-15 87.4 Actinopterygii CACNA1A 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Dynamin Fzo YdjA family mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003954.13.1 529818.AMSG_03506T0 3.9e-15 88.2 Eukaryota WDR90 ko:K11797,ko:K14549 ko03008,map03008 ko00000,ko00001,ko03009,ko04121 Eukaryota COG2319@1,KOG0263@2759,KOG0266@1,KOG0266@2759,KOG3213@1,KOG3213@2759 NA|NA|NA S regulation of cilium movement involved in cell motility mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003954.15.1 5888.CAK83427 2e-29 135.2 Ciliophora WDR90 ko:K18596,ko:K18597,ko:K18598,ko:K21763 ko00000,ko03036,ko04812 Eukaryota 3ZBIR@5878,COG2319@1,KOG2106@2759,KOG3213@1,KOG3213@2759 NA|NA|NA K Protein of unknown function (DUF667) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003954.17.1 5888.CAK83427 2.5e-17 95.5 Ciliophora WDR90 ko:K18596,ko:K18597,ko:K18598,ko:K21763 ko00000,ko03036,ko04812 Eukaryota 3ZBIR@5878,COG2319@1,KOG2106@2759,KOG3213@1,KOG3213@2759 NA|NA|NA K Protein of unknown function (DUF667) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003960.1.1 3712.Bo1g115940.1 2.4e-12 79.0 Brassicales GO:0000428,GO:0000988,GO:0000989,GO:0001076,GO:0001129,GO:0001132,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003712,GO:0003824,GO:0004402,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005667,GO:0005669,GO:0006139,GO:0006325,GO:0006351,GO:0006352,GO:0006355,GO:0006357,GO:0006366,GO:0006367,GO:0006464,GO:0006473,GO:0006475,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0008080,GO:0008134,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009314,GO:0009416,GO:0009628,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010628,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016407,GO:0016410,GO:0016569,GO:0016570,GO:0016573,GO:0016591,GO:0016740,GO:0016746,GO:0016747,GO:0017025,GO:0018130,GO:0018193,GO:0018205,GO:0018393,GO:0018394,GO:0019219,GO:0019222,GO:0019438,GO:0019538,GO:0022607,GO:0030880,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032774,GO:0032991,GO:0034212,GO:0034622,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034654,GO:0036211,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0043412,GO:0043543,GO:0043565,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044451,GO:0044464,GO:0044798,GO:0045893,GO:0045935,GO:0045944,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051123,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051252,GO:0051254,GO:0051276,GO:0055029,GO:0060255,GO:0061695,GO:0061733,GO:0065003,GO:0065004,GO:0065007,GO:0070013,GO:0070897,GO:0071704,GO:0071824,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090304,GO:0090575,GO:0097159,GO:0097659,GO:0140110,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901576,GO:1902494,GO:1902680,GO:1903506,GO:1903508,GO:1990234,GO:2000112,GO:2001141 ko:K03125 ko03022,map03022 ko00000,ko00001,ko01001,ko03021,ko03036 Viridiplantae 37M67@33090,3GFWH@35493,3HP26@3699,COG5179@1,KOG0008@2759 NA|NA|NA K Transcription initiation factor TFIID subunit mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003963.1.1 7260.FBpp0252645 1.5e-96 359.8 Diptera GO:0003674,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005777,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006091,GO:0006099,GO:0006101,GO:0006107,GO:0006108,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006732,GO:0006733,GO:0006734,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009060,GO:0009117,GO:0009987,GO:0015980,GO:0016491,GO:0016614,GO:0016615,GO:0016616,GO:0016999,GO:0017144,GO:0019362,GO:0019637,GO:0019674,GO:0019752,GO:0030060,GO:0034641,GO:0042579,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044281,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045333,GO:0046483,GO:0046496,GO:0051186,GO:0055086,GO:0055114,GO:0071704,GO:0072350,GO:0072524,GO:1901360,GO:1901564 1.1.1.37 ko:K00025 ko00020,ko00270,ko00620,ko00630,ko00710,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko04964,map00020,map00270,map00620,map00630,map00710,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map04964 M00009,M00011,M00012,M00168,M00171 R00342,R07136 RC00031 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Arthropoda 38G9H@33154,3BCK0@33208,3CV2Y@33213,3SFMS@50557,41XQK@6656,450JB@7147,COG0039@1,KOG1496@2759 NA|NA|NA C L-malate dehydrogenase activity. It is involved in the biological process described with oxidation-reduction process mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003964.2.1 5888.CAK79168 7.1e-15 88.2 Eukaryota Eukaryota 2CNG2@1,2QW1B@2759 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003971.2.1 5911.EAS01469 7.5e-37 161.0 Ciliophora IQCA1 GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005856,GO:0005929,GO:0005930,GO:0032838,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044441,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044463,GO:0044464,GO:0097014,GO:0099568,GO:0120025,GO:0120038 2.3.1.85 ko:K00665 ko00061,ko01100,ko01212,ko04152,ko04910,map00061,map01100,map01212,map04152,map04910 M00082,M00083 R01404,R01624,R01626,R01706,R04355,R04428,R04430,R04533,R04534,R04535,R04536,R04537,R04543,R04544,R04566,R04568,R04725,R04726,R04952,R04953,R04954,R04956,R04957,R04959,R04960,R04962,R04963,R04965,R04967,R04968,R04970,R08159 RC00004,RC00014,RC00029,RC00039,RC00052,RC00076,RC00117,RC00120,RC00831,RC01095,RC02727,RC02728,RC02729,RC02857,RC02888 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004,ko04147 Eukaryota 3ZBIN@5878,COG0464@1,KOG0740@2759 NA|NA|NA O Short calmodulin-binding motif containing conserved Ile and Gln residues. mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003976.16.1 10224.XP_006823014.1 1.7e-08 68.2 Bilateria 2.7.11.1 ko:K12567 ko05410,ko05414,map05410,map05414 ko00000,ko00001,ko01000,ko01001,ko04131,ko04147,ko04812 Metazoa 38BAS@33154,3B9IR@33208,3CRJW@33213,KOG0613@1,KOG0613@2759 NA|NA|NA T myosin light chain kinase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003978.1.1 44056.XP_009033326.1 1.5e-08 66.2 Eukaryota dnaaf1 ko:K19750 ko00000,ko04812 Eukaryota COG4886@1,KOG0531@2759 NA|NA|NA L axoneme assembly mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003979.1.1 5932.XP_004032241.1 1.4e-12 79.7 Ciliophora Eukaryota 28JXZ@1,2SAAF@2759,3ZAIT@5878 NA|NA|NA S axonemal central apparatus assembly mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003982.1.1 112098.XP_008611385.1 4.1e-19 102.1 Eukaryota WDR59 ko:K13341,ko:K20409 ko04146,ko04150,map04146,map04150 ko00000,ko00001 3.A.20.1 Eukaryota KOG0277@1,KOG0277@2759 NA|NA|NA E peroxisome matrix targeting signal-2 binding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003983.2.1 5911.EAR87406 4.2e-75 289.7 Ciliophora Eukaryota 3ZCW2@5878,KOG0032@1,KOG0032@2759 NA|NA|NA T EF-hand domain pair mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003983.10.1 5911.EAR87406 3.3e-25 121.3 Ciliophora Eukaryota 3ZCW2@5878,KOG0032@1,KOG0032@2759 NA|NA|NA T EF-hand domain pair mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003984.2.1 5888.CAK71275 3e-66 258.8 Ciliophora 3.6.3.31 ko:K05673,ko:K10827 ko01523,ko02010,ko04024,ko04976,map01523,map02010,map04024,map04976 ko00000,ko00001,ko01000,ko02000 3.A.1.208.7 Eukaryota 3ZD02@5878,COG1132@1,KOG0054@2759 NA|NA|NA Q ABC transporter family protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003984.7.1 12957.ACEP10882-PA 6.4e-08 63.5 Hymenoptera ko:K05673 ko01523,ko02010,ko04024,ko04976,map01523,map02010,map04024,map04976 ko00000,ko00001,ko02000 3.A.1.208.7 Arthropoda 38CH6@33154,3BDC6@33208,3CXM9@33213,3SJIN@50557,41VGC@6656,46HWQ@7399,COG1132@1,KOG0054@2759 NA|NA|NA Q ABC transporter transmembrane region mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003984.8.1 36331.EPrPI00000019081 2.1e-07 60.8 Pythiales ko:K05665 ko01523,ko02010,ko04071,ko04977,ko05206,map01523,map02010,map04071,map04977,map05206 ko00000,ko00001,ko02000 3.A.1.208.8 Eukaryota 1MFR6@121069,COG1132@1,KOG0054@2759 NA|NA|NA Q ATP-binding Cassette (ABC) Superfamily. Source PGD mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003984.9.1 59538.XP_005954607.1 3.2e-11 75.5 Cetartiodactyla ko:K05673 ko01523,ko02010,ko04024,ko04976,map01523,map02010,map04024,map04976 ko00000,ko00001,ko02000 3.A.1.208.7 Mammalia 38CH6@33154,3BDC6@33208,3CXM9@33213,3J90E@40674,47Z6D@7711,490XK@7742,4IZAX@91561,COG1132@1,KOG0054@2759 NA|NA|NA Q Multidrug resistance-associated protein 4-like mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003985.6.1 5888.CAK71277 9.6e-17 92.4 Eukaryota GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006869,GO:0008150,GO:0010876,GO:0015399,GO:0015405,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0032991,GO:0033036,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043190,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043492,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702,GO:0071944,GO:0098533,GO:0098796,GO:0098797,GO:1902494,GO:1902495,GO:1904949,GO:1990351 ko:K05643,ko:K05648 ko02010,map02010 ko00000,ko00001,ko02000 3.A.1.211 Eukaryota COG1131@1,KOG0059@2759 NA|NA|NA V ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003985.7.1 7227.FBpp0074959 2.6e-20 104.4 Drosophilidae GO:0003674,GO:0003824,GO:0005215,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0006810,GO:0006869,GO:0008150,GO:0010876,GO:0015399,GO:0015405,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0022804,GO:0022857,GO:0031224,GO:0033036,GO:0042623,GO:0042626,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043492,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044464,GO:0051179,GO:0051234,GO:0055085,GO:0071702 ko:K05643 ko02010,map02010 ko00000,ko00001,ko02000 3.A.1.211 Arthropoda 38BPG@33154,3BBB4@33208,3CSBI@33213,3SGPC@50557,41WWW@6656,450CC@7147,45W75@7214,COG1131@1,KOG0059@2759 NA|NA|NA Q activity. It is involved in the biological process described with transport mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003989.2.1 5911.EAR89421 3.4e-26 125.2 Ciliophora Eukaryota 3ZD5X@5878,KOG0032@1,KOG0032@2759 NA|NA|NA T protein serine/threonine kinase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000003994.4.1 244447.XP_008323558.1 3.4e-58 232.6 Actinopterygii ABCC4 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(a.k.a. 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This channel gives rise to T-type calcium currents. T-type calcium channels belong to the low-voltage activated (LVA) group and are strongly blocked by nickel and mibefradil. A particularity of this type of channels is an opening at quite negative potentials, and a voltage- dependent inactivation. T-type channels serve pacemaking functions in both central neurons and cardiac nodal cells and support calcium signaling in secretory cells and vascular smooth muscle. They may also be involved in the modulation of firing patterns of neurons which is important for information processing as well as in cell growth processes mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000004364.11.1 69319.XP_008553501.1 1.1e-07 62.4 Hymenoptera 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Some of these proteins have been shown both in vivo and in vitro to have ubiquitin E3 ligase activity. mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000004415.2.1 65393.PCC7424_4021 2.5e-14 85.1 Cyanothece Bacteria 1GHC4@1117,3KHA2@43988,COG4251@1,COG4251@2 NA|NA|NA T PAS fold mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00299_000000004416.1.1 63577.G9P7Z2 1.4e-57 230.3 Hypocreaceae exo2 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