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It binds two moles of GTP, one at an exchangeable site on the beta chain and one at a non-exchangeable site on the alpha chain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000000810.7.1 27923.ML00481a-PA 8.5e-24 116.3 Metazoa PPIL4 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38BEA@33154,3BF96@33208,COG4870@1,KOG1542@2759 NA|NA|NA O Belongs to the peptidase C1 family mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000001542.1.1 27923.ML056924a-PA 9.4e-12 75.1 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000001542.2.1 27923.ML03461a-PA 3.6e-17 94.4 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000001544.2.1 27923.ML053628a-PA 6.5e-59 233.8 Metazoa ko:K10253 ko00000,ko01000 Metazoa 2E1CD@1,2S8PU@2759,3AAR3@33154,3C4XA@33208 NA|NA|NA S Dopa 4,5-dioxygenase family mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000001549.2.2 27923.ML09835a-PA 1.3e-98 365.9 Metazoa PMPCA 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This involves the isomerization of uridine such that the ribose is subsequently attached to C5, instead of the normal N1 mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000001833.8.3 10224.XP_006820368.1 1.1e-12 80.5 Bilateria ko:K21125 ko04657,map04657 ko00000,ko00001,ko04131 Metazoa 38BYG@33154,3BBY5@33208,3CRZ6@33213,KOG1216@1,KOG1216@2759 NA|NA|NA VW biological adhesion mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000001836.1.1 27923.ML161329a-PA 1.8e-10 73.9 Metazoa Metazoa 39U9N@33154,3BBI2@33208,COG5069@1,KOG0518@2759 NA|NA|NA Z Filamin-type immunoglobulin domains mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000001841.1.1 27923.ML10111a-PA 9.8e-56 223.0 Metazoa GO:0003674,GO:0003756,GO:0003824,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005783,GO:0006457,GO:0006950,GO:0008150,GO:0009987,GO:0012505,GO:0016853,GO:0016860,GO:0016864,GO:0033554,GO:0034976,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0050896,GO:0051716,GO:0140096 5.3.4.1 ko:K01829,ko:K09583,ko:K13984 ko04141,map04141 ko00000,ko00001,ko01000,ko03110,ko04131 Metazoa 38CSG@33154,3B9B7@33208,COG0526@1,KOG0191@2759 NA|NA|NA O protein disulfide isomerase family A, member 5 mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000001842.1.1 27923.ML02662a-PA 4.6e-89 335.5 Metazoa Metazoa 38B79@33154,3BEJ9@33208,COG4870@1,COG5307@1,KOG0929@2759,KOG1543@2759 NA|NA|NA L regulation of ARF protein signal transduction mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000001843.1.1 27923.ML199812a-PA 1.4e-288 999.2 Opisthokonta Opisthokonta 39Y9N@33154,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA S Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000001845.1.1 27923.ML11055a-PA 9.6e-153 546.2 Metazoa ATP5A1 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It is involved in the biological process described with mannose metabolic process mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000002614.1.1 2850.Phatr37903 3.7e-35 155.6 Bacillariophyta Eukaryota 2DG5C@1,2S5TS@2759,2XGWK@2836 NA|NA|NA S Methyltransferase FkbM domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000002626.1.2 27923.ML004430a-PA 1.2e-25 124.8 Metazoa Metazoa 2CQJ9@1,2R501@2759,39VPP@33154,3BH26@33208 NA|NA|NA S oxidation-reduction process mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000002626.6.1 27923.ML004428a-PA 2.4e-35 155.6 Metazoa Metazoa 2CZRB@1,2SBCQ@2759,3A99U@33154,3BU2Z@33208 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000002626.7.1 27923.ML14631a-PA 1.9e-107 396.0 Metazoa Metazoa 39ZX7@33154,3BQ45@33208,COG2801@1,KOG0017@2759 NA|NA|NA H Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000002626.10.1 6087.XP_004213019.1 4.2e-179 636.0 Opisthokonta Opisthokonta 2CN0N@1,2QT5H@2759,38HD6@33154 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000002629.1.1 27923.ML030513a-PA 5.6e-14 83.2 Metazoa ERAP1 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ko:K12572 ko03018,map03018 ko00000,ko00001,ko03019 Metazoa 38BJY@33154,3BADX@33208,KOG3741@1,KOG3741@2759 NA|NA|NA A Regulatory subunit of the poly(A)-nuclease (PAN) deadenylation complex, one of two cytoplasmic mRNA deadenylases involved in general and miRNA-mediated mRNA turnover. PAN specifically shortens poly(A) tails of RNA and the activity is stimulated by poly(A)-binding protein (PABP). PAN deadenylation is followed by rapid degradation of the shortened mRNA tails by the CCR4-NOT complex. Deadenylated mRNAs are then degraded by two alternative mechanisms, namely exosome-mediated 3'-5' exonucleolytic degradation, or deadenlyation-dependent mRNA decaping and subsequent 5'-3' exonucleolytic degradation by XRN1. PAN3 acts as a positive regulator for PAN activity, recruiting the catalytic subunit PAN2 to mRNA via its interaction with RNA and PABP, and to miRNA targets via its interaction with GW182 family proteins mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000002639.4.1 7070.TC010338-PA 6.2e-14 83.6 Insecta Arthropoda 2CYFX@1,2S43S@2759,39W82@33154,3BD6S@33208,3CXS9@33213,3SP5M@50557,41ZZ4@6656 NA|NA|NA S UBA-like domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000002640.1.1 27923.ML031714a-PA 5.1e-57 228.4 Metazoa Metazoa 395HK@33154,3BW6F@33208,KOG4343@1,KOG4343@2759 NA|NA|NA K basic region leucin zipper mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000002646.1.1 27923.ML07433a-PA 2.7e-30 137.5 Metazoa PPIP5K2 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2e-19 101.7 Metazoa Metazoa 29ZSI@1,2RXX0@2759,39Z38@33154,3BPGC@33208 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000002912.2.1 27923.ML13144a-PA 2.5e-44 184.9 Eukaryota Eukaryota KOG0198@1,KOG0198@2759 NA|NA|NA S MAP kinase kinase kinase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000002913.2.1 1112217.PPL19_01940 1.1e-49 203.8 Gammaproteobacteria iaaH 3.5.1.86,6.3.5.6,6.3.5.7 ko:K02433,ko:K18541,ko:K21801 ko00380,ko00627,ko00970,ko01100,ko01120,map00380,map00627,map00970,map01100,map01120 R03905,R04212,R05783 RC00010,RC00358 ko00000,ko00001,ko01000,ko03029 Bacteria 1MUVQ@1224,1RP7E@1236,COG0154@1,COG0154@2 NA|NA|NA J Allows the formation of correctly charged Gln-tRNA(Gln) through the transamidation of misacylated Glu-tRNA(Gln) in organisms which lack glutaminyl-tRNA synthetase. The reaction takes place in the presence of glutamine and ATP through an activated gamma-phospho-Glu-tRNA(Gln) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000002915.2.1 27923.ML154159a-PA 4.3e-155 554.7 Metazoa Metazoa 29BJX@1,2RIP2@2759,3A837@33154,3BTDV@33208 NA|NA|NA S Sperm-tail PG-rich repeat mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000002915.8.1 27923.ML29411a-PA 1.8e-20 105.5 Metazoa Metazoa 3AB3G@33154,3BQKC@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA O Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000002916.2.1 27923.ML128447a-PA 5.4e-10 70.9 Metazoa PINX1 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38EQN@33154,3BBJ6@33208,COG0584@1,KOG2421@2759 NA|NA|NA L starch binding. It is involved in the biological process described with lipid metabolic process mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000003056.2.1 27923.ML03452a-PA 1.3e-28 132.1 Metazoa DENND5A 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ko:K20164 ko00000,ko04131 Metazoa 38BDU@33154,3BCR4@33208,KOG2080@2759,KOG2127@1 NA|NA|NA T Rab guanyl-nucleotide exchange factor activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000003057.1.2 27923.ML037015a-PA 2e-62 245.4 Metazoa SDF2L1 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Deadenylated mRNAs are then degraded by two alternative mechanisms, namely exosome-mediated 3'-5' exonucleolytic degradation, or deadenlyation-dependent mRNA decaping and subsequent 5'-3' exonucleolytic degradation by XRN1 mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000004416.1.1 27923.ML24491a-PA 4.8e-49 201.4 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000004417.2.1 27923.ML12866a-PA 4.4e-231 807.7 Metazoa Metazoa 3AB3G@33154,3BQKC@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA O Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000004421.1.2 27923.ML093025a-PA 2.1e-131 474.9 Metazoa PRPF8 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3.5.1.52 ko:K01456 ko04141,map04141 ko00000,ko00001,ko01000 Metazoa 38EIG@33154,3BAEH@33208,KOG0909@1,KOG0909@2759,KOG4495@1,KOG4495@2759 NA|NA|NA O Specifically deglycosylates the denatured form of N- linked glycoproteins in the cytoplasm and assists their proteasome-mediated degradation. Cleaves the beta-aspartyl- glucosamine (GlcNAc) of the glycan and the amide side chain of Asn, converting Asn to Asp. Prefers proteins containing high- mannose over those bearing complex type oligosaccharides. Can recognize misfolded proteins in the endoplasmic reticulum that are exported to the cytosol to be destroyed and deglycosylate them, while it has no activity toward native proteins. Deglycosylation is a prerequisite for subsequent proteasome-mediated degradation of some, but not all, misfolded glycoproteins mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000005634.2.1 27923.ML068126a-PA 1.2e-47 198.0 Metazoa ko:K20407 ko04150,map04150 ko00000,ko00001 Metazoa 38BEP@33154,3BBBG@33208,KOG1008@1,KOG1008@2759 NA|NA|NA S response to amino acid starvation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000005634.7.1 27923.ML068126a-PA 5.4e-07 60.1 Metazoa ko:K20407 ko04150,map04150 ko00000,ko00001 Metazoa 38BEP@33154,3BBBG@33208,KOG1008@1,KOG1008@2759 NA|NA|NA S response to amino acid starvation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000005635.1.1 27923.ML05087a-PA 2.8e-19 100.5 Metazoa IMPDH2 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1.1.1.205 ko:K00088 ko00230,ko00983,ko01100,ko01110,map00230,map00983,map01100,map01110 M00050 R01130,R08240 RC00143,RC02207 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko04147 Metazoa 38FT7@33154,3BAKM@33208,COG0516@1,KOG2550@2759 NA|NA|NA F IMP dehydrogenase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000005635.2.1 7668.SPU_024124-tr 2e-09 69.3 Bilateria Metazoa 2CZEI@1,2SA07@2759,3A8IP@33154,3BV4X@33208,3DH3D@33213 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000005637.1.1 69319.XP_008555685.1 2.7e-70 273.5 Hymenoptera Arthropoda 28PUT@1,2QWHD@2759,38EA4@33154,3BMU4@33208,3CZSB@33213,3SP2M@50557,420QI@6656,46MFA@7399 NA|NA|NA S piggyBac transposable element-derived protein 4-like mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000005639.1.1 27923.ML00081a-PA 2.4e-87 329.7 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000005643.1.1 27923.ML169016a-PA 2.1e-220 772.3 Metazoa Metazoa 2CZ48@1,2S8BF@2759,3A92T@33154,3BUM2@33208 NA|NA|NA 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covalent attachment of ubiquitin to other proteins. 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2.4.2.29 ko:K00773 R03789,R10209 RC00063 ko00000,ko01000,ko03016 Metazoa 38H9M@33154,3BB83@33208,COG0343@1,KOG3908@2759 NA|NA|NA A Catalytic subunit of the queuine tRNA-ribosyltransferase (TGT) that catalyzes the base-exchange of a guanine (G) residue with queuine (Q) at position 34 (anticodon wobble position) in tRNAs with GU(N) anticodons (tRNA-Asp, -Asn, -His and -Tyr), resulting in the hypermodified nucleoside queuosine (7-(((4,5-cis- dihydroxy-2-cyclopenten-1-yl)amino)methyl)-7-deazaguanosine). Catalysis occurs through a double-displacement mechanism. The nucleophile active site attacks the C1' of nucleotide 34 to detach the guanine base from the RNA, forming a covalent enzyme-RNA intermediate. The proton acceptor active site deprotonates the incoming queuine, allowing a nucleophilic attack on the C1' of the ribose to form the product mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000006209.1.1 27923.ML03095a-PA 2.3e-16 93.6 Eukaryota PKD1L2 GO:0003674,GO:0005215,GO:0005216,GO:0005261,GO:0005262,GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0006816,GO:0008150,GO:0008324,GO:0009581,GO:0009582,GO:0009605,GO:0009612,GO:0009628,GO:0015075,GO:0015085,GO:0015267,GO:0015318,GO:0016020,GO:0022803,GO:0022838,GO:0022857,GO:0022890,GO:0030001,GO:0034220,GO:0044464,GO:0046873,GO:0050896,GO:0050982,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051606,GO:0055085,GO:0070588,GO:0070838,GO:0071944,GO:0072511,GO:0098655,GO:0098660,GO:0098662 ko:K04988,ko:K08465 ko00000,ko04030,ko04040 1.A.5.1 Eukaryota KOG4297@1,KOG4297@2759 NA|NA|NA S carbohydrate binding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000006212.1.1 27923.ML14988a-PA 3.1e-23 114.8 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H 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2.7.12.1 ko:K08823 ko00000,ko01000,ko01001,ko03041 Metazoa 38EZY@33154,3BB26@33208,KOG0667@1,KOG0671@2759 NA|NA|NA T Dual specificity protein kinase mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000007028.1.1 27923.ML040718a-PA 7e-173 614.4 Metazoa Metazoa 3ARE4@33154,3BXDX@33208,KOG1215@1,KOG1215@2759,KOG2087@1,KOG2087@2759 NA|NA|NA T Low-density lipoprotein receptor domain class A mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000007032.1.2 27923.ML075211a-PA 9.1e-57 226.5 Eukaryota Eukaryota COG5069@1,KOG0516@2759 NA|NA|NA Z cytoskeletal protein binding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000007033.1.1 27923.ML00735a-PA 6.2e-128 464.9 Metazoa Metazoa 3ARE4@33154,3BXDX@33208,KOG1215@1,KOG1215@2759,KOG2087@1,KOG2087@2759 NA|NA|NA T Low-density lipoprotein receptor domain class A mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000007035.1.1 27923.ML29111a-PA 1.7e-26 125.2 Metazoa Metazoa 39N4Q@33154,3B9WN@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA G Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) 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It is involved in the biological process described with protein phosphorylation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000007055.1.1 27923.ML05484a-PA 1.6e-48 198.7 Metazoa TBC1D16 GO:0001919,GO:0003674,GO:0005096,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005768,GO:0005769,GO:0005829,GO:0006810,GO:0006886,GO:0008047,GO:0008104,GO:0008150,GO:0012505,GO:0015031,GO:0015833,GO:0017016,GO:0017137,GO:0019222,GO:0019899,GO:0023051,GO:0030234,GO:0030695,GO:0031267,GO:0031323,GO:0031338,GO:0031410,GO:0031982,GO:0032879,GO:0033036,GO:0033043,GO:0034613,GO:0042886,GO:0043085,GO:0043087,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043547,GO:0044093,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0045184,GO:0046907,GO:0050789,GO:0050790,GO:0050794,GO:0051020,GO:0051049,GO:0051128,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051336,GO:0051345,GO:0051641,GO:0051649,GO:0060255,GO:0060589,GO:0060627,GO:0065007,GO:0065009,GO:0070727,GO:0071702,GO:0071705,GO:0090630,GO:0097708,GO:0098772 Metazoa 38DDV@33154,3BBU9@33208,COG5210@1,KOG2224@2759 NA|NA|NA T regulation of vesicle fusion mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000007058.1.1 248742.XP_005643480.1 6.4e-43 179.9 Chlorophyta 5.2.1.8 ko:K01802,ko:K03767,ko:K09565 ko01503,ko04020,ko04022,ko04217,ko05012,ko05016,ko05145,map01503,map04020,map04022,map04217,map05012,map05016,map05145 ko00000,ko00001,ko01000,ko03110,ko04147 Viridiplantae 34JBX@3041,37M44@33090,COG0652@1,KOG0865@2759 NA|NA|NA O PPIases accelerate the folding of proteins. It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000007065.1.1 27923.ML049614a-PA 1.2e-160 573.9 Opisthokonta Opisthokonta 3A1VG@33154,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA S Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000007070.1.2 45351.EDO29140 6.6e-31 140.2 Metazoa Metazoa 3AGKS@33154,3BZHU@33208,KOG0036@1,KOG0036@2759 NA|NA|NA C EF-hand domain pair mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000007074.2.1 27923.ML005318a-PA 4.1e-36 157.1 Metazoa DCP2 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ko00000,ko01000,ko03021,ko03036 Metazoa 3AVUY@33154,3BBIJ@33208,COG0553@1,KOG0384@2759 NA|NA|NA B helicase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000007449.1.1 27923.ML267517a-PA 3.6e-39 169.5 Eukaryota Eukaryota 2D0AB@1,2SDEB@2759 NA|NA|NA S zinc finger mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000007449.2.1 27923.ML143910a-PA 4.8e-83 315.8 Metazoa MESDC2 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May antagonize Nodal signaling and subsequent organization of axial structures during mesodermal patterning mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000008081.1.1 27923.ML12957a-PA 1.3e-123 449.9 Metazoa CYB5R4 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3.4.19.12 ko:K11844 ko00000,ko01000,ko01002,ko04121 Metazoa 38DXM@33154,3BD1W@33208,COG5560@1,KOG1873@2759 NA|NA|NA O Specifically deubiquitinates 'Lys-120' of histone H2A (H2AK119Ub), a specific tag for epigenetic transcriptional repression, thereby acting as a coactivator. Deubiquitination of histone H2A is a prerequisite for subsequent phosphorylation at 'Ser-11' of histone H3 (H3S10ph), and is required for chromosome segregation when cells enter into mitosis. In resting B- and T- lymphocytes, phosphorylation by AURKB leads to enhance its activity, thereby maintaining transcription in resting lymphocytes. Regulates Hox gene expression via histone H2A deubiquitination. Prefers nucleosomal substrates. Does not deubiquitinate histone H2B mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000008174.1.1 7739.XP_002594765.1 1.2e-09 67.8 Chordata TXNRD1 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1.8.1.9 ko:K22182 ko00450,ko05200,ko05225,map00450,map05200,map05225 R03596,R09372 RC02518,RC02873 ko00000,ko00001,ko01000 Metazoa 38BHT@33154,3BBN5@33208,3CS3G@33213,47YUD@7711,COG0695@1,COG1249@1,KOG1752@2759,KOG4716@2759 NA|NA|NA C selenate reductase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000008177.1.1 8469.XP_007052685.1 3.8e-07 60.8 Testudines TEX26 Metazoa 2A1UB@1,2RY1J@2759,3A19F@33154,3BPGW@33208,3E4HU@33213,48R7G@7711,49MTB@7742,4CE5S@8459 NA|NA|NA S Testis-expressed sequence 26 protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000008180.2.1 27923.ML08546a-PA 7.5e-254 883.6 Opisthokonta NST1 GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0006950,GO:0006970,GO:0008150,GO:0009628,GO:0009651,GO:0044424,GO:0044464,GO:0050896 ko:K14798 ko00000,ko03009 Opisthokonta 28KBK@1,2QSSK@2759,38F3U@33154 NA|NA|NA Z response to salt stress mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000008184.3.1 13249.RPRC005430-PA 1.6e-21 107.8 Paraneoptera RpS29 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It is involved in the biological process described with RNA processing mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000008873.2.1 27923.ML143910a-PA 6.5e-107 395.2 Metazoa MESDC2 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Metazoa 38FUM@33154,3BKBY@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759,KOG4357@1,KOG4357@2759 NA|NA|NA S positive regulation of skeletal muscle acetylcholine-gated channel clustering mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000008874.1.1 27923.ML01734a-PA 7.7e-07 60.1 Metazoa MRPS2 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It is involved in the biological process described with metabolic process mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000009273.1.2 27923.ML22601a-PA 8.8e-75 287.7 Metazoa NCOR2 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ko:K17560 ko00000,ko01009 Eukaryota KOG3130@1,KOG3130@2759 NA|NA|NA S phosphatase inhibitor activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000009684.1.1 27923.ML02756a-PA 2.3e-12 77.8 Metazoa C11orf30 GO:0000118,GO:0000228,GO:0000785,GO:0000790,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005694,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032991,GO:0042802,GO:0042803,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044427,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044451,GO:0044454,GO:0044464,GO:0046983,GO:0070013,GO:0070822,GO:1902494 Metazoa 39ECM@33154,3BGDE@33208,KOG4675@1,KOG4675@2759 NA|NA|NA BK regulation of nucleic acid-templated transcription mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000009686.1.3 27923.ML234559a-PA 2.8e-36 157.9 Metazoa ko:K16449 ko00000 Metazoa 3A8NQ@33154,3BU55@33208,KOG3589@1,KOG3589@2759 NA|NA|NA T Regulator of G protein signalling domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000009695.5.1 7668.SPU_017195-tr 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3.1.26.11 ko:K00784 ko03013,map03013 ko00000,ko00001,ko01000,ko03016 Arthropoda 38D9A@33154,3BA6A@33208,3CSCA@33213,3SI7P@50557,41W7R@6656,4512B@7147,COG1234@1,KOG2121@2759 NA|NA|NA S It is involved in the biological process described with tRNA processing mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000009714.1.2 27923.ML25997a-PA 2.3e-56 224.9 Metazoa Inx2 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Metazoa 38GX5@33154,3BAEG@33208,COG5069@1,KOG0516@2759 NA|NA|NA Z cytoskeletal adaptor activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000010082.1.2 27923.ML161330a-PA 3.9e-105 387.9 Opisthokonta elovl3 2.3.1.199 ko:K10203 ko00062,ko01040,ko01110,ko01212,map00062,map01040,map01110,map01212 M00415 R07758,R07762,R09419,R10825 RC00004,RC00039,RC02728,RC02888,RC02997 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004 Opisthokonta 39YB4@33154,KOG3071@1,KOG3072@2759 NA|NA|NA I Catalyzes the first and rate-limiting reaction of the four that constitute the long-chain fatty acids elongation cycle. This endoplasmic reticulum-bound enzymatic process, allows the addition of 2 carbons to the chain of long- and very long-chain fatty acids VLCFAs per cycle. Condensing enzyme that elongates fatty acids with 12, 14 and 16 carbons with higher activity toward C16 0 acyl-CoAs. Catalyzes the synthesis of unsaturated C16 long chain fatty acids and, to a lesser extent, C18 0 and those with low desaturation degree. May participate to the production of saturated and monounsaturated VLCFAs of different chain lengths that are involved in multiple biological processes as precursors of membrane lipids and lipid mediators mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000010087.2.1 27923.ML13281a-PA 1.5e-19 102.4 Metazoa Metazoa 2BDN0@1,2S130@2759,3ACQ7@33154,3C270@33208 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000010088.1.2 27923.ML220724a-PA 5e-46 190.7 Metazoa Metazoa 3AQ3U@33154,3C365@33208,KOG2191@1,KOG2191@2759 NA|NA|NA A K homology RNA-binding domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000010088.3.1 27923.ML220723a-PA 3.8e-147 528.1 Metazoa PUS1 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It is involved in the biological process described with protein phosphorylation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000010285.1.1 27923.ML05143a-PA 8.3e-17 92.8 Metazoa Metazoa 39Y6T@33154,3BEGN@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA G mannose metabolic process mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000010286.1.1 27923.ML033113a-PA 1.2e-13 83.2 Metazoa CANX 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449.5 Pseudonocardiales Bacteria 2I8TI@201174,4DZ27@85010,COG0110@1,COG0110@2,COG0663@1,COG0663@2,COG1020@1,COG1020@2 NA|NA|NA Q Phosphopantetheine attachment site mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000010490.1.1 27923.ML10429a-PA 4.3e-182 644.8 Metazoa ko:K13539 ko00000,ko01000,ko01002,ko03036 Metazoa 38FJ3@33154,3BB7S@33208,COG5640@1,KOG2556@1,KOG2556@2759,KOG3627@2759 NA|NA|NA MV regulation of choline O-acetyltransferase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000010493.1.5 27923.ML059012a-PA 1.7e-177 629.0 Metazoa Metazoa 28JGH@1,2QRVM@2759,38CSS@33154,3BGCF@33208 NA|NA|NA S Calcium ion binding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000010493.14.1 27923.ML059014a-PA 1.8e-260 905.2 Metazoa Metazoa 2CN4V@1,2QTX0@2759,38EI5@33154,3BBE6@33208 NA|NA|NA S Cilia and flagella associated protein 99 mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000010496.1.1 27923.ML26792a-PA 8.9e-77 294.3 Opisthokonta Opisthokonta 39TZY@33154,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA I queuine tRNA-ribosyltransferase activity 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95.1 Metazoa Metazoa 2E1MT@1,2S8Y5@2759,3A6QG@33154,3BTV9@33208 NA|NA|NA S Putative Interleukin 2 receptor, gamma chain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000010514.1.142 27923.ML26358a-PA 2.2e-205 721.5 Metazoa ko:K05692 ko04015,ko04145,ko04210,ko04390,ko04391,ko04510,ko04520,ko04530,ko04611,ko04670,ko04714,ko04745,ko04810,ko04919,ko04921,ko05100,ko05110,ko05130,ko05131,ko05132,ko05164,ko05205,ko05225,ko05410,ko05412,ko05414,ko05416,ko05418,map04015,map04145,map04210,map04390,map04391,map04510,map04520,map04530,map04611,map04670,map04714,map04745,map04810,map04919,map04921,map05100,map05110,map05130,map05131,map05132,map05164,map05205,map05225,map05410,map05412,map05414,map05416,map05418 ko00000,ko00001,ko03019,ko03021,ko03029,ko03036,ko04147,ko04812 Metazoa 38C0D@33154,3BBGP@33208,COG5277@1,KOG0676@2759 NA|NA|NA Z cytoskeleton organization mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000010515.4.1 27923.ML15411a-PA 6.5e-120 438.0 Metazoa ko:K03352 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the folding of proteins. 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It catalyzes the cis-trans isomerization of proline imidic peptide bonds in oligopeptides mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011177.5.1 27923.ML14881a-PA 6.9e-145 521.2 Metazoa ITFG1 GO:0005575,GO:0005623,GO:0005886,GO:0016020,GO:0016324,GO:0016328,GO:0044425,GO:0044459,GO:0044464,GO:0045177,GO:0071944,GO:0098590 ko:K17257 ko00000,ko04147 Metazoa 39KK5@33154,3BC2U@33208,KOG4550@1,KOG4550@2759 NA|NA|NA T integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011184.4.1 27923.ML08373a-PA 4e-305 1053.5 Metazoa Metazoa 2QUES@2759,39R27@33154,3BHXQ@33208,COG4805@1 NA|NA|NA S Bacterial protein of unknown function (DUF885) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011186.1.1 8128.ENSONIP00000004049 1.4e-19 104.0 Actinopterygii VPS13C 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3.4.21.53 ko:K08675 ko00000,ko01000,ko01002,ko03029 Metazoa 38CF0@33154,3BDSD@33208,COG0466@1,KOG2004@2759 NA|NA|NA O ATP-dependent serine protease that mediates the selective degradation of misfolded, unassembled or oxidatively damaged polypeptides as well as certain short-lived regulatory proteins in the mitochondrial matrix. May also have a chaperone function in the assembly of inner membrane protein complexes. Participates in the regulation of mitochondrial gene expression and in the maintenance of the integrity of the mitochondrial genome. Binds to mitochondrial mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011261.1.1 27923.ML071133a-PA 8.5e-33 146.7 Eukaryota Eukaryota COG5069@1,KOG0517@2759 NA|NA|NA Z actin binding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011268.3.1 27923.ML05094a-PA 1.5e-21 108.2 Eukaryota 2.6.1.1 ko:K06115,ko:K14454 ko00220,ko00250,ko00270,ko00330,ko00350,ko00360,ko00400,ko00710,ko00950,ko00960,ko01100,ko01110,ko01120,ko01130,ko01200,ko01210,ko01230,map00220,map00250,map00270,map00330,map00350,map00360,map00400,map00710,map00950,map00960,map01100,map01110,map01120,map01130,map01200,map01210,map01230 M00170,M00171 R00355,R00694,R00734,R00896,R02433,R02619,R05052 RC00006 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01007,ko04131,ko04147,ko04812 Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011269.1.1 27923.ML14553a-PA 2.5e-111 408.3 Metazoa TOP3A GO:0000002,GO:0000003,GO:0000724,GO:0000725,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003677,GO:0003824,GO:0003916,GO:0003917,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005739,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006260,GO:0006265,GO:0006281,GO:0006302,GO:0006310,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006950,GO:0006974,GO:0006996,GO:0007005,GO:0007049,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009611,GO:0009888,GO:0009987,GO:0016043,GO:0016604,GO:0016605,GO:0016853,GO:0022414,GO:0031099,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032502,GO:0033554,GO:0034641,GO:0034645,GO:0040007,GO:0042060,GO:0042246,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043233,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044451,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048589,GO:0048856,GO:0050896,GO:0051276,GO:0051321,GO:0051716,GO:0070013,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0097159,GO:0140097,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901576 5.99.1.2 ko:K03165 ko03440,ko03460,map03440,map03460 M00414 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko03032,ko03400 Metazoa 38BN4@33154,3BBHK@33208,COG0550@1,KOG1956@2759 NA|NA|NA L DNA topoisomerase type I activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011271.2.1 27923.ML47151a-PA 1.9e-66 260.4 Eukaryota Eukaryota 2E752@1,2SDSH@2759 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011272.1.1 27923.ML07758a-PA 4e-97 361.7 Metazoa DNAAF2 GO:0000226,GO:0001101,GO:0001539,GO:0001578,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005815,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005929,GO:0006928,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007017,GO:0008150,GO:0008157,GO:0009987,GO:0010033,GO:0015630,GO:0016043,GO:0019899,GO:0019902,GO:0019903,GO:0022607,GO:0030030,GO:0030031,GO:0032526,GO:0033993,GO:0034622,GO:0035082,GO:0036064,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044441,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044782,GO:0048870,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051674,GO:0060271,GO:0060285,GO:0065003,GO:0070286,GO:0070925,GO:0071840,GO:0120025,GO:0120031,GO:0120036,GO:0120038,GO:1901700 ko:K19751 ko00000,ko04812 Metazoa 38HR9@33154,3BBM0@33208,KOG4356@1,KOG4356@2759 NA|NA|NA CH Required for cytoplasmic pre-assembly of axonemal dyneins, thereby playing a central role in motility in cilia and flagella. Involved in pre-assembly of dynein arm complexes in the cytoplasm before intraflagellar transport loads them for the ciliary compartment mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011275.5.1 27923.ML061717a-PA 2.2e-176 625.2 Metazoa UTP18 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ko:K14553 ko03008,map03008 ko00000,ko00001,ko03009 Metazoa 38E4F@33154,3BHQI@33208,KOG2055@1,KOG2055@2759 NA|NA|NA S maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011279.1.1 27923.ML15416a-PA 6.4e-09 67.8 Metazoa THOC2 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Methylation is not dependent on the nature of the nucleoside 5' of the target nucleoside. This is the first step in the biosynthesis of wybutosine (yW), a modified base adjacent to the anticodon of tRNAs and required for accurate decoding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011547.1.1 27923.ML09424a-PA 2.2e-28 131.3 Metazoa PLK1 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Catalyzes the first two steps of cap formation by removing the gamma-phosphate from the 5'-triphosphate end of nascent mRNA to yield a diphosphate end, and by transferring the gmp moiety of GTP to the 5'-diphosphate terminus mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011705.5.3 6087.XP_002163261.2 1.1e-12 80.1 Metazoa Metazoa 2C5JR@1,2SGHB@2759,3ADAC@33154,3BVHZ@33208 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011706.1.1 27923.ML17744a-PA 1.9e-25 122.9 Eukaryota Eukaryota KOG1056@1,KOG1056@2759 NA|NA|NA M G-protein coupled receptor activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011709.1.1 27923.ML003224a-PA 1.7e-17 95.9 Metazoa FZD5 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Has a role at an early stage in the morphogenesis of the spore coat mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011836.2.2 27923.ML14123a-PA 2.6e-79 301.6 Metazoa Fim GO:0003674,GO:0003779,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005856,GO:0005884,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007015,GO:0008092,GO:0008150,GO:0009987,GO:0015629,GO:0016043,GO:0022607,GO:0030029,GO:0030036,GO:0032432,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044085,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044877,GO:0051015,GO:0051017,GO:0051639,GO:0051764,GO:0061572,GO:0071840,GO:0097435,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099512,GO:0099513 ko:K17275,ko:K17276,ko:K17336 ko00000,ko03400,ko04147,ko04812 Metazoa 38BRY@33154,3BD6Z@33208,COG5069@1,KOG0046@2759 NA|NA|NA Z actin filament network formation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011839.7.1 27923.ML05822a-PA 3.3e-13 81.6 Eukaryota Eukaryota 2D6B3@1,2T1DN@2759 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011844.1.1 27923.ML35883a-PA 2.4e-27 127.5 Metazoa RAB2B GO:0000138,GO:0000139,GO:0000166,GO:0000323,GO:0001845,GO:0001882,GO:0001883,GO:0002119,GO:0002164,GO:0003674,GO:0003824,GO:0003924,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005525,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005764,GO:0005768,GO:0005769,GO:0005773,GO:0005794,GO:0005795,GO:0005802,GO:0006810,GO:0006873,GO:0006885,GO:0006897,GO:0006909,GO:0006996,GO:0007033,GO:0007040,GO:0007275,GO:0008150,GO:0009791,GO:0009987,GO:0010256,GO:0012505,GO:0016020,GO:0016043,GO:0016050,GO:0016192,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0017076,GO:0017111,GO:0017157,GO:0019001,GO:0019725,GO:0021700,GO:0022607,GO:0030003,GO:0030004,GO:0030139,GO:0030424,GO:0030641,GO:0031090,GO:0031410,GO:0031982,GO:0031984,GO:0031985,GO:0032386,GO:0032388,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032549,GO:0032550,GO:0032553,GO:0032555,GO:0032561,GO:0032879,GO:0033363,GO:0035639,GO:0036094,GO:0036477,GO:0040011,GO:0040012,GO:0040017,GO:0042592,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043025,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043204,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043277,GO:0044085,GO:0044297,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044431,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044456,GO:0044464,GO:0045202,GO:0045335,GO:0045851,GO:0045921,GO:0046662,GO:0048471,GO:0048518,GO:0048520,GO:0048522,GO:0048856,GO:0048878,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050795,GO:0050801,GO:0051046,GO:0051047,GO:0051049,GO:0051050,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051239,GO:0051240,GO:0051452,GO:0051453,GO:0055067,GO:0055080,GO:0055082,GO:0060341,GO:0060627,GO:0061792,GO:0065007,GO:0065008,GO:0070925,GO:0071840,GO:0080171,GO:0090325,GO:0090326,GO:0090382,GO:0090383,GO:0090386,GO:0090387,GO:0090390,GO:0097159,GO:0097367,GO:0097458,GO:0097708,GO:0098588,GO:0098657,GO:0098771,GO:0098791,GO:0098793,GO:0120025,GO:1901046,GO:1901265,GO:1901363,GO:1903530,GO:1903532,GO:1903649,GO:1903651,GO:1904809,GO:1904811,GO:1990502,GO:2000241,GO:2000243 ko:K07877,ko:K07878 ko04152,map04152 ko00000,ko00001,ko04031,ko04131,ko04147 Metazoa 38D6D@33154,3BB4T@33208,COG1100@1,KOG0098@2759 NA|NA|NA U member RAS oncogene family mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011849.1.1 27923.ML258225a-PA 5.1e-13 79.3 Metazoa SPCS2 GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005783,GO:0005787,GO:0005789,GO:0006465,GO:0006508,GO:0006518,GO:0006605,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006886,GO:0008104,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0010467,GO:0012505,GO:0015031,GO:0015833,GO:0016020,GO:0016485,GO:0019538,GO:0031984,GO:0032991,GO:0033036,GO:0033365,GO:0034613,GO:0034641,GO:0042175,GO:0042886,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043603,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044432,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045047,GO:0045184,GO:0046907,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051604,GO:0051641,GO:0051649,GO:0070727,GO:0070972,GO:0071702,GO:0071704,GO:0071705,GO:0072594,GO:0072599,GO:0098796,GO:0098827,GO:1901564,GO:1902494,GO:1905368 ko:K12947 ko03060,map03060 ko00000,ko00001,ko01000 Metazoa 396SW@33154,3BFBV@33208,KOG4072@1,KOG4072@2759 NA|NA|NA U signal peptide processing mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011850.1.1 27923.ML02442a-PA 2.1e-10 70.9 Metazoa 3.5.1.98 ko:K11406 ko04371,ko05034,ko05165,ko05169,ko05203,map04371,map05034,map05165,map05169,map05203 ko00000,ko00001,ko01000,ko03036 Metazoa 38BSE@33154,3B9NQ@33208,COG0123@1,KOG1343@2759 NA|NA|NA B Responsible for the deacetylation of lysine residues on the N-terminal part of the core histones (H2A, H2B, H3 and H4). Histone deacetylation gives a tag for epigenetic repression and plays an important role in transcriptional regulation, cell cycle progression and developmental events mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000011852.5.1 27923.ML38524a-PA 6.6e-218 763.5 Metazoa PRIM2 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inhibitor activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000012323.1.1 27923.ML069711a-PA 1.1e-193 684.1 Eukaryota Eukaryota KOG1215@1,KOG1215@2759 NA|NA|NA G endocytosis mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000012323.3.1 27923.ML00909a-PA 6.5e-19 99.4 Opisthokonta Opisthokonta 3A1VA@33154,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA S Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000012326.1.1 27923.ML017946a-PA 3.3e-31 140.6 Metazoa COPE 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further mediate biosynthetic protein transport from the ER, via the Golgi up to the trans Golgi network. The coatomer complex is required for budding from Golgi membranes, and is essential for the retrograde Golgi-to-ER transport of dilysine-tagged proteins mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000012328.1.1 27923.ML154126a-PA 9.2e-151 540.4 Metazoa 1.5.5.3 ko:K11394 ko00330,ko01100,map00330,map01100 R03295 RC00054 ko00000,ko00001,ko01000 Metazoa 38CE6@33154,3BE50@33208,COG0506@1,KOG0186@2759 NA|NA|NA E proline dehydrogenase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000012329.4.1 27923.ML05979a-PA 9.4e-199 700.3 Eukaryota Eukaryota 2D4VM@1,2SWG0@2759 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000012332.1.1 27923.ML00633a-PA 2.3e-08 64.7 Metazoa DDX11 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Mediator functions as a bridge to convey information from gene-specific regulatory proteins to the basal RNA polymerase II transcription machinery. Mediator is recruited to promoters by direct interactions with regulatory proteins and serves as a scaffold for the assembly of a functional preinitiation complex with RNA polymerase II and the general transcription factors mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000012342.1.2 27923.ML10376a-PA 2.6e-127 461.5 Eukaryota Eukaryota COG5023@1,KOG1376@2759 NA|NA|NA Z structural constituent of cytoskeleton mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000012346.2.1 27923.ML064936a-PA 2.6e-58 233.0 Metazoa SMC3 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It is involved in the biological process described with proteolysis mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000012436.1.1 27923.ML096819a-PA 2.8e-41 174.1 Metazoa NCALD 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Required for flavinylation (covalent attachment of FAD) of the flavoprotein subunit mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000012502.1.1 27923.ML008316a-PA 1.5e-10 70.9 Metazoa MIOX 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mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000013291.1.1 27923.ML351743a-PA 1.5e-15 89.0 Eukaryota 1.14.14.19,1.14.14.32 ko:K00512,ko:K10448 ko00140,ko01100,ko04913,ko04917,ko04927,ko04934,map00140,map01100,map04913,map04917,map04927,map04934 M00109,M00110 R02211,R03783,R04852,R04853,R08517,R08518 RC00607,RC00660,RC00923,RC01222 ko00000,ko00001,ko00002,ko00199,ko01000,ko04121 Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000013291.2.1 27923.ML050821a-PA 4.6e-44 184.5 Metazoa Metazoa 38F42@33154,3BA5H@33208,COG2801@1,KOG0017@2759 NA|NA|NA OU K02A2.6-like mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000013292.1.1 27923.ML1541131a-PA 7e-157 560.8 Metazoa Metazoa 3AB3G@33154,3BQKC@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA O Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000013292.5.1 27923.ML00251a-PA 1.1e-50 207.2 Metazoa Metazoa 2S7Z5@2759,39MP6@33154,3CP9H@33208,COG0507@1 NA|NA|NA L A helicase nuclease that prepares dsDNA breaks (DSB) for recombinational DNA repair. Binds to DSBs and unwinds DNA via a highly rapid and processive ATP-dependent bidirectional helicase activity. Unwinds dsDNA until it encounters a Chi (crossover hotspot instigator) sequence from the 3' direction. Cuts ssDNA a few nucleotides 3' to the Chi site. The properties and activities of the enzyme are changed at Chi. The Chi-altered holoenzyme produces a long 3'-ssDNA overhang and facilitates RecA-binding to the ssDNA for homologous DNA recombination and repair. Holoenzyme degrades any linearized DNA that is unable to undergo homologous recombination. In the holoenzyme this subunit has ssDNA-dependent ATPase and 5'-3' helicase activity. When added to pre-assembled RecBC greatly stimulates nuclease activity and augments holoenzyme processivity. Negatively regulates the RecA-loading ability of RecBCD mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000013298.1.1 27923.ML070211a-PA 6.2e-114 417.9 Metazoa Metazoa 38E1X@33154,3BA48@33208,COG2126@1,KOG1545@2759 NA|NA|NA J voltage-gated potassium channel activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000013304.1.1 7029.ACYPI36210-PA 3e-11 75.5 Bilateria Metazoa 2CYJA@1,2S4S7@2759,3A62Z@33154,3BTAY@33208,3E403@33213 NA|NA|NA S MULE transposase domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000013312.1.1 27923.ML10953a-PA 7.1e-29 133.7 Metazoa Metazoa 3AFF1@33154,3BX0N@33208,COG5126@1,KOG0027@2759 NA|NA|NA T TIR domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000013313.2.1 27923.ML00161a-PA 2.6e-10 71.2 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000013314.1.1 27923.ML05236a-PA 1.2e-109 402.9 Metazoa RACGAP1 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release, gene expression, cell motility, cell division and cell death. The isoform alpha-1C gives rise to L-type calcium currents. Long-lasting (L-type) calcium channels belong to the 'high-voltage activated' (HVA) group. They are blocked by dihydropyridines (DHP), phenylalkylamines, benzothiazepines, and by omega-agatoxin-IIIA (omega-Aga-IIIA). They are however insensitive to omega-conotoxin- GVIA (omega-CTx-GVIA) and omega-agatoxin-IVA (omega-Aga-IVA). Calcium channels containing the alpha-1C subunit play an important role in excitation-contraction coupling in the heart. Binding of calmodulin or CABP1 at the same regulatory sites results in an opposit effects on the channel function mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000013722.1.1 27923.ML23064a-PA 4e-204 718.0 Metazoa TCF25 GO:0000122,GO:0003674,GO:0003700,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0006355,GO:0006357,GO:0007275,GO:0007507,GO:0008150,GO:0009889,GO:0009890,GO:0009892,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010558,GO:0010605,GO:0010629,GO:0019219,GO:0019222,GO:0031323,GO:0031324,GO:0031326,GO:0031327,GO:0032501,GO:0032502,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044424,GO:0044464,GO:0045892,GO:0045934,GO:0048513,GO:0048519,GO:0048523,GO:0048731,GO:0048856,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051172,GO:0051252,GO:0051253,GO:0060255,GO:0065007,GO:0072359,GO:0080090,GO:0140110,GO:1902679,GO:1903506,GO:1903507,GO:2000112,GO:2000113,GO:2001141 Metazoa 38C0W@33154,3BFX6@33208,KOG2422@1,KOG2422@2759 NA|NA|NA Z negative regulation of transcription by RNA polymerase II 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3AS6D@33154,KOG4475@1,KOG4475@2759 NA|NA|NA T C-type lectin (CTL) or carbohydrate-recognition domain (CRD) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000013961.1.1 27923.ML34051a-PA 2.7e-10 70.9 Metazoa Metazoa 38VTY@33154,3BWAP@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA S Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000013965.1.1 27923.ML071123a-PA 1.6e-19 101.7 Eukaryota EXOC4 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It is involved in the biological process described with regulation of transcription, DNA-templated mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000014145.1.1 27923.ML095316a-PA 1.1e-23 116.7 Metazoa LRRC1 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coactivator involved in the regulated transcription of nearly all RNA polymerase II-dependent genes. Mediator functions as a bridge to convey information from gene-specific regulatory proteins to the basal RNA polymerase II transcription machinery. Mediator is recruited to promoters by direct interactions with regulatory proteins and serves as a scaffold for the assembly of a functional preinitiation complex with RNA polymerase II and the general transcription factors mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000014635.2.1 27923.ML00082a-PA 1.1e-25 122.1 Metazoa Metazoa 38C07@33154,3BF1N@33208,KOG1924@1,KOG1925@2759 NA|NA|NA TZ formin homology 2 domain containing mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000014637.3.1 10228.TriadP59069 3.1e-10 72.8 Metazoa CCDC74B Metazoa 2B8WQ@1,2S0SP@2759,3A1M5@33154,3BQNZ@33208 NA|NA|NA S Coiled-coil domain-containing protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000014641.1.1 27923.ML086434a-PA 4.1e-51 207.2 Metazoa CMPK1 GO:0000003,GO:0003674,GO:0003824,GO:0004127,GO:0004550,GO:0004849,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006082,GO:0006139,GO:0006165,GO:0006206,GO:0006207,GO:0006213,GO:0006220,GO:0006221,GO:0006222,GO:0006225,GO:0006227,GO:0006240,GO:0006725,GO:0006753,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009041,GO:0009058,GO:0009112,GO:0009116,GO:0009117,GO:0009119,GO:0009123,GO:0009124,GO:0009129,GO:0009130,GO:0009132,GO:0009133,GO:0009138,GO:0009139,GO:0009141,GO:0009142,GO:0009156,GO:0009161,GO:0009163,GO:0009165,GO:0009173,GO:0009174,GO:0009185,GO:0009186,GO:0009188,GO:0009189,GO:0009193,GO:0009194,GO:0009196,GO:0009197,GO:0009218,GO:0009219,GO:0009220,GO:0009221,GO:0009259,GO:0009260,GO:0009262,GO:0009263,GO:0009265,GO:0009394,GO:0009987,GO:0015949,GO:0016301,GO:0016310,GO:0016740,GO:0016772,GO:0016776,GO:0018130,GO:0018963,GO:0019205,GO:0019206,GO:0019438,GO:0019637,GO:0019692,GO:0019693,GO:0019752,GO:0019856,GO:0022414,GO:0022602,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032501,GO:0032504,GO:0033862,GO:0034404,GO:0034641,GO:0034654,GO:0036430,GO:0042455,GO:0042537,GO:0042698,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0043436,GO:0043648,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044271,GO:0044281,GO:0044283,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046048,GO:0046049,GO:0046062,GO:0046077,GO:0046112,GO:0046131,GO:0046132,GO:0046134,GO:0046385,GO:0046390,GO:0046483,GO:0046704,GO:0046705,GO:0046939,GO:0046940,GO:0048511,GO:0048609,GO:0050145,GO:0055086,GO:0070013,GO:0071704,GO:0072527,GO:0072528,GO:0090407,GO:1901135,GO:1901137,GO:1901293,GO:1901360,GO:1901362,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1901657,GO:1901659 2.7.4.14 ko:K13800 ko00240,ko00983,ko01100,map00240,map00983,map01100 M00052 R00158,R00512,R01665,R11891,R11892 RC00002 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Metazoa 38HJ3@33154,3BD3B@33208,COG0563@1,KOG3079@2759 NA|NA|NA F Catalyzes the phosphorylation of pyrimidine nucleoside monophosphates at the expense of ATP. 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further mediate biosynthetic protein transport from the ER, via the Golgi up to the trans Golgi network. The coatomer complex is required for budding from Golgi membranes, and is essential for the retrograde Golgi-to-ER transport of dilysine-tagged proteins mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000014984.2.1 27923.ML000123a-PA 4.6e-16 90.1 Metazoa CDC37 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3.4.19.12 ko:K11844 ko00000,ko01000,ko01002,ko04121 Metazoa 38DXM@33154,3BD1W@33208,COG5560@1,KOG1873@2759 NA|NA|NA O Specifically deubiquitinates 'Lys-120' of histone H2A (H2AK119Ub), a specific tag for epigenetic transcriptional repression, thereby acting as a coactivator. Deubiquitination of histone H2A is a prerequisite for subsequent phosphorylation at 'Ser-11' of histone H3 (H3S10ph), and is required for chromosome segregation when cells enter into mitosis. In resting B- and T- lymphocytes, phosphorylation by AURKB leads to enhance its activity, thereby maintaining transcription in resting lymphocytes. Regulates Hox gene expression via histone H2A deubiquitination. Prefers nucleosomal substrates. Does not deubiquitinate histone H2B mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000015576.1.1 27923.ML046517a-PA 2.4e-36 158.3 Metazoa ENKUR GO:0001669,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005929,GO:0012505,GO:0030141,GO:0031410,GO:0031514,GO:0031982,GO:0036126,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044441,GO:0044444,GO:0044463,GO:0044464,GO:0097223,GO:0097228,GO:0097708,GO:0097729,GO:0099503,GO:0120025,GO:0120038 Metazoa 28KS9@1,2QT8E@2759,38BHH@33154,3BIXD@33208 NA|NA|NA S calmodulin binding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000015579.1.1 27923.ML01141a-PA 3.4e-224 785.4 Metazoa Metazoa 2CN0N@1,2QT5H@2759,38HD6@33154,3BNTW@33208 NA|NA|NA S nucleic acid binding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000015588.1.1 27923.ML025019a-PA 2.1e-48 198.7 Metazoa Metazoa 3A6JR@33154,3BSTD@33208,COG5025@1,KOG2294@2759 NA|NA|NA K Forkhead associated domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000015589.1.1 27923.ML19853a-PA 6.2e-44 184.9 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3.6.4.13 ko:K11273 ko00000,ko01000,ko03036 Metazoa 38BI6@33154,3BCM0@33208,COG1199@1,KOG1075@1,KOG1075@2759,KOG1133@2759 NA|NA|NA L helicase mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000015817.1.1 27923.ML26668a-PA 2.6e-78 300.1 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000015817.4.1 27923.ML00251a-PA 4.6e-70 271.9 Metazoa Metazoa 2S7Z5@2759,39MP6@33154,3CP9H@33208,COG0507@1 NA|NA|NA L A helicase nuclease that prepares dsDNA breaks (DSB) for recombinational DNA repair. Binds to DSBs and unwinds DNA via a highly rapid and processive ATP-dependent bidirectional helicase activity. Unwinds dsDNA until it encounters a Chi (crossover hotspot instigator) sequence from the 3' direction. Cuts ssDNA a few nucleotides 3' to the Chi site. The properties and activities of the enzyme are changed at Chi. The Chi-altered holoenzyme produces a long 3'-ssDNA overhang and facilitates RecA-binding to the ssDNA for homologous DNA recombination and repair. Holoenzyme degrades any linearized DNA that is unable to undergo homologous recombination. In the holoenzyme this subunit has ssDNA-dependent ATPase and 5'-3' helicase activity. When added to pre-assembled RecBC greatly stimulates nuclease activity and augments holoenzyme processivity. Negatively regulates the RecA-loading ability of RecBCD mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000015818.1.1 27923.ML267517a-PA 1.6e-97 363.2 Eukaryota Eukaryota 2D0AB@1,2SDEB@2759 NA|NA|NA S zinc finger mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000015818.7.1 303518.XP_005755538.1 1.2e-124 454.5 Actinopterygii Metazoa 39N4Q@33154,3C0YC@33208,3DH14@33213,48RUJ@7711,49N81@7742,4A97P@7898,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA S RNA-directed DNA polymerase from mobile element jockey-like mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000015821.1.1 27923.ML04792a-PA 3.9e-40 171.0 Metazoa ASXL2 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Metazoa 38C2H@33154,3BB4C@33208,COG5083@1,KOG3668@2759 NA|NA|NA S phosphatidylinositol transporter activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000016045.2.1 27923.ML00662a-PA 3.5e-31 141.4 Metazoa Metazoa 3AK7D@33154,3BPZQ@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA T Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000016046.1.3 926551.KB900737_gene384 1.8e-40 172.9 Flavobacteriia uxuA 4.2.1.8 ko:K01686 ko00040,ko01100,map00040,map01100 M00061 R05606 RC00543 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000 Bacteria 1HY45@117743,4NFA5@976,COG1312@1,COG1312@2 NA|NA|NA G Catalyzes the dehydration of D-mannonate mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000016048.1.1 27923.ML21725a-PA 4.2e-67 261.9 Metazoa GO:0000003,GO:0008150 3.1.13.4 ko:K12571 ko03018,map03018 ko00000,ko00001,ko01000,ko03019 Metazoa 38FWC@33154,3BECH@33208,COG0847@1,KOG1275@2759 NA|NA|NA L Catalytic subunit of the poly(A)-nuclease (PAN) deadenylation complex, one of two cytoplasmic mRNA deadenylases involved in general and miRNA-mediated mRNA turnover. PAN specifically shortens poly(A) tails of RNA and the activity is stimulated by poly(A)-binding protein (PABP). PAN deadenylation is followed by rapid degradation of the shortened mRNA tails by the CCR4-NOT complex. Deadenylated mRNAs are then degraded by two alternative mechanisms, namely exosome-mediated 3'-5' exonucleolytic degradation, or deadenlyation-dependent mRNA decaping and subsequent 5'-3' exonucleolytic degradation by XRN1 mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000016049.4.1 27923.ML21009a-PA 2.7e-95 355.5 Metazoa 2.8.2.21 ko:K01022 ko00533,map00533 ko00000,ko00001,ko01000,ko01003 Metazoa 299AF@1,2S17I@2759,38N40@33154,3B97B@33208 NA|NA|NA O Belongs to the sulfotransferase 1 family mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000016051.1.11 663610.JQKO01000014_gene1987 3.3e-10 72.4 Beijerinckiaceae dnaJ GO:0006457,GO:0008150,GO:0009987 ko:K03686 ko00000,ko03029,ko03110 Bacteria 1MVMS@1224,2TRZ1@28211,3NA3A@45404,COG0484@1,COG0484@2 NA|NA|NA O ATP binding to DnaK triggers the release of the substrate protein, thus completing the reaction cycle. Several rounds of ATP-dependent interactions between DnaJ, DnaK and GrpE are required for fully efficient folding. Also involved, together with DnaK and GrpE, in the DNA replication of plasmids through activation of initiation proteins mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000016057.1.1 27923.ML07694a-PA 1.9e-26 126.3 Metazoa TTC28 GO:0000922,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005813,GO:0005815,GO:0005819,GO:0005856,GO:0007346,GO:0008150,GO:0015630,GO:0019899,GO:0019900,GO:0030496,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044446,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051233,GO:0051726,GO:0065007,GO:0072686,GO:0097431,GO:1990023 Metazoa 38GAN@33154,3BEXQ@33208,COG0457@1,KOG0548@2759 NA|NA|NA O regulation of mitotic cell cycle mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000016062.1.1 27923.ML14737a-PA 5.4e-140 503.8 Metazoa fer-1 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KOG1836@1,KOG1836@2759 NA|NA|NA O biological adhesion mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000016065.1.1 27923.ML12866a-PA 4.9e-73 282.3 Metazoa Metazoa 3AB3G@33154,3BQKC@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA O Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000016066.1.1 27923.ML010118a-PA 8.7e-57 226.5 Metazoa GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003725,GO:0005488,GO:0097159,GO:1901363 Metazoa 2BZCQ@1,2QPQ7@2759,38EHM@33154,3BCWY@33208 NA|NA|NA S RS domain binding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000016068.1.1 27923.ML047931a-PA 3.2e-11 73.9 Metazoa STIM2 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The isoform alpha-1C gives rise to L-type calcium currents. Long-lasting (L-type) calcium channels belong to the 'high-voltage activated' (HVA) group. They are blocked by dihydropyridines (DHP), phenylalkylamines, benzothiazepines, and by omega-agatoxin-IIIA (omega-Aga-IIIA). They are however insensitive to omega-conotoxin- GVIA (omega-CTx-GVIA) and omega-agatoxin-IVA (omega-Aga-IVA). Calcium channels containing the alpha-1C subunit play an important role in excitation-contraction coupling in the heart. Binding of calmodulin or CABP1 at the same regulatory sites results in an opposit effects on the channel function mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000016197.3.1 27923.ML128220a-PA 0.0 1126.7 Metazoa UBE4B 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Eukaryota KOG4301@1,KOG4301@2759 NA|NA|NA S zinc ion binding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000017611.1.1 27923.ML03452a-PA 2.2e-07 61.6 Metazoa DENND5A 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Metazoa 39RVH@33154,3BANC@33208,COG5275@1,KOG1968@2759 NA|NA|NA O negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000017642.1.1 27923.ML06406a-PA 1.6e-59 236.5 Eukaryota Eukaryota KOG1052@1,KOG1052@2759 NA|NA|NA U ionotropic glutamate receptor activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000017645.1.1 27923.ML074240a-PA 3.8e-12 79.3 Metazoa ko:K09203 ko04371,ko04933,ko05020,ko05166,map04371,map04933,map05020,map05166 ko00000,ko00001,ko03000 Metazoa 398KZ@33154,3BH2K@33208,KOG1721@1,KOG1721@2759 NA|NA|NA K positive regulation of glomerular metanephric mesangial cell proliferation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000017647.1.1 27923.ML07893a-PA 3.4e-18 97.1 Metazoa Metazoa 39N4Q@33154,3B9WN@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA G Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000017647.18.1 27923.ML10001a-PA 0.0 1466.1 Metazoa MCM2 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28NA6@1,2QUVK@2759,397I5@33154,3BM1R@33208 NA|NA|NA S Chromosome X open reading frame 58 mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000017828.10.1 27923.ML062240a-PA 1.6e-141 508.8 Metazoa RSPH9 GO:0000226,GO:0001539,GO:0001578,GO:0003341,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005856,GO:0005929,GO:0005930,GO:0006928,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007017,GO:0007018,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0022607,GO:0030030,GO:0030031,GO:0031514,GO:0032421,GO:0032838,GO:0035082,GO:0040011,GO:0042995,GO:0043005,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044085,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044441,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044458,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044782,GO:0048870,GO:0051179,GO:0051674,GO:0060091,GO:0060271,GO:0060285,GO:0060294,GO:0070925,GO:0071840,GO:0097014,GO:0097458,GO:0097729,GO:0097730,GO:0097732,GO:0098862,GO:0099568,GO:0120025,GO:0120031,GO:0120036,GO:0120038 ko:K19757 ko00000,ko04812 Metazoa 2C9RZ@1,2QR99@2759,393AT@33154,3BCMV@33208 NA|NA|NA S cilium movement involved 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5.2e-07 60.1 Diptera ko:K14616 ko04977,map04977 ko00000,ko00001,ko04147 Arthropoda 3949K@33154,3BGFY@33208,3CUBZ@33213,3SJ5A@50557,41X03@6656,44XJF@7147,KOG4292@1,KOG4292@2759 NA|NA|NA T It is involved in the biological process described with receptor-mediated endocytosis mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000017990.4.1 27923.ML21407a-PA 2.8e-85 322.0 Metazoa Metazoa 3AQ3U@33154,3C365@33208,KOG2191@1,KOG2191@2759 NA|NA|NA A K homology RNA-binding domain mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000017992.1.1 27923.ML003265a-PA 4.9e-71 275.0 Eukaryota ko:K04630,ko:K04634 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38UEK@33154,3BBXZ@33208,COG2303@1,KOG1238@2759 NA|NA|NA C choline dehydrogenase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000018003.1.1 27923.ML169011a-PA 3.5e-61 242.3 Opisthokonta Opisthokonta 3ARWJ@33154,KOG3656@1,KOG3656@2759 NA|NA|NA S C-type lectin (CTL) or carbohydrate-recognition domain (CRD) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000018009.1.1 27923.ML270538a-PA 1.8e-95 355.9 Metazoa ASZ1 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gamete generation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000018014.3.1 27923.ML26178a-PA 1.8e-149 535.4 Metazoa DIMT1 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38G8W@33154,3B9Q8@33208,3CVHS@33213,41V3B@6656,COG0666@1,KOG0504@2759,KOG4582@1,KOG4582@2759 NA|NA|NA O It is involved in the biological process described with protein ubiquitination mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000018305.2.1 27923.ML434313a-PA 5.8e-51 207.6 Eukaryota ko:K21444 ko00000,ko03019 Eukaryota KOG2190@1,KOG2190@2759 NA|NA|NA S C-rich single-stranded DNA binding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000018308.1.1 27923.ML048113a-PA 1e-132 480.3 Metazoa FAM188B ko:K09864 ko04924,ko04964,ko04976,map04924,map04964,map04976 ko00000,ko00001,ko02000,ko04147 1.A.8.8 Metazoa 38GJD@33154,3BETJ@33208,KOG2871@1,KOG2871@2759 NA|NA|NA U Family with sequence similarity 188, member B mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000018312.3.1 27923.ML14119a-PA 2.8e-126 459.1 Eukaryota KBTBD4 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Seems to contact the mother actin filament mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000018623.2.1 27923.ML068126a-PA 3.4e-47 196.4 Metazoa ko:K20407 ko04150,map04150 ko00000,ko00001 Metazoa 38BEP@33154,3BBBG@33208,KOG1008@1,KOG1008@2759 NA|NA|NA S response to amino acid starvation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000018624.1.1 27923.ML34221a-PA 2.7e-22 114.4 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000018624.2.1 27923.ML05866a-PA 2e-13 81.3 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000018625.1.2 27923.ML022012a-PA 5.3e-131 474.2 Eukaryota Eukaryota KOG1216@1,KOG1216@2759 NA|NA|NA S sensory perception of sound mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000018626.1.1 27923.ML03006a-PA 1.1e-62 246.9 Metazoa JPH3 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ko:K19530 ko00000 Metazoa 38BJX@33154,3BCF0@33208,COG4642@1,KOG0231@2759 NA|NA|NA S regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000018627.1.1 27923.ML26792a-PA 1.7e-22 112.8 Opisthokonta Opisthokonta 39TZY@33154,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA I queuine tRNA-ribosyltransferase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000018628.1.1 27923.ML030513a-PA 5e-48 197.2 Metazoa ERAP1 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ko00000,ko00001,ko03036,ko04090,ko04091,ko04131,ko04812 Eukaryota COG1404@1,KOG1153@2759,KOG1216@1,KOG1216@2759 NA|NA|NA O serine-type endopeptidase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000019110.1.1 27923.ML14396a-PA 3.8e-59 234.6 Metazoa DPH6 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NA|NA|NA J diphthine-ammonia ligase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000019113.1.2 34740.HMEL016738-PA 1.2e-20 106.7 Lepidoptera GO:0003674,GO:0003824,GO:0004518,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005783,GO:0006139,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006810,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0012505,GO:0015791,GO:0015798,GO:0015850,GO:0016787,GO:0016788,GO:0034641,GO:0042578,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044464,GO:0046483,GO:0051179,GO:0051234,GO:0071702,GO:0071704,GO:0090304,GO:0090305,GO:1901360 ko:K05294 ko00563,ko01100,map00563,map01100 ko00000,ko00001,ko01000 Arthropoda 397RS@33154,3B9DS@33208,3D23S@33213,3SG0G@50557,41VFP@6656,441K3@7088,KOG3724@1,KOG3724@2759 NA|NA|NA U hydrolase activity, acting on ester bonds. It is involved in the biological process described with mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000019114.1.1 7739.XP_002605134.1 4.9e-29 134.4 Chordata KIAA1841 Metazoa 28J1Y@1,2QRE4@2759,38CJC@33154,3BBN2@33208,3D13N@33213,487F1@7711 NA|NA|NA S Domain of unknown function (DUF3342) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000019119.1.1 27923.ML00451a-PA 1.6e-32 145.6 Metazoa 2.3.2.26 ko:K10595 ko04120,map04120 ko00000,ko00001,ko01000,ko03036,ko03400,ko04121 Metazoa 38ETC@33154,3BIJT@33208,COG5184@1,KOG1075@1,KOG1075@2759,KOG1426@2759 NA|NA|NA O SUMO binding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000019122.6.1 27923.ML032214a-PA 1e-07 62.4 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000019124.1.2 27923.ML017925a-PA 9.3e-41 173.7 Metazoa KRI1 GO:0000447,GO:0000460,GO:0000462,GO:0000466,GO:0000469,GO:0000478,GO:0000479,GO:0002376,GO:0002520,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005730,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006725,GO:0006807,GO:0007275,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016072,GO:0022613,GO:0030097,GO:0030490,GO:0030684,GO:0030686,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032991,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042254,GO:0042274,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044446,GO:0044464,GO:0046483,GO:0048513,GO:0048534,GO:0048731,GO:0048856,GO:0060216,GO:0070013,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0090305,GO:0090501,GO:0090502,GO:1901360,GO:1990904 ko:K14786 ko00000,ko03009 Metazoa 38D56@33154,3BE8G@33208,KOG2409@1,KOG2409@2759 NA|NA|NA J endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000019125.1.1 51511.ENSCSAVP00000011526 4.5e-12 77.8 Chordata KIF4A GO:0000003,GO:0000022,GO:0000070,GO:0000226,GO:0000228,GO:0000278,GO:0000280,GO:0000281,GO:0000793,GO:0000794,GO:0000819,GO:0000910,GO:0002376,GO:0002478,GO:0002495,GO:0002504,GO:0003674,GO:0003774,GO:0003777,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005576,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005694,GO:0005737,GO:0005818,GO:0005819,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005871,GO:0005874,GO:0005875,GO:0005876,GO:0006139,GO:0006259,GO:0006310,GO:0006323,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006810,GO:0006890,GO:0006928,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007017,GO:0007018,GO:0007049,GO:0007051,GO:0007052,GO:0007059,GO:0007088,GO:0007110,GO:0007127,GO:0007131,GO:0007140,GO:0007143,GO:0007276,GO:0007292,GO:0007338,GO:0007346,GO:0008017,GO:0008088,GO:0008089,GO:0008092,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008574,GO:0009566,GO:0009987,GO:0010032,GO:0010564,GO:0010970,GO:0015630,GO:0015631,GO:0016043,GO:0016192,GO:0016321,GO:0016363,GO:0016462,GO:0016787,GO:0016817,GO:0016818,GO:0016887,GO:0017111,GO:0019882,GO:0019884,GO:0019886,GO:0019953,GO:0022402,GO:0022412,GO:0022414,GO:0022607,GO:0030261,GO:0030496,GO:0030705,GO:0031974,GO:0031981,GO:0032501,GO:0032504,GO:0032991,GO:0033043,GO:0033206,GO:0034399,GO:0034641,GO:0035825,GO:0042623,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043232,GO:0043233,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044421,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044428,GO:0044430,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0044703,GO:0045132,GO:0045171,GO:0046483,GO:0046907,GO:0048002,GO:0048193,GO:0048232,GO:0048285,GO:0048609,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051128,GO:0051179,GO:0051225,GO:0051231,GO:0051233,GO:0051234,GO:0051255,GO:0051256,GO:0051257,GO:0051276,GO:0051301,GO:0051321,GO:0051641,GO:0051649,GO:0051704,GO:0051726,GO:0051783,GO:0061640,GO:0061982,GO:0065007,GO:0070013,GO:0070192,GO:0070925,GO:0071103,GO:0071704,GO:0071840,GO:0090304,GO:0090307,GO:0098813,GO:0098930,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099111,GO:0099512,GO:0099513,GO:0140013,GO:0140014,GO:1901360,GO:1902850,GO:1903046,GO:1903047,GO:1990939 ko:K10395 ko00000,ko04812 Metazoa 38CGP@33154,3BH72@33208,3CVXT@33213,486AV@7711,COG5059@1,KOG0244@2759 NA|NA|NA Z Belongs to the TRAFAC class myosin-kinesin ATPase superfamily. 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It is involved in the biological process described with proteolysis mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000019439.1.3 27923.ML104627a-PA 3.8e-23 115.5 Opisthokonta MED18 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that catalyzes the GTP-dependent ribosomal translocation step during translation elongation. 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Coatomer complex is required for budding from Golgi membranes, and is essential for the retrograde Golgi-to-ER transport of dilysine-tagged proteins mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000019986.1.1 28377.ENSACAP00000019449 1.5e-25 123.2 Metazoa Metazoa 3AK2I@33154,3C01I@33208,COG0708@1,KOG1294@2759 NA|NA|NA L Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000019989.1.1 27923.ML08883a-PA 3.8e-150 538.5 Metazoa Metazoa 3AB3G@33154,3BQKC@33208,KOG0977@1,KOG0977@2759,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA O Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000020001.2.1 45351.EDO35261 2.1e-154 553.5 Metazoa Metazoa 2E24P@1,2S9D9@2759,3A6X8@33154,3BYHR@33208 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000020002.3.1 27923.ML214319a-PA 7.2e-83 313.5 Metazoa DEF8 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osmoprotectant glycine betaine. Catalyzes the oxidation of choline to betaine aldehyde and betaine aldehyde to glycine betaine at the same rate mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000020319.3.1 27923.ML063916a-PA 1.5e-11 75.5 Eukaryota 3.6.3.1 ko:K14802 ko00000,ko01000,ko03009 3.A.3.8 Eukaryota COG2114@1,KOG4171@2759 NA|NA|NA T guanylate cyclase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000020320.1.1 27923.ML00115a-PA 5.9e-213 747.3 Metazoa DUS3L GO:0002943,GO:0003674,GO:0003824,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008033,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0016070,GO:0016491,GO:0016627,GO:0017150,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0043170,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0046483,GO:0055114,GO:0071704,GO:0090304,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360 1.3.1.89 ko:K05544 ko00000,ko01000,ko03016 Metazoa 38F5X@33154,3BFFI@33208,COG0042@1,KOG2333@2759 NA|NA|NA J tRNA dihydrouridine synthase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000020322.1.1 400682.PAC_15728018 3.5e-15 88.6 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This endoplasmic reticulum- bound enzymatic process, allows the addition of two carbons to the chain of long- and very long-chain fatty acids VLCFAs per cycle. This enzyme catalyzes the dehydration of the 3-hydroxyacyl-CoA intermediate into trans-2,3-enoyl-CoA, within each cycle of fatty acid elongation. Thereby, it participates to the production of VLCFAs of different chain lengths that are involved in multiple biological processes as precursors of membrane lipids and lipid mediators mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000020840.1.1 27923.ML030417a-PA 5.5e-88 332.4 Metazoa Metazoa 3AB3G@33154,3BQKC@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA O Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000020843.1.1 27923.ML14875a-PA 1.4e-212 746.1 Metazoa 3.4.24.80 ko:K07763 ko04668,ko04912,map04668,map04912 ko00000,ko00001,ko01000,ko01002 Metazoa 38CRR@33154,3B9IY@33208,KOG1565@1,KOG1565@2759 NA|NA|NA O Belongs to the peptidase M10A family mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000020844.1.1 27923.ML21009a-PA 1.3e-42 180.6 Metazoa 2.8.2.21 ko:K01022 ko00533,map00533 ko00000,ko00001,ko01000,ko01003 Metazoa 299AF@1,2S17I@2759,38N40@33154,3B97B@33208 NA|NA|NA O Belongs to the sulfotransferase 1 family mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000020846.1.1 27923.ML00882a-PA 2.7e-57 228.4 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Source PGD mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000021223.1.1 27923.ML085030a-PA 4.8e-38 163.7 Metazoa GNPTAB 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PAN specifically shortens poly(A) tails of RNA and the activity is stimulated by poly(A)-binding protein (PABP). PAN deadenylation is followed by rapid degradation of the shortened mRNA tails by the CCR4-NOT complex. Deadenylated mRNAs are then degraded by two alternative mechanisms, namely exosome-mediated 3'-5' exonucleolytic degradation, or deadenlyation-dependent mRNA decaping and subsequent 5'-3' exonucleolytic degradation by XRN1 mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000021275.2.1 27923.ML08592a-PA 5.4e-09 67.8 Opisthokonta Opisthokonta 3A8WV@33154,KOG1121@1,KOG1121@2759 NA|NA|NA L hAT family C-terminal dimerisation region mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000021276.1.1 27923.ML14272a-PA 1.9e-204 718.8 Metazoa NAE1 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It is involved in the biological process described with sulfate transport mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000022217.8.3 27923.ML035918a-PA 1.8e-114 420.6 Opisthokonta ko:K14613,ko:K20840 ko01523,map01523 ko00000,ko00001,ko02000 2.A.1.50.1,2.A.1.50.3,2.A.1.50.4 Opisthokonta 39BA6@33154,KOG2816@1,KOG2816@2759 NA|NA|NA O folate import across plasma membrane mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000022220.1.1 27923.ML04111a-PA 3e-146 526.9 Metazoa Metazoa 39N4Q@33154,3BPSU@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA IQ Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000022226.2.1 27923.ML17562a-PA 1.5e-44 185.3 Metazoa KCNK9 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superfamily mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000022239.3.1 27923.ML05792a-PA 5.7e-14 84.7 Eukaryota 2.4.1.41 ko:K00710 ko00512,ko01100,map00512,map01100 M00056 R05907 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01003 GT27 Eukaryota KOG3736@1,KOG3736@2759 NA|NA|NA M polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000022242.1.1 27923.ML146510a-PA 4.8e-11 74.3 Metazoa ko:K21879 ko00000,ko03036 Metazoa 2CXDN@1,2RX0K@2759,38W8Y@33154,3BU4G@33208 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000022243.1.1 27923.ML45844a-PA 1.3e-68 265.8 Metazoa ko:K10176,ko:K10177 ko04013,ko04550,map04013,map04550 ko00000,ko00001,ko03000 Metazoa 38XFZ@33154,3BAHC@33208,KOG3585@1,KOG3585@2759 NA|NA|NA K negative regulation of cardiac chamber formation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000022245.1.1 45351.EDO34403 3.1e-70 271.6 Metazoa GPR89A 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2.3.2.27 ko:K10605,ko:K10683,ko:K19403 ko01524,ko03440,ko03460,ko04120,ko04151,ko05206,ko05224,map01524,map03440,map03460,map04120,map04151,map05206,map05224 M00295 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01009,ko03019,ko03036,ko03400,ko04121 Eukaryota KOG4362@1,KOG4362@2759 NA|NA|NA S E3 ubiquitin-protein ligase that specifically mediates the formation of 'Lys-6'-linked polyubiquitin chains and plays a central role in DNA repair by facilitating cellular responses to DNA damage. It is unclear whether it also mediates the formation of other types of polyubiquitin chains. The E3 ubiquitin-protein ligase activity is required for its tumor suppressor function. The BRCA1-BARD1 heterodimer coordinates a diverse range of cellular pathways such as DNA damage repair, ubiquitination and transcriptional regulation to maintain genomic stability. Regulates centrosomal microtubule nucleation. Required for normal cell cycle progression from G2 to mitosis. Required for appropriate cell cycle arrests after ionizing irradiation in both the S-phase and the G2 phase of the cell cycle. Involved in transcriptional regulation of P21 in response to DNA damage. Required for FANCD2 targeting to sites of DNA damage. May function as a transcriptional regulator mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000022279.2.1 27923.ML09549a-PA 2.4e-101 375.9 Metazoa NCEH1 GO:0003674,GO:0003824,GO:0004771,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005783,GO:0005789,GO:0006464,GO:0006470,GO:0006793,GO:0006796,GO:0006805,GO:0006807,GO:0007154,GO:0007165,GO:0007166,GO:0007167,GO:0007178,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009056,GO:0009410,GO:0009987,GO:0012505,GO:0016020,GO:0016298,GO:0016311,GO:0016787,GO:0016788,GO:0017171,GO:0019538,GO:0023052,GO:0031984,GO:0032501,GO:0034381,GO:0034383,GO:0036211,GO:0042175,GO:0042221,GO:0042301,GO:0043167,GO:0043168,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043231,GO:0043412,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044425,GO:0044432,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0050789,GO:0050794,GO:0050896,GO:0051716,GO:0052689,GO:0060395,GO:0065007,GO:0070887,GO:0071466,GO:0071704,GO:0097006,GO:0098827,GO:1901564 3.1.1.3 ko:K13616,ko:K14349,ko:K14351 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It is involved in the biological process described with carbohydrate metabolic process mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000022306.1.1 27923.ML05143a-PA 3.3e-30 137.9 Metazoa Metazoa 39Y6T@33154,3BEGN@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA G mannose metabolic process mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000022308.1.1 27923.ML329910a-PA 1.2e-17 95.5 Metazoa 2.3.1.15,2.4.2.29 ko:K13506,ko:K15407 ko00561,ko00564,ko01100,ko01110,map00561,map00564,map01100,map01110 M00089 R00851,R03789,R09380,R10209 RC00004,RC00039,RC00041,RC00063 ko00000,ko00001,ko00002,ko01000,ko01004,ko03016 Metazoa 39TZY@33154,3BI15@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA J protein kinase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000022309.1.1 27923.ML14766a-PA 7.9e-09 65.5 Metazoa CSMD1 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In ovulation, weakens the walls of the Graafian follicle. It activates the urokinase-type plasminogen activator, collagenases and several complement zymogens, such as C1 and C5. Cleavage of fibronectin and laminin leads to cell detachment and apoptosis. Also cleaves fibrin, thrombospondin and von Willebrand factor. Its role in tissue remodeling and tumor invasion may be modulated by CSPG4. Binds to cells mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000023755.1.4 27923.ML07758a-PA 1.6e-95 357.1 Metazoa DNAAF2 GO:0000226,GO:0001101,GO:0001539,GO:0001578,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005815,GO:0005829,GO:0005856,GO:0005929,GO:0006928,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007017,GO:0008150,GO:0008157,GO:0009987,GO:0010033,GO:0015630,GO:0016043,GO:0019899,GO:0019902,GO:0019903,GO:0022607,GO:0030030,GO:0030031,GO:0032526,GO:0033993,GO:0034622,GO:0035082,GO:0036064,GO:0040011,GO:0042221,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043933,GO:0044085,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044441,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044782,GO:0048870,GO:0050896,GO:0051179,GO:0051674,GO:0060271,GO:0060285,GO:0065003,GO:0070286,GO:0070925,GO:0071840,GO:0120025,GO:0120031,GO:0120036,GO:0120038,GO:1901700 ko:K19751 ko00000,ko04812 Metazoa 38HR9@33154,3BBM0@33208,KOG4356@1,KOG4356@2759 NA|NA|NA CH Required for cytoplasmic pre-assembly of axonemal dyneins, thereby playing a central role in motility in cilia and flagella. 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Metazoa 2CJ7Q@1,2QQ91@2759,39RQ0@33154,3BK2T@33208 NA|NA|NA S epithelial cilium movement involved in determination of left/right asymmetry mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000023765.2.1 27923.ML018027a-PA 6.9e-59 234.6 Eukaryota GO:0003674,GO:0005215,GO:0005216,GO:0005261,GO:0005575,GO:0006810,GO:0006811,GO:0006812,GO:0008150,GO:0008324,GO:0008381,GO:0009581,GO:0009582,GO:0009605,GO:0009612,GO:0009628,GO:0009987,GO:0015075,GO:0015267,GO:0015318,GO:0016020,GO:0022803,GO:0022836,GO:0022838,GO:0022857,GO:0022890,GO:0034220,GO:0042391,GO:0050896,GO:0050982,GO:0051179,GO:0051234,GO:0051606,GO:0051716,GO:0055085,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071214,GO:0071260,GO:0071496,GO:0098655,GO:0104004 ko:K22128 ko00000,ko02000,ko04131 1.A.75.1 Eukaryota KOG1893@1,KOG1893@2759 NA|NA|NA S mechanosensitive ion channel activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000023770.2.1 27923.ML114611a-PA 1.9e-286 991.5 Metazoa DHX35 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It is involved in the biological process described with protein phosphorylation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000024022.2.1 27923.ML05306a-PA 2.8e-126 458.4 Metazoa CABLES1 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Required for maturation of extramitochondrial Fe-S proteins. The nubp1-nubp2 heterotetramer forms a Fe-S scaffold complex, mediating the de novo assembly of an Fe-S cluster and its transfer to target apoproteins mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000024231.1.1 27923.ML034660a-PA 1.6e-90 342.4 Metazoa MAP3K7 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The beta-arrestins target many receptors for internalization by acting as endocytic adapters (CLASPs, clathrin-associated sorting proteins) and recruiting the GPRCs to the adapter protein 2 complex 2 (AP-2) in clathrin-coated pits (CCPs). However, the extent of beta-arrestin involvement appears to vary significantly depending on the receptor, agonist and cell type. Internalized arrestin-receptor complexes traffic to intracellular endosomes, where they remain uncoupled from G-proteins. Two different modes of arrestin-mediated internalization occur. Class A receptors, like ADRB2, OPRM1, ENDRA, D1AR and ADRA1B dissociate from beta- arrestin at or near the plasma membrane and undergo rapid recycling. Class B receptors, like AVPR2, AGTR1, NTSR1, TRHR and TACR1 internalize as a complex with arrestin and traffic with it to endosomal vesicles, presumably as desensitized receptors, for extended periods of time. Receptor resensitization then requires that receptor-bound arrestin is removed so that the receptor can be dephosphorylated and returned to the plasma membrane. Involved in internalization of P2RY4 and UTP-stimulated internalization of P2RY2. Involved in phosphorylation-dependent internalization of OPRD1 ands subsequent recycling. Involved in the degradation of cAMP by recruiting cAMP phosphodiesterases to ligand-activated receptors. Beta-arrestins function as multivalent adapter proteins that can switch the GPCR from a G-protein signaling mode that transmits short-lived signals from the plasma membrane via small molecule second messengers and ion channels to a beta-arrestin signaling mode that transmits a distinct set of signals that are initiated as the receptor internalizes and transits the intracellular compartment. Acts as signaling scaffold for MAPK pathways such as MAPK1 3 (ERK1 2). ERK1 2 activated by the beta- arrestin scaffold is largely excluded from the nucleus and confined to cytoplasmic locations such as endocytic vesicles, also called beta-arrestin signalosomes. Recruits c-Src SRC to ADRB2 resulting in ERK activation. GPCRs for which the beta-arrestin- mediated signaling relies on both ARRB1 and ARRB2 (codependent regulation) include ADRB2, F2RL1 and PTH1R. For some GPCRs the beta-arrestin-mediated signaling relies on either ARRB1 or ARRB2 and is inhibited by the other respective beta-arrestin form (reciprocal regulation). Inhibits ERK1 2 signaling in AGTR1- and AVPR2-mediated activation (reciprocal regulation). Is required for SP-stimulated endocytosis of NK1R and recruits c-Src SRC to internalized NK1R resulting in ERK1 2 activation, which is required for the antiapoptotic effects of SP. Is involved in proteinase-activated F2RL1-mediated ERK activity. Acts as signaling scaffold for the AKT1 pathway. Is involved in alpha- thrombin-stimulated AKT1 signaling. Is involved in IGF1-stimulated AKT1 signaling leading to increased protection from apoptosis. Involved in activation of the p38 MAPK signaling pathway and in actin bundle formation. Involved in F2RL1-mediated cytoskeletal rearrangement and chemotaxis. Involved in AGTR1-mediated stress fiber formation by acting together with GNAQ to activate RHOA. Appears to function as signaling scaffold involved in regulation of MIP-1-beta-stimulated CCR5-dependent chemotaxis. Involved in attenuation of NF-kappa-B-dependent transcription in response to GPCR or cytokine stimulation by interacting with and stabilizing CHUK. May serve as nuclear messenger for GPCRs. Involved in OPRD1- stimulated transcriptional regulation by translocating to CDKN1B and FOS promoter regions and recruiting EP300 resulting in acetylation of histone H4. Involved in regulation of LEF1 transcriptional activity via interaction with DVL1 and or DVL2 Also involved in regulation of receptors other than GPCRs. Involved in Toll-like receptor and IL-1 receptor signaling through the interaction with TRAF6 which prevents TRAF6 autoubiquitination and oligomerization required for activation of NF-kappa-B and JUN mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000024308.1.1 27923.ML01642a-PA 9.2e-206 723.8 Metazoa Metazoa 3AB3G@33154,3BQKC@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA O Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000024311.1.1 27923.ML078912a-PA 4.1e-20 104.0 Metazoa Mtor 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Metazoa 38BEP@33154,3BBBG@33208,KOG1008@1,KOG1008@2759 NA|NA|NA S response to amino acid starvation mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000024409.1.1 27923.ML09535a-PA 7.1e-97 362.1 Metazoa Metazoa 2E28H@1,2S9GQ@2759,3AAPH@33154,3BV5G@33208 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000024411.1.5 27923.ML05967a-PA 1.4e-83 316.6 Metazoa CFAP221 GO:0003341,GO:0003674,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005856,GO:0005929,GO:0005930,GO:0006928,GO:0006996,GO:0007017,GO:0007018,GO:0008150,GO:0009987,GO:0016043,GO:0022607,GO:0030030,GO:0030031,GO:0032838,GO:0042995,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0044085,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044441,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044458,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044782,GO:0060271,GO:0070925,GO:0071840,GO:0097014,GO:0099568,GO:0120025,GO:0120031,GO:0120036,GO:0120038 Metazoa 28KJC@1,2QT0T@2759,39FJC@33154,3BH1C@33208 NA|NA|NA S motile cilium assembly mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000024415.1.1 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Eukaryota KOG4743@1,KOG4743@2759 NA|NA|NA S cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025184.1.1 27923.ML27895a-PA 1.1e-174 620.9 Metazoa Metazoa 3AK7D@33154,3BPZQ@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA T Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025185.1.1 27923.ML34754a-PA 9.7e-10 71.6 Opisthokonta Opisthokonta 3AVBT@33154,COG5245@1,KOG3595@2759 NA|NA|NA Z dynein light chain binding mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025186.2.6 27923.ML141112a-PA 3.8e-115 421.4 Metazoa ko:K05849 ko04020,ko04022,ko04371,ko04740,ko04974,map04020,map04022,map04371,map04740,map04974 ko00000,ko00001,ko00536,ko02000 2.A.19.3 Metazoa 393JM@33154,3BMVZ@33208,KOG1306@1,KOG1306@2759 NA|NA|NA PT Sodium/calcium exchanger protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025188.3.5 27923.ML08576a-PA 2.3e-221 774.6 Metazoa RTCB 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6.5.1.3 ko:K14415 ko00000,ko01000,ko03016 Metazoa 38CK6@33154,3BD7J@33208,COG1690@1,KOG3833@2759 NA|NA|NA J RNA ligase (ATP) activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025189.2.3 27923.ML131715a-PA 7.1e-45 186.8 Metazoa 3.6.1.13 ko:K04977 ko04621,ko04921,map04621,map04921 ko00000,ko00001,ko01000,ko04040 1.A.4.5.5 Metazoa 38D2H@33154,3BASE@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759,KOG3614@1,KOG3614@2759,KOG4195@1,KOG4195@2759 NA|NA|NA KLT Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 2 mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025190.1.1 27923.ML073011a-PA 3.8e-42 178.3 Metazoa LPCAT3 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2.3.1.23 ko:K13515 ko00564,ko04216,map00564,map04216 R01318,R04480,R09035 RC00004,RC00037 ko00000,ko00001,ko01000,ko01004 Metazoa 39RB5@33154,3B9ZH@33208,COG5202@1,KOG2705@2759 NA|NA|NA S 1-acylglycerophosphocholine O-acyltransferase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025192.1.1 27923.ML00267a-PA 1.8e-09 69.3 Metazoa ko:K08202 ko05231,map05231 ko00000,ko00001,ko02000 2.A.1.19.2,2.A.1.19.3 Metazoa 38FJ1@33154,3B9N9@33208,KOG0255@1,KOG0255@2759 NA|NA|NA K organic anion transmembrane transporter activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025194.1.1 27923.ML214310a-PA 1.8e-74 285.8 Eukaryota Eukaryota KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA E Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025198.1.2 27923.ML258242a-PA 9.1e-76 290.8 Metazoa Metazoa 3ANK8@33154,3C0ZM@33208,COG4870@1,KOG1543@2759 NA|NA|NA O Papain family cysteine protease mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025200.4.1 27923.ML00881a-PA 7e-58 230.3 Opisthokonta Opisthokonta 2BEHQ@1,2S14U@2759,3A84Y@33154 NA|NA|NA S EF-hand, calcium binding motif mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025203.1.1 27923.ML375934a-PA 1.3e-38 165.6 Metazoa TMEM222 ko:K20726 ko04016,map04016 ko00000,ko00001 Metazoa 39E1R@33154,3BBZX@33208,KOG3150@1,KOG3150@2759 NA|NA|NA S transmembrane protein 222 mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025206.2.1 27923.ML15151a-PA 2e-48 199.5 Metazoa 2.7.10.1 ko:K05127,ko:K05129 ko00000,ko01000,ko01001,ko01020,ko04050,ko04147 Metazoa 38CP6@33154,3BC7R@33208,COG0515@1,KOG1026@2759,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA T neurotrophin receptor activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025208.2.1 27923.ML49521a-PA 7.5e-53 213.4 Metazoa Metazoa 2F1AU@1,2T2BX@2759,3AU1D@33154,3C4GR@33208 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025210.7.1 27923.ML13093a-PA 8.4e-53 213.0 Metazoa ko:K12896 ko03040,ko05168,map03040,map05168 ko00000,ko00001,ko03041 Metazoa 38B59@33154,3BGQJ@33208,KOG0107@1,KOG0107@2759 NA|NA|NA A negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025211.2.1 27923.ML07393a-PA 2.4e-11 75.1 Eukaryota LHFPL2 GO:0000003,GO:0002576,GO:0003006,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005911,GO:0005918,GO:0006810,GO:0006887,GO:0007163,GO:0007275,GO:0007548,GO:0008150,GO:0009987,GO:0012505,GO:0012506,GO:0016020,GO:0016192,GO:0022414,GO:0030054,GO:0030141,GO:0030659,GO:0030667,GO:0031090,GO:0031091,GO:0031092,GO:0031410,GO:0031982,GO:0032501,GO:0032502,GO:0032940,GO:0043226,GO:0043227,GO:0043229,GO:0043296,GO:0043900,GO:0043902,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044433,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045055,GO:0045137,GO:0046545,GO:0046546,GO:0046660,GO:0046661,GO:0046903,GO:0048518,GO:0048856,GO:0050789,GO:0051179,GO:0051234,GO:0065007,GO:0070160,GO:0071944,GO:0080154,GO:0097708,GO:0098588,GO:0098805,GO:0099503,GO:1905516,GO:2000241,GO:2000243 Eukaryota KOG4026@1,KOG4026@2759 NA|NA|NA P detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of sound 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ko:K19868,ko:K19869 ko00000,ko03036 Metazoa 38GKU@33154,3BF9T@33208,COG0105@1,COG0526@1,KOG0888@2759,KOG0907@2759 NA|NA|NA O NME NM23 family member mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025231.2.1 27923.ML00662a-PA 2.6e-30 138.3 Metazoa Metazoa 3AK7D@33154,3BPZQ@33208,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA T Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025232.1.1 27923.ML08363a-PA 1.8e-11 75.9 Opisthokonta 3.1.3.48 ko:K01104,ko:K05695,ko:K06777,ko:K18032,ko:K19599,ko:K19806 ko04011,ko04514,ko04520,ko04630,ko04910,ko04931,map04011,map04514,map04520,map04630,map04910,map04931 ko00000,ko00001,ko01000,ko01009,ko04516 Opisthokonta 38C1K@33154,COG5599@1,KOG4228@2759 NA|NA|NA T protein tyrosine phosphatase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025234.1.1 27923.ML161318a-PA 8.6e-11 72.4 Metazoa 1.14.11.2 ko:K00472 ko00330,ko01100,map00330,map01100 R01252 RC00478 ko00000,ko00001,ko01000 Metazoa 38BMH@33154,3BA6F@33208,KOG1591@1,KOG1591@2759 NA|NA|NA E procollagen-proline 4-dioxygenase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025240.1.1 27923.ML154185a-PA 2.4e-10 70.5 Metazoa GAS8 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Eukaryota COG2319@1,KOG0322@2759 NA|NA|NA L chromatin organization mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000025999.3.1 27923.ML011743a-PA 4.4e-36 157.1 Metazoa ko:K04500 ko04068,ko04110,ko04144,ko04218,ko04350,ko04371,ko04390,ko04520,ko04550,ko04659,ko04926,ko04933,ko05142,ko05166,ko05200,ko05210,ko05212,ko05225,ko05226,ko05321,map04068,map04110,map04144,map04218,map04350,map04371,map04390,map04520,map04550,map04659,map04926,map04933,map05142,map05166,map05200,map05210,map05212,map05225,map05226,map05321 M00680,M00681 ko00000,ko00001,ko00002 Metazoa 38BD4@33154,3BA66@33208,KOG3701@1,KOG3701@2759 NA|NA|NA K transforming growth factor beta receptor signaling pathway mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000026006.1.1 27923.ML00909a-PA 1.9e-31 141.7 Opisthokonta Opisthokonta 3A1VA@33154,KOG1075@1,KOG1075@2759 NA|NA|NA S Ribonuclease H protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000026007.1.1 27923.ML221318a-PA 5.4e-18 96.3 Metazoa ko:K12872 ko03040,map03040 M00355 ko00000,ko00001,ko00002,ko03041 Metazoa 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Catalyzes the reversible oxidation-reduction of methionine sulfoxide in proteins to methionine mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000026031.1.1 27923.ML01711a-PA 6.6e-85 320.9 Eukaryota Eukaryota 2C1HS@1,2S2PQ@2759 NA|NA|NA mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000026033.1.1 45351.EDO43595 7.5e-54 218.0 Metazoa FUT8 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Coatomer complex is required for budding from Golgi membranes, and is essential for the retrograde Golgi-to-ER transport of dilysine-tagged proteins mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000027149.1.1 27923.ML04061a-PA 2.6e-54 217.6 Metazoa NEK6 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2.3.2.27 ko:K10632 ko04014,map04014 ko00000,ko00001,ko01000,ko04121 Metazoa 38BBQ@33154,3BCPC@33208,KOG0804@1,KOG0804@2759 NA|NA|NA O BRCA1 associated protein mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000027519.1.1 9818.XP_007954637.1 1.7e-08 66.6 Afrotheria DNHD1 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3.1.3.16 ko:K15498 ko00000,ko01000,ko01009,ko03400 Metazoa 39WHN@33154,3BCQR@33208,COG0639@1,KOG0373@2759 NA|NA|NA DT phosphoprotein phosphatase activity mRNA.TARA_ARC_108_MAG_00227_000000027523.2.1 27923.ML073217a-PA 9.7e-35 152.5 Metazoa UROD 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