Legionella est une bactérie de l'environnement responsable de la légionellose. Les données épidémiologiques indiquent que seuls certains isolats sont responsables des cas cliniques. L'espèce Legionella pneumophila semble avoir une virulence plus importante que les autres espèces en étant responsable de 90% des cas de légionellose. Au sein de cette espèce, parmi les quinze sérogroupes, les isolats de sérogroupe 1 sont associés à 80% des cas.

Les séquences complètes de deux isolats de L. pneumophila sérogroupe 1 sont déterminées et analysées. L'un semble être un nouveau clone épidémique, émergent en France et l'autre est présent depuis plusieurs années dans le système d'eau d'un hôpital sans avoir jamais été montré comme responsable d'une infection, bien que L. pneumophila soit décrit comme cause d'infections nosocomiales. L'information épidémiologique sera une information clé dans l'analyse et la comparaison de ces deux isolats et la comparaison avec les trois séquences génomiques déjà connues (Chien et al., 2004; Cazalet et al., 2004) pour identifier des gènes importants dans l'infection humaine.