Le projet consiste à séquencer une région d'environ 200 kb d'un chromosome X de Drosophila simulans. Le séquençage de cette région permettra de comparer son organisation avec celle de chromosomes "sauvages" qui ne perturbent pas la méiose, et aidera à l'identification des éléments distorteurs.

Dans ce cadre, le Genoscope entreprend le séquençage de 4 BACs couvrant cette région, chacun des BACs faisant l'objet d'un sous-clonage (inserts 5 kb dans pcdna2.1), suivi d'un shotgun à une couverture de 10x puis d'une étape de finition.