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Collaboration
LMGEM
Centre d'Océanologie de Marseille
Campus de Luminy, Marseille, France
Laboratoire d'Ecologie Moléculaire
Université de Pau et des Pays de l'Adour
Pau, France
Laboratoire de Chimie Bactérienne
Institut de la Biologie structurale et Microbiologie
CNRS, Marseille, France
Observatoire Océanographique
UMR 7621
Equipe Microbiologie
Banyuls, France
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Les
Marinobacters appartiennent à un genre marin décrit en 1992
par le Centre d'Océanologie de Marseille. Ce genre semble ubiquiste
dans les environnements marins puisque plusieurs souches ont été
isolées ou détectées à partir de biotopes très diversifiés d'un point
de vue géographique et physicochimique (tapis bactériens hypersalés,
source marine d'eau chaude au Japon ou mers froides comme l'Arctique
et l'Antarctique). La versabilité métabolique des
Marinobacters leur permet d'utiliser comme source de carbone
et d'énergie des substrats réputés récalcitrants à la dégradation
comme les hydrocarbures et un grand nombre de publications analysent
ces métabolismes originaux.
La souche type, Marinobacter
hydrocarbonoclasticus, présente des caractéristiques
physiologiques remarquables. Elle est capable de pousser sous forme
planctonique libre ou fixée et de former des biofilms. Elle dégrade
certains hydrocarbures. Elle est halotolérante extrême et produit un
osmoprotectant, l'ectoïne.
Comme un certain nombre de Marinobacters, elle est aérobie
facultative et dénitrifiante. De plus, elle synthétise une phosphatase
extracellulaire.
Le séquençage du génome de la souche type
permettrait une meilleure compréhension des gènes impliqués dans
l'assimilation des sources de carbones simples et labiles (OOB,
Banyuls) ou récalcitrantes comme les hydrocarbures (LEM, Pau), dans le
cycle de l'azote (LMGEM, Marseille), dans la synthèse d'enzymes
extracellulaires (IBSM-Marseille), sur la formation de biofilm (LEM,
Pau) ainsi que dans les mécanismes d'adaptation au sel (LMGEM,
Marseille). Au travers de cette étude, une avancée majeure dans la
connaissance des métabolismes fondamentaux d'un micro-organisme marin
ubiquiste serait réalisée.
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