Blastocystis hominis est un micro-organisme eucaryote qui est l'un des plus fréquemment rencontrés dans le tractus intestinal de l'homme et de divers animaux. Il présente un polymorphisme morphologique composant un cycle de développement encore discuté.
Classé parmi les Straménophiles, groupe hétérogène comprenant des diatomées, des algues brunes et des oomycètes, ces derniers ayant une pathogénicité identifiée, Blastocystis hominis est un commensal pouvant devenir pathogène particulièrement chez des hôtes immunodéprimés. Les travaux qui lui sont consacrés sont au nombre de 457 sur une période s'étalant de 1967 à maintenant ; les plus nombreux concernent d'une part la pathologie et le traitement (168) et le diagnostic et l'épidémiologie (181).

Blastocystis hominis a un mode de vie anaérobie mais chaque individu possède un grand nombre d'organites similaires à des mitochondries. La question posée est celle d'une voie originale d'adaptation de ces organites. L'apoptose, décrite chez ces parasites, est-elle caspase dépendante ?
Le génome haploïde a une taille réduite à 10 Mb environ, distribué en 9 à 13 bandes caryotypiques selon les souches, faciles à séparer. La taille estimée des chromosomes varie de 260 kb à 2,2 Mb.
La culture in vitro sur milieu axénique permet une grande production de parasites donc d'ADN et de protéines pour les expériences de génomique fonctionnelle.
L'obtention de différentes souches humaines ou parasites de volaille, provenant de différentes régions du globe, devrait permettre des études comparatives qui, reliées à des observations cliniques, aideront à cerner d'une part la notion de virulence, et, d'autre part la notion de co-facteur prédisposant ou compliquant certaines pathologies.