Les Annélides sont caractérisés par l'apparition d'une cavité coelomique et de la segmentation. Ces particularités morphologiques n'ont pu être initiées que par la mise en place de programmes génétiques majeurs de différenciation et de développement des Métazoaieres au cours de l'évolution. A l'heure actuelle, ils sont largement sous-représentés dans les banques de séquences (moins de 1 000 séquences protéiques). La construction et le séquençage d'une banque d'ADNc complets chez Alvinella pompejana permettront ainsi de générer rapidement des informations moléculaires sur ce phylum. Ils apparaissent parfaitement complémentaires du projet français de séquençage du génome de l'Annélide Platynereis dumerilii. En effet, les séquences d'ADNc d'Alvinella constituteront un atout décisif dans l'annotation du génome de Platynereis et l'obtention des séquences de deux organismes ouvre la voie à de nombreuses comparaisons.

Outre cet intérêt évolutif, A. pompejana présente une thermotolérance exceptionnelle chez un eucaryote (de 20 à plus de 80°C chez l'adulte) qui en fait l'organisme modèle parfait pour la production de protéines thermostables d'origine animale. La collection d'ADNc complets constituera ainsi une source unique de protéines thermostables :

• Pour la détermination des structures de protéines eucaryotes, la reconstruction et cristallisation de complexes moléculaires et pour les études de protéomique au sens large,
• Pour l'étude de systèmes biologiques complexes (adaptation moléculaire aux stress thermique, oxydatif, chimique,...),
• Pour des applications médicales et biotechnologiques (études d'homologues de protéines responsables de maladies humaines, obtention de peptides antibactériens, d'enzymes à intérêt industriel thermostables, substitut sanguin,...).