Le séquençage du génome de Bacillus cereus F0837/76, un
pathogène opportuniste humain, a pour but la comparaison de cette
souche avec trois génomes du groupe cereus déjà disponibles (Bce
ATCC14579, Bce ATCC10987 et B. anthracis Ames). Comme la
souche F0837/76 est la souche connue la plus proche de
B. anthracis, tout en étant clairement différente (1-2 % de
divergence au niveau nucléotidique), cette comparaison doit montrer
les différences vraiment importantes entre le pathogène mortel
B. anthracis et le pathogène diarrhéique très toxique
F0837/76.
Genoscope entreprend donc le séquençage aléatoire global du génome
de Bacillus cereus F0837/76.
Pour ce faire, deux banques plasmidiques (inserts : 3 et 10 kb) et une
banque de miniBACs (inserts ~25 kb) seront construites à Genoscope. Le
séquençage des extrémités des clones obtenus devrait produire environ
80 000 lectures.
La finition de la séquence du génome sera réalisée par le séquençage
de produits de LR PCR en utilisant l'information disponible sur les
génomes proches. Cette étape sera effectuée par le laboratoire
collaborant.