[an error occurred while processing this directive] Methylobacterium dichloromethanicum DM4 - Séquençage aléatoire global





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Methylobacterium dichloromethanicum DM4
Séquençage aléatoire global

-> Methylobacterium dichloromethanicum, une bactérie capable de dégrader le dichlorométhane






Genoscope entreprend le séquençage du génome complet de la souche de Methylobacterium dichloromethanicum DM4, estimé à 7 Mb (estimation sur la base de la souche modèle AM1).
Le génome sera séquencé à une profondeur de 12X à partir de trois banques:

  • une banque d'inserts de 3 kb clonés dans le vecteur plasmidique multicopie pcdna2.1,
  • une banque de 10 kb dans le vecteur plasmidique pCNS (faible nombre de copie)
  • et une banque de miniBAC (inserts ~30kb) dans le vecteur pBBC (dérivé de pBeloBAC11).
Le shotgun devrait aboutir à environ 120 000 lectures. Une étape de finition permettra d'augmenter la qualité des séquences obtenues.

Contacts:
Valérie Barbe (Genoscope) - Stéphane Vuilleumier
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Date de dernière modification:
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