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Marine cytophagales
Séquençage aléatoire global

-> Les cytophagales marines, bactéries spécialisées dans la dégradation des polymères






Genoscope entreprend le séquençage des bactéries marines Zobellia galactonivorans et Salinibacter ruber M8.

Les tailles des génome de ces bactéries sont estimées à 4,1 Mb et 3,8 Mb respectivement. Chacun des génomes sera séquencé à une profondeur de 12X, à partir de trois banques : environ 25 000 inserts de 3 kb clonés dans le vecteur plasmidique pcdna2.1 (grand nombre de copies), environ 8 000 inserts de 10 kb clonés dans le vecteur plasmidique pCNS (faible nombre de copies) et près de 4 000 inserts de 20-25 kb clonés dans un vecteur miniBAC (pBBC).
Une étape de finition manuelle sera effectuée au Genoscope.

Contacts:
Valérie Barbe (Genoscope) - Rudolph Amann





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