[an error occurred while processing this directive] Thiomonas spp. - Séquençage aléatoire global





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Thiomonas spp.
Séquençage aléatoire global

-> Thiomonas spp., une bactérie metallorésitante

Collaboration
 Laboratoire de Microbiologie et de Génétique
Dynamique - Evolution - Expression des Génomes de Microorganismes
FRE 2326 ULP/CNRS
Strasbourg
En savoir plus
 L'organisme Herminiimonas arsenicoxydans sp. nov., projet également séquencé au Genoscope, est une bactérie équivalente à Thiomonas spp
 Le site web du GDR sur le métabolisme de l'arsenic chez les procaryotes.


Le Genoscope entreprend le séquençage de la beta-proteobacterie Thiomonas spp.: une bactérie capable de réduire et d'oxyder l'arsenic dans un but de détoxication.

La taille du génome de cette bactérie est estimée à 5 Mb environ. Le génome sera séquencé à une profondeur de 10X, à partir de trois banques : environ 25000 inserts de 3 kb clonés dans le vecteur pcdna2.1 (grand nombre de copies), environ 8000 inserts de 10 kb clonés dans le vecteur pCNS (faible nombre de copies) et près de 4000 inserts de 20-25 kb clonés dans un vecteur miniBAC (pBBC).
Une étape de finition manuelle sera effectuée au Genoscope.

Contacts:
Valérie Barbe (Genoscope) - Philippe Bertin (ULP/CNRS)
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Date de dernière modification:
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