Ce projet a pour objectif l'identification de microsatellites pour seize espèces de plantes tropicales et dix de leurs pathogènes. Le développement de ces marqueurs présente un grand intérêt pour leurs caractéristiques propres (spécificité de locus, diversité allèlique, codominance), pour les possibilités d'automatisation au sein de laboratoires de taille conséquente mais aussi pour la facilité de mise en uvre dans de petites structures.

Les coûts de recherche de locus microsatellites étant élevés, peu de laboratoires peuvent développer seuls ce genre d'activité. Les marqueurs microsatellites identifiés permettront d'accroître le potentiel d'aide du CIRAD à ses partenaires du sud. Ils seront utilisés, dans un but d'approfondissement des connaissances des ressources génétiques, dans des études de populations ou de cartographies génétiques. Pour bon nombre des espèces proposées, il s'agira des premiers microsatellites connus.