Sous le nom de Botrytis cinerea se cache en fait un complexe d'espèces dont certaines se différentient par leur spécificité d'hôtes et la structure de leur génome : certaines souches sont porteuses de plusieurs types d'éléments transposables, alors que d'autres semblent en être totalement dépourvues. L'objectif est d'évaluer le rôle des éléments transposables dans la structuration des chromosomes de ces deux types de souches. Deux banques BAC ont été réalisées sur la souche K1 dépourvues d'éléments transposables et deux autres banques ont été réalisées sur la souche T4, souche chez laquelle trois familles d'éléments transposables ont déjà été identifiées. Le séquençage des extrémités de ces BACs devrait permettre d'en organiser un certain nombre d'entre eux sous forme de "contigs" et ensuite de comparer l'organisation chromosomique des deux souches.