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Quand et comment soumettre un projet de séquençage au Genoscope ?



Les projets de séquençage doivent être soumis en réponse aux appels à propositions mis en ligne sur la page d'accueil du site web du Genoscope (lire ci-dessous pour connaître les conditions d'éligibilité).
Le Genoscope émet chaque année un appel à propositions. Les projets ne peuvent être soumis en dehors des dates de cet appel. .

Les conditions de soumission sont décrites dans chaque appel à propositions. Celui-ci donne accès à un formulaire type, qui doit être rempli et renvoyé sous forme électronique ainsi que sous forme papier.


Conditions d'accès aux capacités de séquençage du Genoscope

Dans le cadre de ses missions, le Genoscope (Centre National de Séquençage) consacre une partie importante de sa capacité de séquençage à la réalisation de projets extérieurs. Ces projets extérieurs sont soumis par des laboratoires de la Recherche Publique (CNRS, INSERM, INRA, CEA, CIRAD, IRD, Laboratoires Universitaires, Fondations...). Des grands projets (nécessitant plus de 1,5 millions de lectures) peuvent également impliquer des laboratoires partenaires étrangers, notamment européens.

Ces projets, soumis en réponse à des appels à propositions émanant du Genoscope, sont développés en collaboration avec le Genoscope. Les divers partenaires définissent ensemble la stratégie et les conditions pratiques de déroulement du travail expérimental. Les données résultant de cette collaboration sont détenues conjointement par les partenaires qui conviennent des modalités de diffusion et d'éventuelle prise de protection intellectuelle, en accord avec les instances de tutelle.

Les projets peuvent porter sur le séquençage de génomes complets ou de très grandes régions d'ADN génomique, ou de très grandes collections d'ADNc ou de clones d'ADN génomique d'organismes présentant un intérêt majeur sur le plan scientifique, médical ou économique. Des projets impliquant des populations d'organismes pourront également être considérés. Les projets de taille plus modeste, pouvant être financés et réalisés par d'autres moyens, ne sont pas pris en considération.

Les projets sont évalués en fonction de leur :

  • intérêt scientifique et/ou médical ;
  • degré de faisabilité -existence éventuelle de banques d'ADN (génomique ou ADNc) dont la qualité a été vérifiée et dont les vecteurs sont appropriés, ou, au moins d'ADN dont l'origine est bien définie et aisément clonable, ou d'une carte de clones chevauchants prêts à être séquencés- ;
  • impact sur la communauté scientifique nationale et internationale ;
  • contexte international ;
  • capacité des proposants à constituer des réseaux ;
  • capacité des proposants à utiliser efficacement les résultats du séquençage ;
  • Capacité de co-financement éventuel pour les grands projets.

Cette évaluation est faite par le Comité Scientifique, composé de personnalités scientifiques extérieures au Genoscope, sur la base de rapports d'experts extérieurs au Comité. Le Comité Scientifique du Genoscope consulte le Conseil Scientifique du CNRG pour des projets qui mobiliseraient une partie importante de la capacité de séquençage du Genoscope (plus de 1,5 millions de lectures).

Les projets de séquençage de génomes directement en concurrence avec des projets identiques réalisés dans d'autres centres ne sont pas pris en considération.

Pour plus de renseignements, veuillez contacter Laurence Cattolico.



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