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MaGe CURATED ANNOTATION

2003-07-28 11:33:42

Type	Begin	End	Length	Frame	Mutation	Gene	Synonyms	Status
CDS fCDS			888 (295aa)	+2	no frameshift pseudo partial gene remnant selenocysteine pyrrolysine atypical start			inProgress finished Curated Artefact chkSeq chkStart
Product	conserved hypothetical protein
Product Type	c : carrier cp : cell process e : enzyme f : factor h : extrachromosomal origin l : leader peptide lp : lipoprotein m : membrane component n : RNA ph : phenotype r : regulator rc : receptor s : structure t : transporter u : unknown
EC number
MetaCyc Reaction	Selection is empty. Synchronize with EC number field : Search reaction by keyword :
Rhea Reaction	Selection is empty. Synchronize with EC number field : Search reaction by keyword :
Localization	1 : Unknown 2 : Cytoplasmic 3 : Fimbrial 4 : Flagellar 5 : Inner membrane protein 6 : Inner membrane-associated 7 : Outer membrane protein 8 : Outer membrane-associated 9 : Periplasmic 10 : Secreted 11 : Membrane
BioProcess	Selection is empty. 1 : Amino acid biosynthesis  1.1 : Aromatic amino acid family  1.2 : Aspartate family  1.3 : Glutamate family  1.4 : Pyruvate family  1.5 : Serine family  1.6 : Histidine family 2 : Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides  2.1 : 2'-Deoxyribonucleotide metabolism  2.2 : Nucleotide and nucleoside interconversions  2.3 : Purine ribonucleotide biosynthesis  2.4 : Pyrimidine ribonucleotide biosynthesis  2.5 : Salvage of nucleosides and nucleotides  2.6 : Sugar-nucleotide biosynthesis and conversions 3 : Fatty acid and phospholipid metabolism  3.1 : Biosynthesis  3.2 : Degradation 4 : Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers  4.1 : Biotin  4.2 : Folic acid  4.3 : Heme, porphyrin, and cobalamin  4.4 : Lipoate  4.5 : Menaquinone and ubiquinone  4.6 : Molybdopterin  4.7 : Pantothenate and coenzyme A  4.8 : Pyridoxine  4.9 : Riboflavin, FMN, and FAD  4.10 : Glutathione and analogs  4.11 : Thiamine  4.12 : Pyridine nucleotides  4.13 : Chlorophyll and bacteriochlorphyll  4.14 : Siderophores 5 : Central intermediary metabolism  5.1 : Amino sugars  5.2 : One-carbon metabolism  5.3 : Phosphorus compounds  5.4 : Polyamine biosynthesis  5.5 : Sulfur metabolism  5.6 : Nitrogen fixation  5.7 : Nitrogen metabolism  5.8 : Electron carrier regeneration 6 : Energy metabolism  6.1 : Aerobic  6.2 : Amino acids and amines  6.3 : Anaerobic  6.4 : ATP-proton motive force interconversion  6.5 : Electron transport  6.6 : Entner-Doudoroff  6.7 : Fermentation  6.8 : Glycolysis/gluconeogenesis  6.9 : Pentose phosphate pathway  6.10 : Pyruvate dehydrogenase  6.11 : Sugars  6.12 : TCA cycle  6.13 : Methanogenesis  6.14 : Biosynthesis and degradation of polysaccharides  6.15 : Photosynthesis  6.16 : Chemoautotrophy 7 : Transport and binding proteins  7.1 : Amino acids, peptides and amines  7.2 : Anions  7.3 : Carbohydrates, organic alcohols, and acids  7.4 : Cations and iron carrying compounds  7.5 : Nucleosides, purines and pyrimidines  7.6 : Porins  7.7 : Unknown substrate 8 : DNA metabolism  8.1 : DNA replication, recombination, and repair  8.2 : Restriction/modification  8.3 : Degradation of DNA  8.4 : Chromosome-associated proteins 9 : Transcription  9.1 : Degradation of RNA  9.2 : DNA-dependent RNA polymerase  9.3 : Transcription factors  9.4 : RNA processing 10 : Protein synthesis  10.1 : tRNA aminoacylation  10.2 : Ribosomal proteins: synthesis and modification  10.3 : tRNA and rRNA base modification  10.4 : Translation factors 11 : Protein fate  11.1 : Protein and peptide secretion and trafficking  11.2 : Protein modification and repair  11.3 : Protein folding and stabilization  11.4 : Degradation of proteins, peptides, and glycopeptides 12 : Regulatory functions  12.1 : DNA interactions  12.2 : RNA interactions  12.3 : Protein interactions  12.4 : Small molecule interactions 13 : Signal transduction  13.1 : Two-component systems  13.2 : PTS 14 : Cell envelope  14.1 : Surface structures  14.2 : Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan  14.3 : Biosynthesis and degradation of surface polysaccharides and lipopolysaccharides 15 : Cellular processes  15.1 : Cell division  15.2 : Chemotaxis and motility  15.3 : Cell adhesion  15.4 : Conjugation  15.5 : Detoxification  15.6 : DNA transformation  15.7 : Sporulation and germination  15.8 : Toxin production and resistance  15.9 : Pathogenesis  15.10 : Adaptations to atypical conditions  15.11 : Biosynthesis of natural products  15.12 : Bioluminescence 16 : Biological processes  16.1 : Circulate  16.2 : Construct biomass (Anabolism)  16.3 : Control  16.4 : Excrete  16.5 : Explore  16.6 : Maintain  16.7 : Manage energy  16.8 : Protect  16.9 : Replicate  16.10 : Respire  16.11 : Scavenge (Catabolism)  16.12 : Sense  16.13 : Shape  16.14 : Store  16.15 : Symbiosis 17 : Mobile and extrachromosomal element functions  17.1 : Plasmid functions  17.2 : Prophage functions  17.3 : Transposon functions 18 : Unknown function  18.1 : Enzymes of unknown specificity 19 : Unclassified
Roles	Selection is empty. 1 : Metabolism  1.1 : Carbon compound utilization   1.1.1 : Carbohydrates/Carbon compounds    1.1.1.1 : D-allose catabolism    1.1.1.2 : 2,5-ketogluconate metabolism    1.1.1.3 : D-arabinose catabolism    1.1.1.4 : D-galactarate catabolism    1.1.1.5 : D-galacturonate catabolism    1.1.1.6 : D-glucarate catabolism    1.1.1.7 : D-glucuronate catabolism    1.1.1.8 : L-arabinose catabolism    1.1.1.9 : L-idonate catabolism    1.1.1.10 : L-lyxose metabolism    1.1.1.11 : Fucose catabolism    1.1.1.12 : Galactitol catabolism    1.1.1.13 : Galactonate catabolism    1.1.1.14 : Lactose degradation    1.1.1.15 : Mannose catabolism    1.1.1.16 : Rhamnose catabolism    1.1.1.17 : Sorbitol degradation    1.1.1.18 : Trehalose degradation, low osmolarity+    1.1.1.19 : Xylose catabolism    1.1.1.20 : Glycol degradation    1.1.1.21 : Mannitol degradation    1.1.1.22 : Ribose degradation    1.1.1.23 : Galactose degradation    1.1.1.24 : Sorbose degradation    1.1.1.25 : L-ascorbate degradation   1.1.2 : Fatty acids (fatty acid oxidation)    1.1.2.1 : Degradation of short-chain fatty acids    1.1.2.2 : 3-phenylpropionate and 3-(3-hydroxyphenyl)propionate degradation    1.1.2.3 : Propionate degradation   1.1.3 : Amino acids    1.1.3.1 : L-alanine degradation    1.1.3.2 : L-serine degradation    1.1.3.3 : Arginine catabolism    1.1.3.4 : Glutamate degradation    1.1.3.5 : Glycine cleavage    1.1.3.6 : Proline utilization    1.1.3.7 : Threonine catabolism    1.1.3.8 : Tryptophan utilization    1.1.3.9 : L-cysteine catabolism    1.1.3.10 : Lysine cleavage    1.1.3.11 : Histidine degradation    1.1.3.12 : Leucine degradation    1.1.3.13 : Methionine degradation    1.1.3.14 : Valine degradation    1.1.3.15 : Phenylalanine, tyrosine degradation   1.1.4 : Amines    1.1.4.1 : Phenylethylamine degradation    1.1.4.2 : Carnitine degradation    1.1.4.3 : Ornithine degradation   1.1.5 : Others    1.1.5.1 : Phenylacetic acid degradation    1.1.5.2 : Ethanol degradation    1.1.5.3 : Eugenol catabolism    1.1.5.4 : Beta-ketoadipate pathway    1.1.5.5 : Mandelate catabolism  1.2 : Macromolecule degradation   1.2.1 : RNA   1.2.2 : DNA   1.2.3 : Proteins/peptides/glycopeptides   1.2.4 : Polysaccharides    1.2.4.1 : Glycogen catabolism    1.2.4.2 : Chitin catabolism  1.3 : Energy metabolism (carbon)   1.3.1 : Glycolysis   1.3.2 : Pentose phosphate shunt, oxidative branch   1.3.3 : Pyruvate dehydrogenase   1.3.4 : Tricarboxylic acid cycle   1.3.5 : Fermentation   1.3.6 : Aerobic respiration   1.3.7 : Anaerobic respiration   1.3.8 : ATP proton motive force interconversion   1.3.9 : Entner-Doudoroff pathway  1.4 : Energy production/transport   1.4.1 : Electron donor   1.4.2 : Electron acceptor   1.4.3 : Electron carrier  1.5 : Building block biosynthesis   1.5.1 : Amino acids    1.5.1.1 : Glutamate    1.5.1.2 : Glutamine    1.5.1.3 : Arginine    1.5.1.4 : Proline    1.5.1.5 : Aspartate    1.5.1.6 : Asparagine    1.5.1.7 : Lysine, diaminopimelate    1.5.1.8 : Threonine    1.5.1.9 : Methionine    1.5.1.10 : Glycine    1.5.1.11 : Serine    1.5.1.12 : Cysteine    1.5.1.13 : Phenylalanine    1.5.1.14 : Tyrosine    1.5.1.15 : Tryptophan    1.5.1.16 : Histidine    1.5.1.17 : Alanine    1.5.1.18 : Isoleucine/valine    1.5.1.19 : Leucine    1.5.1.20 : Chorismate    1.5.1.21 : Homoserine   1.5.2 : Nucleotide    1.5.2.1 : Purine biosynthesis    1.5.2.2 : Pyrimidine biosynthesis    1.5.2.3 : Purine ribonucleotide biosynthesis    1.5.2.4 : Pyrimidine ribonucleotide/ribonucleoside biosynthesis   1.5.3 : Cofactor, small molecule carrier    1.5.3.1 : Biotin    1.5.3.2 : Folic acid    1.5.3.3 : Lipoate    1.5.3.4 : Molybdenum (molybdopterin)    1.5.3.5 : Coenzyme A    1.5.3.6 : Pyridoxine (vitamin B6)    1.5.3.7 : Nicotinamide adenine dinucleotide (NAD)    1.5.3.8 : Thiamine (Vitamin B1)    1.5.3.9 : Riboflavin (Vitamin B2), FAD, FMN    1.5.3.10 : Glutathione    1.5.3.11 : Menaquinone (MK), ubiquinone (Q)    1.5.3.12 : Heme, porphyrin    1.5.3.13 : Cobalamin (Vitamin B12)    1.5.3.14 : Enterochelin (enterobactin)    1.5.3.15 : Chrysobactin    1.5.3.16 : Achromobactin    1.5.3.19 : Isoprenoid biosynthesis    1.5.3.20 : Tetrahydrobiopterin biosynthesis    1.5.3.21 : Pyochelin biosynthesis   1.5.4 : Fatty acid and phosphatidic acid  1.6 : Macromolecules (cellular constituent) biosynthesis   1.6.1 : Phospholipid   1.6.2 : Colanic acid (M antigen)   1.6.3 : Lipopolysaccharide    1.6.3.1 : O antigen    1.6.3.2 : Core region    1.6.3.3 : Lipid A   1.6.4 : Enterobacterial common antigen (surface glycolipid)   1.6.5 : K antigen   1.6.6 : Osmoregulated periplasmic glucan   1.6.7 : Peptidoglycan (murein)   1.6.9 : Polysaccharides, cytoplasmic   1.6.10 : Lipoprotein   1.6.11 : Glycoprotein   1.6.12 : Flagella   1.6.13 : Fimbria, pili, curli   1.6.15 : Large molecule carriers    1.6.15.1 : Cytochromes    1.6.15.2 : Thioredoxin, glutaredoxin    1.6.15.3 : Biotin carboxyl carrier protein    1.6.15.4 : Acyl carrier protein   1.6.16 : Cellulose biosynthesis  1.7 : Central intermediary metabolism   1.7.1 : Unassigned reversible reactions   1.7.2 : Glyoxylate bypass   1.7.3 : Pentose phosphate shunt, non-oxidative branch   1.7.6 : Glycerol metabolism   1.7.7 : Galactose metabolism   1.7.8 : Gluconeogenesis   1.7.9 : Misc. glucose metabolism   1.7.10 : Sugar nucleotide biosynthesis, conversions   1.7.12 : Amino sugar conversions   1.7.13 : Amino acid conversion   1.7.14 : Polyamine biosynthesis   1.7.15 : 2'-deoxyribonucleotide/ribonucleoside metabolism   1.7.17 : Formyl-tetrahydrofolate biosynthesis   1.7.18 : Betaine biosynthesis   1.7.19 : Incorporation of metal ions   1.7.20 : S-adenosyl methionine biosynthesis   1.7.21 : Glyoxylate degradation   1.7.22 : Carnitine metabolism   1.7.23 : Methylglyoxal metabolism   1.7.24 : Cyanate catabolism   1.7.25 : Glycolate metabolism   1.7.26 : Allantoin assimilation   1.7.27 : Pyridoxal 5'-phosphate salvage   1.7.28 : Pyruvate catabolism   1.7.29 : Acetate catabolism   1.7.31 : Aminobutyrate catabolism   1.7.32 : Putrescine catabolism   1.7.33 : Nucleotide and nucleoside conversions   1.7.34 : Peptidoglycan (murein) turnover, recycling   1.7.35 : Lactate oxidation   1.7.36 : Trehalose biosynthesis   1.7.37 : C1 assimilation, serine pathway   1.7.38 : Methionine salvage pathway  1.8 : Metabolism of other compounds   1.8.1 : Phosphorous metabolism   1.8.2 : Sulfur metabolism   1.8.3 : Nitrogen metabolism 2 : Information transfer  2.1 : DNA related   2.1.1 : DNA replication   2.1.2 : DNA restriction/modification   2.1.3 : DNA recombination   2.1.4 : DNA repair   2.1.5 : DNA degradation  2.2 : RNA related   2.2.2 : Transcription related   2.2.3 : RNA modification   2.2.4 : RNA degradation   2.2.5 : tRNA   2.2.6 : rRNA, stable RNA   2.2.7 : Antisense RNA  2.3 : Protein related   2.3.1 : Amino acid-activation   2.3.2 : Translation   2.3.3 : Posttranslational modification   2.3.4 : Chaperoning, folding   2.3.5 : Export, signal peptide cleavage   2.3.6 : Turnover, degradation   2.3.7 : Nucleoproteins, basic proteins   2.3.8 : Ribosomal proteins   2.3.9 : Non-ribosomal peptide synthetase 3 : Regulation   3.1. : Type of regulation   3.1.1 : DNA structure level    3.1.1.1 : DNA bending, supercoiling, inversion    3.1.1.2 : Methylation   3.1.2 : Transcriptional level    3.1.2.1 : Sigma factors, anti-sigmafactors    3.1.2.2 : Activator    3.1.2.3 : Repressor    3.1.2.4 : Complex regulation     3.1.2.4.1 : More than one signal needed     3.1.2.4.2 : Regulons or multilayer component regulatory systems     3.1.2.4.3 : Two-component regulatory systems (external signal)     3.1.2.4.4 : Quorum sensing    3.1.2.5 : Action unknown   3.1.3 : Posttranscriptional    3.1.3.1 : Translation attenuation and efficiency    3.1.3.2 : Covalent modification, demodification, maturation    3.1.3.3 : Inhibition / activation of enzymes    3.1.3.4 : Proteases, cleavage of compounds    3.1.3.5 : Multilayer regulatory systems    3.1.3.6 : Antisense RNA   3.1.4 : Regulation level unknown  3.3 : Genetic unit regulated   3.3.1 : Operon (regulation of one operon)   3.3.2 : Regulon (a network of operons encoding related functions)   3.3.3 : Stimulon (ie. environmental stimulus)   3.3.4 : Global  3.4 : Trigger (some information added)  3.5 : Trigger modulation (some information added) 4 : Transport  4.1 : Channel-type Transporters    4.1.A. : alpha-type channels     4.1.A.1. : The Voltage-gated Ion Channel (VIC) Superfamily     4.1.A.8. : The Major Intrinsic Protein (MIP) Family    4.1.A.11 : The Chloride Channel (ClC) Family    4.1.B.17 : The Outer Membrane Factor (OMF) Family    4.1.A.22 : The Large Conductance Mechanosensitive Ion Channel (MscL) Family    4.1.A.23 : The Small Conductance Mechanosensitive Ion Channel (MscS) Family    4.1.A.46 : The H+- or Na+-translocating Bacterial Flagellar Motor (Mot) Family   4.1.B : Beta barrel porins (The Outer Membrane Porin (OMP) Functional Superfamily)    4.1.B.1 : The General Bacterial Porin (GBP) Family    4.1.B.3 : The Sugar Porin (SP) Family    4.1.B.9 : The FadL Outer Membrane Protein (FadL) Family    4.1.B.10 : The Nucleoside-specific Channel-forming Outer Membrane Porin (Tsx) Family    4.1.B.14 : The Outer Membrane Receptor (OMR) Family    4.1.B.21 : The OmpG Porin (OmpG) Family  4.2 : Electrochemical potential driven transporters    4.2.A. : Porters (Uni-, Sym- and Antiporters)    4.2.A.1 : The Major Facilitator Superfamily (MFS)    4.2.A.2 : The Glycoside-Pentoside-Hexuronide (GPH):Cation Symporter Family    4.2.A.3 : The Amino Acid-Polyamine-Choline (APC) Family    4.2.A.4 : The Cation Diffusion Facilitator (CDF) Family    4.2.A.6 : The Resistance-Nodulation-Cell Division (RND) Superfamily    4.2.A.7 : The Drug/Metabolite Transporter (DMT) Superfamily    4.2.A.8 : The Gluconate:H+ Symporter (GntP) Family    4.2.A.9 : The Cytochrome oxidase biogenesis (Oxa1) Family    4.2.A.10 : The 2-Keto-3-Deoxygluconate Transporter (KDGT) Family    4.2.A.13 : The C4-Dicarboxylate Uptake (Dcu) Family    4.2.A.14 : The Lactate Permease (LctP) Family    4.2.A.15 : The Betaine/Carnitine/Choline Transporter (BCCT) Family    4.2.A.16 : The Telurite-resistance/Dicarboxylate Transporter (TDT) Family    4.2.A.17 : The Proton-dependent Oligopeptide Transporter (POT) Family    4.2.A.19 : The Ca2+:Cation Antiporter (CaCA) Family    4.2.A.20 : The Inorganic Phosphate Transporter (PiT) Family    4.2.A.21 : The Solute:Sodium Symporter (SSS) Family    4.2.A.23 : The Dicarboxylate/Amino Acid:Cation (Na+ or H+) Symporter (DAACS) Family    4.2.A.25 : The Alanine/Glycine:Cation symporter (AGCS) Family    4.2.A.26 : The Branched Chain Amino Acid:Cation Symporter (LIVCS) Family    4.2.A.27 : The Glutamate:Na+ Symporter (GltS) Family    4.2.A.33 : The NhaA Na+:H+ Antiporter (NhaA) Family    4.2.A.34 : The NhaB Na+:H+ Antiporter (NhaB) Family    4.2.A.36 : The Monovalent Cation:Proton Antiporter-1 (CPA1) Family    4.2.A.37 : The Monovalent Cation:Proton Antiporter-2 (CPA2) Family    4.2.A.38 : The K+ Transporter (Trk) Family    4.2.A.39 : The Nucleobase:Cation Symporter-1 (NCS1) Family    4.2.A.40 : The Nucleobase:Cation Symporter-2 (NCS2) Family    4.2.A.41 : The Concentrative Nucleoside Transporter (CNT) Family    4.2.A.42 : The Hydroxy/Aromatic Amino Acid Permease (HAAAP) Family    4.2.A.44 : The Formate-Nitrite Transporter (FNT) Family    4.2.A.45 : The Metal Ion Transporter (MIT) Family    4.2.A.47 : The Divalent Anion:Na+ Symporter (DASS) Family    4.2.A.49 : The Ammonium Transporter (Amt) Family    4.2.A.53 : The Sulfate Permease (SulP) Family    4.2.A.55 : The Manganese (Nramp) Fam.    4.2.A.58 : The Phosphate:Na+ Symporter (PNaS) Family    4.2.A.61 : The C4-dicarboxylate Uptake C (DcuC) Family    4.2.A.64 : The Type V Secretory Pathway or Twin Arginine Targeting (Tat) Family    4.2.A.66 : The Multi Antimicrobial Extrusion (MATE) Family    4.2.A.68 : The p-Aminobenzoyl-glutamate Transporter (AbgT) Family    4.2.A.69 : The Auxin Efflux Carrier (AEC) Family    4.2.A.72 : The K+ uptake permease (KUP) family    4.2.A.75 : The L-lysine exporter (LysE) family    4.2.A.76 : The Resistance to Homoserine/Threonine (RhtB) Family   4.2.C : Ion-gradient driven energizers    4.2.C.1 : TonB Family of Auxiliary Proteins for Energization of OMR-mediated Transport  4.3 : Primary Active Transporters    4.3.A. : Pyrophosphate Bond (ATP; GTP; P2) Hydrolysis-driven Active Transporters    4.3.A.1 : The ATP-binding Cassette (ABC) Superfamily + ABC-type Uptake Permeases     4.3.A.1.a : ATP binding component     4.3.A.1.m : membrane component     4.3.A.1.p : periplasmic binding component     4.3.A.1.am : ATP binding and membrane component    4.3.A.2 : The H+/Na+-translocating F-, V- and A-type ATPase (F-ATPase) Superfamily    4.3.A.3 : The P-type ATPase (P-ATPase) Superfamily    4.3.A.4 : The Arsenite-Antimonite (Ars) Efflux Family    4.3.A.5 : The Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family    4.3.A.6 : The Type III (Virulence-related) Secretory Pathway (IIISP) Family    4.3.A.7 : The Type IV (Conjugal DNA-Protein Transfer) Secretory Pathway (IVSP) Family    4.3.D. : Oxidoreduction-driven Active Transporters    4.3.D.1 : The Proton- or sodium ion-translocating NADH Dehydrogenase (NDH) Family    4.3.D.4 : The Proton-translocating Cytochrome Oxidase (COX) Superfamily  4.4 : Group Translocators   4.4.A : Phosphotransferase Systems (PEP-dependent PTS)    4.4.A.1 : The PTS Glucose-Glucoside (Glc) Family    4.4.A.2 : The PTS Fructose-Mannitol (Fru) Family    4.4.A.3 : The PTS Lactose-N,N'-Diacetylchitobiose-betaucoside (Lac) Family    4.4.A.4 : The PTS Glucitol (Gut) Family    4.4.A.5 : The PTS Galactitol (Gat) Family    4.4.A.6 : The PTS Mannose-Fructose-Sorbose (Man) Family   4.8.A : Accessory Factors Involved in Transport    4.8.A.1 : The Membrane Fusion Protein (MFP) Family    4.8.A.2 : The Secretin Auxiliary Lipoprotein (SAL) Family    4.8.A.3 : MPA1 Family auxillary transport protein    4.8.A.7 : The Phosphotransferase System Enzyme I (EI) Family    4.8.A.8 : The Phosphotransferase System HPr (HPr) Family   4.9.A : Transporters of Unknown Classification    4.9.A.1 : The Polysaccharide Transporter (PST) Family    4.9.A.4 : The Nicotinamide Mononucleotide (NMN) Uptake Permease (PnuC) Family    4.9.A.8 : The Ferrous Iron Uptake (FeoB) Family    4.9.A.13 : The Short Chain Fatty Acid Transporter (scFAT) Family    4.9.A.16 : The Septal DNA Translocator (SDT) Family    4.9.A.17 : The Metal Ion Transporter (MIT) Family   4.9.B : Putative uncharacterized transport protein    4.9.B.3 : The Putative Bacterial Murein Precursor Exporter (MPE) Family    4.9.B.4 : The Putative Efflux Transporter (PET) Family    4.9.B.6 : The Toxic Hok/Gef Protein (Hok/Gef) Family    4.9.B.10 : The 6TMS Putative MarC Transporter (MarC) Family    4.9.B.18 : The SecDF-associated Single Transmembrane Protein (SSTP) Family    4.9.B.21 : The Frataxin (Frataxin) Family    4.9.B.22 : The Putative Permease (PerM) Family    4.9.B.24 : The Testis-Enhanced Gene Transfer (TEGT) Family    4.9.B.25 : The YbbM (YbbM) Family    4.9.B.27 : The YdjX-Z (YdjX-Z) Family    4.9.B.28 : The YqaE (YqaE) Family    4.9.B.29 : The YebN (YebN) Family    4.9.B.31 : The YqiH (YqiH) Family    4.9.B.32 : The Putative Vectorial Glycosyl Polymerization (VGP) Family  4.S : substrate   4.S.1 : (D)-glucarate/galactarate   4.S.10 : allose/ribose   4.S.100 : L-arabinose   4.S.101 : L-arabinose /H+   4.S.102 : L-arabinose/ isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside   4.S.103 : L-asparagine   4.S.104 : lipooligosaccharides   4.S.105 : lipopolysaccharide   4.S.106 : lipoprotein   4.S.107 : L-lactate   4.S.108 : L-leucine/L-valine/L-iso-leucine   4.S.109 : L-rhamnose/H+   4.S.11 : alpha-ketoglutarate   4.S.110 : L-threonine/L-serine   4.S.111 : lysine   4.S.112 : lysine/arginine/ornithine   4.S.113 : maltose   4.S.114 : maltose/maltodextrin   4.S.115 : mannitol   4.S.116 : mannose   4.S.117 : mellobiose   4.S.118 : methionine   4.S.119 : methylgalactoside/galactose   4.S.12 : amino acid   4.S.120 : Mg++   4.S.121 : Mg2+/Ni2+/Co2+   4.S.122 : microcin B17   4.S.123 : Mn+/H+   4.S.124 : molybdate   4.S.125 : molybdenum   4.S.126 : multidrug   4.S.127 : multidrug/bicyclomycin   4.S.128 : muropeptide   4.S.129 : myo-inositor   4.S.13 : amino acid/amide   4.S.130 : Na+   4.S.131 : Na+/ alanine/glycine   4.S.132 : Na+/ H+   4.S.133 : Na+/Ca+   4.S.134 : Na+/dicarboxylate   4.S.135 : Na+/glutamate/aspartate   4.S.136 : Na+/H+   4.S.137 : Na+/leucine/valine/iso-leucine   4.S.138 : Na+/pantothenate   4.S.139 : Na+/proline   4.S.14 : ammonium   4.S.140 : Na+/serine/threonine   4.S.141 : N-acetylgalactosamine   4.S.142 : N-acetylglucosamine   4.S.143 : Ni++   4.S.144 : nicotinamide mononucleotide   4.S.145 : nitrite   4.S.146 : nucleoside   4.S.147 : nucleoside/H+   4.S.148 : oligopeptide   4.S.149 : oligopeptides   4.S.15 : antibiotic   4.S.150 : p-aminobenzoyl-glutamate   4.S.151 : Pb/Cd/Zn/Hg   4.S.152 : peptide   4.S.153 : phenylalanine   4.S.154 : phenylalanine/ tyrosine   4.S.155 : phosphate   4.S.156 : polymyxin   4.S.157 : potassium   4.S.158 : proline   4.S.159 : proline/betaine   4.S.16 : arabinose polymer   4.S.160 : protein   4.S.161 : protein/DNA   4.S.162 : purine/xanthine   4.S.163 : putrescine   4.S.164 : putrescine/ornithine   4.S.165 : putrescine/ornitine   4.S.166 : putrescine/spermidine   4.S.167 : serine   4.S.168 : shikimate/dehydroshikimate   4.S.169 : sialic acid   4.S.17 : arginine   4.S.170 : S-methylmethionine   4.S.171 : spermidine/putrescine   4.S.172 : sucrose   4.S.173 : sugar   4.S.174 : sulfate   4.S.175 : taurine   4.S.176 : tellurite   4.S.177 : thiamine   4.S.178 : thiosulfate   4.S.179 : thiosulfate/sulfate   4.S.18 : arginine/ornitine   4.S.180 : threonine   4.S.181 : trehalose   4.S.182 : tripeptide   4.S.183 : tryptophan   4.S.184 : tyrosine   4.S.185 : uracil   4.S.186 : urasil   4.S.187 : vitamin B12   4.S.188 : water   4.S.189 : xanthosine   4.S.19 : arsenite   4.S.190 : xylose/H+   4.S.191 : Zn   4.S.192 : chrysobactin   4.S.193 : achromobactin   4.S.2 : 2-keto-3-deoxy-D-gluconate   4.S.20 : benzoate   4.S.21 : beta-galactosidase/lactose and glucose   4.S.22 : beta-glucoside   4.S.23 : betaine/choline/glycine   4.S.24 : betaine/choline/glycine transport protein   4.S.25 : Ca+/ H+   4.S.26 : cadaverine/lysine   4.S.27 : carnitine   4.S.28 : cation   4.S.29 : cellobiose/arbutin/salicin   4.S.3 : 3-hydroxyphenylpropionic acid   4.S.30 : cellobiose/salicin/arbutin   4.S.31 : chloramphenicol   4.S.32 : chloride   4.S.33 : choline   4.S.34 : citrate/succinate   4.S.35 : colicin4   4.S.36 : Cu   4.S.37 : curli subunit   4.S.38 : cyanate   4.S.39 : cysteine   4.S.4 : 3-phenylpropionic acid   4.S.40 : cysteine/O-acetyl-L-serine/cysteine metabolites   4.S.41 : cytosine   4.S.42 : D-alanine/D-serine/glycine   4.S.43 : D-galactonate   4.S.44 : D-glucarate   4.S.45 : D-glucose/trehalose   4.S.46 : dicarboxylate   4.S.47 : dipeptide   4.S.48 : D-ribose   4.S.49 : drug   4.S.5 : alkanesulfonate   4.S.50 : D-xylose   4.S.51 : enterochelin   4.S.52 : fatty acid   4.S.53 : Fe   4.S.54 : Fe++   4.S.55 : ferric dicitrate   4.S.56 : ferric enterobactin   4.S.57 : ferric hydroxamate   4.S.58 : ferrichrome   4.S.59 : formate   4.S.6 : alkanesulphonate   4.S.60 : formate/oxalate   4.S.61 : fosfidomycin/H+   4.S.62 : frucose   4.S.63 : fructose   4.S.64 : fucose   4.S.65 : galactitol   4.S.66 : galactose/H+   4.S.67 : gamma-aminobutyrate   4.S.68 : glucitol/sorbitol   4.S.69 : gluconate   4.S.7 : alklphosphonate   4.S.70 : gluconate/L-idonate   4.S.71 : glucose   4.S.72 : glucose/maltose   4.S.73 : glucuronide   4.S.74 : glutamate/aminobutyric acid   4.S.75 : glutamate/aspartate   4.S.76 : glutamine   4.S.77 : glycerol   4.S.78 : glycerol-3-P   4.S.79 : glycine betaine choline transport   4.S.8 : alkylphosphonate   4.S.80 : glycine/betaine/proline   4.S.81 : group A colicins   4.S.82 : H+   4.S.83 : H+/acridine   4.S.84 : H+/lactose/glucose   4.S.85 : heme   4.S.86 : hexose phosphate   4.S.87 : hexuronate   4.S.88 : histidine   4.S.89 : histidine/lysine/arginine/ornithine   4.S.9 : allantoin/ion   4.S.90 : homoserine/lactone   4.S.91 : hydrophilic molecule   4.S.92 : hydrophilic molecules   4.S.93 : ion   4.S.94 : ions   4.S.95 : iron dicitrate   4.S.96 : K+   4.S.97 : K+/H+   4.S.98 : lactate   4.S.99 : lactose 5 : Cell processes  5.1 : Cell division  5.2 : Cell cycle physiology  5.3 : Motility (incl. chemotaxis, energytaxis, aerotaxis, redoxtaxis)  5.4 : Genetic exchange, recombination  5.5 : Adaptation to stress   5.5.1 : Osmotic pressure   5.5.2 : Temperature extremes   5.5.3 : Starvation response   5.5.4 : pH response   5.5.5 : Dessication   5.5.6 : Other stresses (mechanical, nutritional, oxidative)   5.5.7 : Fe aquisition  5.6 : Protection   5.6.1 : Radiation   5.6.2 : Detoxification (xenobiotic metabolism)   5.6.3 : Cell killing   5.6.4 : Drug resistance/sensitivity  5.8 : SOS response  5.10 : Defense/survival  5.11 : DNA uptake  5.12 : Biofilm production  5.13 : Virulence associated 6 : Cell structure  6.1 : Membrane  6.2 : Peptidoglycan (murein)  6.3 : Surface antigens (ECA, O antigen of LPS)  6.4 : Flagellum  6.5 : Pilus  6.6 : Ribosome  6.7 : Capsule (M and K antigens) 7 : Location of gene products  7.1 : Cytoplasm  7.2 : Periplasmic space  7.3 : Inner membrane  7.4 : Outer membrane  7.5 : Extracellular 8 : extrachromosomal  8.1 : Prophage genes and phage related functions   8.1.1 : DNA packaging, phage assembly   8.1.2 : Replication   8.1.3 : Regulation   8.1.4 : Integration, recombination   8.1.5 : Lysis   8.1.6 : Structural component  8.2 : Plasmid related   8.2.1 : replication and maintenance   8.2.2 : plasmid transfer  8.3 : Transposon related   8.3.1 : transposases   8.3.2 : regulation of mobility  8.4 : Colicin related 9 : DNA sites 10 : cryptic genes
PubMedId
Note
Additional Data	CommentInteractionPhenotypeSMILESInternal comment
DBxref	PDBPubChemChEMBLChEBIDOI
Class	1a : Function from experimental evidences in the studied strain 1b : Function from experimental evidences in the studied species 1c : Function from experimental evidences in the studied genus 2a : Function from experimental evidences in other organisms 2b : Function from indirect experimental evidences (e.g. phenotypes) 3 : Putative function from multiple computational evidences 4 : Unknown function but conserved in other organisms 5 : Unknown function

» PRIMARY ANNOTATION

Begin: 1277828

End: 1278715

Frame: +2

Length: 888 (295aa)

» FEATURES / EXPERIMENTAL DATA

» METHOD RESULTS