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Xenopus tropicalis

Analyse de banques de cDNA pré et postmétamorphiques du système nerveux

Projet: Collaboratif
Etat du projet: En cours



Collaborations :
Equipe TGA - CNRS UMR 8080
Université Paris-Sud - Orsay - France

L’amphibien anoure Xenopus laevis est l’un des organismes modèles favoris des embryologistes. Les raisons en sont sa facilité d’élevage, ses embryons de relativement grande taille produits en grandes quantité et au développement externe assez rapide.

La communauté scientifique travaillant sur cet amphibien souhaite maintenant travailler sur l’espèce Xenopus tropicalis (Silurana tropicalis) , espèce diploïde, à la différence de Xenopus laevis, et qui pourrait devenir un modèle en génétique du développement des vertébrés.

Dans ce contexte, le Genoscope analysera environ 30 000 cDNA provenant du mélange de 2 banques (spécifiquement étiquetées au moment du clonage) de système nerveux central de Xenopus tropicalis. Il s’agit d’une banque de cerveaux enrichie de rétines d’embryons de stades de développement 30 à 35 (selon Nieuwkoop et Faber) et d’une banque de système nerveux de têtards en début de métamorphose (stades 51-52) et en milieu de métamorphose (stades 61-62). L’analyse consistera à séquencer 2 étiquettes 5’ et 3’ (EST) de 500 bases pour chaque clone. Au préalable, les banques auront été normalisées par soustraction après hybridation des cDNA très abondants.

Contacts : Patrick Wincker (Genoscope) - Nicolas Pollet (Université Paris-Sud)

mise à jour le 11 mai 2009

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