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Hyposoter didymator

Whole genome shotgun

Project: Collaborative
State of the project: En cours



Collaborations :

Unité Biologie Intégrative et Virologie des Insectes (BIVI)
UMR 1231 INRA - Université Montpellier II
Montpellier

Institut de recherche sur la Biologie de l’Insecte
UMR CNRS
Université François Rabelais
Tours

Le génome des polydnavirus possèdent l’originalité d’être composé de multiples segments circulaires d’ADN double brin. Dans le cas présent, une vingtaine de cercles de 2 à 16 kb ont été identifiés, amenant la taille totale du génome du virus à 250-300 kb.

Pour permettre le séquençage, l’ADN viral sera amplifié grâce à la rolling circle DNA polymérase (Amersham) puis une banque d’inserts de 5 kb sera réalisée dans pcdna2.1 et les extrémités d’environ 2500 clones seront séquencées (soit 5000 séquences).

Contacts: Sylvie Samain (Genoscope) - Nathalie Volkoff (INRA)

Last update on 7 February 2008

© Genoscope - Centre National de Séquençage
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Tél:  (+33) 0 1 60 87 25 00
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