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L’organisme Herminiimonas arsenicoxydans sp. nov., projet également séquencé au Genoscope, est une bactérie équivalente à Thiomonas spp
Le site web du GDR sur le métabolisme de l’arsenic chez les procaryotes.
Le Genoscope entreprend le séquençage de la beta-proteobacterie Thiomonas spp. : une bactérie capable de réduire et d’oxyder l’arsenic dans un but de détoxication.
La taille du génome de cette bactérie est estimée à 5 Mb environ. Le génome sera séquencé à une profondeur de 10X, à partir de trois banques : environ 25 000 inserts de 3 kb clonés dans le vecteur pcdna2.1 (grand nombre de copies), environ 8 000 inserts de 10 kb clonés dans le vecteur pCNS (faible nombre de copies) et près de 4 000 inserts de 20-25 kb clonés dans un vecteur miniBAC (pBBC).
Une étape de finition manuelle sera effectuée au Genoscope.
Contacts : Valérie Barbe (Genoscope) - Philippe Bertin (ULP/CNRS)
© Genoscope - Centre National de Séquençage
2 rue Gaston Crémieux CP5706 91057 Evry cedex
Tél: (+33) 0 1 60 87 25 00
Fax: (+33) 0 1 60 87 25 14
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