Thèse de Rakia Chouari

Thèses
Séminaires

12 décembre 2003

« Exploration de la diversité microbienne dans les procédés d’épuration des eaux à boues activées »
  Cette thèse a été soutenue par Rakia Chouari. Ses travaux ont été effectués au sein de l’équipe « Cloaca maxima » de Denis Le Paslier (mail) et Abdelghani Sghir (mail) .
 
  Il est maintenant bien documenté que des divisions entières de micro-organismes des domaines Bacteria et Archaea demeurent inconnues du point de vue de leur diversité, de leur génome et de leur physiologie. Afin de mieux appréhender l’étendue de cette diversité, nous avons mené une étude phylogénétique à grande échelle de la microflore présente dans les procédé d’épuration des eaux à boues activées.
  L’analyse phylogénétique de plus de 4000 séquences d’ADNr 16S a montré que près de 90% de ces séquences représentent de nouvelles unité taxonomiques. Elle a permis également la caractérisation de nombreuses lignées phylogénétiques et de divisiosn candidates. De plus, cette analyse nous a permis de développer de nouveaux outils moléculaires (amorces PCR et sondes) afin de mieux caractériser et quantifier cette diversité.
  Des cultures en anaérobiose ont également été initiées afin de cultiver certains de ces micro-organismes.