Xanthomonas albilineans, X. campestris pv. campestris et X. sacchari

Dans le but d’identifier par génomique comparative de nouveaux déterminants du pouvoir pathogène permettant à deux espèces de Xanthomonas d’être des agents pathogènes vasculaires efficaces, la séquence des génomes de 16 souches de Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc), de 15 souches de Xanthomonas albilineans (Xalb) et d’une souche de Xanthomonas sacchari (Xsac), une espèce de Xanthomonas isolée de canne à sucre (mais ne causant pas de symptômes sur cette plante) sera déterminée par le Genoscope. L’analyse de génomique comparative sera réalisée avec le service de bio-informatique du LIPM. Les génomes de Xcc seront principalement exploités pour la recherche de nouveaux effecteurs de type III spécifiques des Xcc alors que les séquences de Xalb serviront surtout à la recherche de gènes importants dans les interactions entre la canne à sucre et Xalb. L’analyse des séquences des génomes de Xcc, Xalb et Xsac devrait permettre l’identification de nouveaux gènes importants pour le pouvoir pathogène de ces Xanthomonas, ainsi que la découverte de nouvelles stratégies développées par ces bactéries pour contourner l’immunité dans le système vasculaire des plantes.

Contact Genoscope : Valérie Barbe (Mail)

Contact UMR CIRAD-INRA-Montpellier SupAgro : Philippe Rott (Mail)

Contact UMR CNRS-INRA  : Laurent Noël (Mail)