Phytomonas spp.

Nous proposons le séquençage « comparatif » de deux génomes de trypanosomes, celui d’un pathogène isolé de la noix de coco, Hart1, possédant un caryotype moléculaire du groupe H et celui d’un deuxième, isolé du latex de l’Euphorbia pinea, EM1, qui appartient au groupe D. Ce seront les premiers génomes de trypanosome de plante séquencés. Les tailles des génomes haploïdes sont évaluées à 22 Mb pour la souche EM1 et à 13 Mb pour la souche Hart1. La stratégie pour les deux génomes est d’utiliser la technologie de séquençage « 454 » (pyroséquençage) pour produire la séquence et de procéder à une annotation de cette dernière.

Contact collaborateur :
Michel Dollet (Mail)
CIRAD-BIOS

Contact Genoscope  :
Patrick Wincker (Mail)