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Branchiostoma lanceolatum

Séquençage, assemblage et annotation d’un génome de céphalocordé de la Méditerranée

Projet: Collaboratif
Etat du projet: En cours



Collaborations :
Observatoire océanologique de Banyuls/mer
Laboratoire de Biologie Intégrative des Organismes Marins
Equipe Evolution et développement des Chordés (UMR 7232)
Contact  : Hector Escriva Garcia

Ce projet a pour but principal d’obtenir une séquence génomique du cephalochordé B. lanceolatum avec un assemblage et une annotation de haute qualité permettant des études comparatives fines ainsi que la reconstruction du génome ancestrale des chordés.
La stratégie utilisée sera de réaliser une couverture de 100x en fragments chevauchants et d’utiliser une banque mate-pair (fragments de grande taille) en Solexa_HiSEQ pour les assembler.

 

Contact collaborateur :
Hector Escriva Garcia
Observatoire océanologique de Banyuls/mer
Tel : 04 68 88 73 90
E-mail

Contact Genoscope :
Patrick Wincker
Tel : 01 60 87 11 51
E-mail

mise à jour le 28 novembre 2011

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