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Pathogénie Microbienne Moléculaire - INSERM 786 - Institut Pasteur - Paris, France
Genotyping of Pathogens and Public Health Platform - Microbial Population Genetics group - Institut Pasteur - Paris, France
Plateforme Intégration et Analyse Génomiques - Institut Pasteur - Paris, France
Le Genoscope réalise le séquençage de 3 souches de K. pneumoniae et d’une souche de K. ozaenae. La taille du génome de ces bactéries est estimée à environ 5,5 Mb.
Chaque génome sera séquencé par la technologie de pyroséquençage (454 - Roche) afin de couvrir 20 fois la taille du estimée du génome. Les erreurs seront corrigées par le séquençage de courts fragments par la technologie Solexa-Illumina couvrant environ 50 fois la taille du génome.
Une annotation automatique sera réalisée par le Genoscope et l’Institut Pasteur.
Contacts : Valérie Barbe (Genoscope) - Régis Tournebize (Institut Pasteur)
© Genoscope - Centre National de Séquençage
2 rue Gaston Crémieux CP5706 91057 Evry cedex
Tél: (+33) 0 1 60 87 25 00
Fax: (+33) 0 1 60 87 25 14
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