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Projet:
Etat du projet:
Laboratoire des Interactions Plantes-Microorganismes (LIPM) - UMR 2594 INRA-CNRS - Castanet-Tolosan, France
Centre IRD - Montpellier, France
UMR 385, Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite (BGPI) - Campus International de Baillarguet - Montpellier, France
INRA, UMR 077 PaVé, Beaucouzé, France
Le Genoscope entreprend le séquençage du génome d’une bactérie phytopathogène transmise par les semences : Xanthomonas axonopodis pv phaseoli var. fuscans, dont la taille est voisine de 5 Mbases et le ratio G-C proche de 65%.
400 000 lectures seront obtenues sur équipement Gsflx et 10 000 lectures au maximum seront réalisées sur séquenceurs ABI 3730. L’ensemble pourra être éventuellement complété par des lectures de type Solexa.
Une finition de la séquence sera conduite sur les régions non répétées jusqu’à obtention des critères de qualité standard.
Contacts : Valérie Barbe (Genoscope) - Matthieu Arlat (INRA) - Armelle Darrasse (INRA)
© Genoscope - Centre National de Séquençage
2 rue Gaston Crémieux CP5706 91057 Evry cedex
Tél: (+33) 0 1 60 87 25 00
Fax: (+33) 0 1 60 87 25 14
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