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INRA, UMR 1136, INRA-Nancy Université, Interactions Arbres/Microorganismes, Champenoux, France
Dipartimento di Biochimica e Biologia Molecolare, Università degli studi di Parma, Parme, Italie
Istituto per la Protezione delle Piante del CNR, sez. di Torino c/o Dipartimento Biologia Vegetale – UniTO, Turin, Italie
CNR-IGV : Istituto di Genetica Vegetale, articolazione territoriale di Perugia, Perugia, Italie
Dipartimento di Scienze Biomolecolari, Università degli Studi di Urbino, Urbino (PU), Italie
INRA - URGI/BIOGER, Versailles cedex
Dip. Genetica e Biologia molecolare, Instituto di fisiologia generale, Università la Sapienza Roma, Rome, Italie
Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques, UMR 6098 CNRS-Universités Aix-Marseille I & II, Marseille, France
INRA, UMR Amélioration et Santé des Plantes, INRA-Université Blaise Pascal, centre INRA de Clermont-Ferrand-Theix France
Departments of Environmental Sciences and Basic and Applied Biology, University of L’Aquila, L’Aquila, Italie
Università degli Studi di Bologna Ana De Miguel, Bologna, Italie
Université Paul Sabatier (Toulouse III), Unité mixte UPS-CNRS 5546 Surfaces Cellulaires et Signalisation chez les Végétaux, Castanet-Tolosan, France
Le séquençage et l’assemblage du génome de T. melanosporum repose sur une stratégie de séquençage aléatoire à haut débit.
L’ADN génomique a été extrait de la souche haploide Mel28, fragmenté et cloné dans des vecteurs plasmidiques. Plus de 1 280 000 séquences génomiques ont été assemblées (couverture de 10X) à l’aide du programme ARACHNE. L’assemblage final contient 125 Mpb (398 supercontigs, N50= 637 kb).
Contact : Patrick Wincker (Genoscope) - Francis Martin (INRA)
© Genoscope - Centre National de Séquençage
2 rue Gaston Crémieux CP5706 91057 Evry cedex
Tél: (+33) 0 1 60 87 25 00
Fax: (+33) 0 1 60 87 25 14
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