Geodermatophilaceae

Ce projet de séquencage portera sur les génomes de M. multiseptatus BC501 [Urzì et al., 2001] et Blastococcus saxobsidens DD2.

Les applications rendues possibles par les génomes seront :

  De mieux comprendre l’évolution de ces genres et des actinobactéries en portant en particulier attention aux duplications et transferts de gènes

  De comparer ces génomes à ceux d’autres actinobactéries telles que Frankia, Acidothermus et Kineococcus.

  De comprendre le métabolisme cellulaire général, en particulier celui des acides gras ou des composés aromatiques dans le but de découvrir de nouveaux métabolismes carbonés, azotés et énergétiques d’importance biotechnologique.

  D’étudier la physiologie et les facteurs impliqués dans la résistance à la dessiccation et la salinité, et le mécanisme curieux de survie dans des environnements arides ou soumis à de fortes doses de radiations ionisantes.

  De trouver des corrélations entre souches/génomes et caractéristiques des roches de façon à pouvoir proposer de nouvelles méthodes de (bio)contrôle des Geodermatophilaceae poussant à la surface des pierres et de nouvelles techniques de restoration.

  De comprendre la biosynthèse des pigments, leurs propriétés chimiques et leur régulation globale.

  De découvrir de nouvelles voies biochimiques associées à la formation de biofilms, dans le but de trouver de nouvelles techniques de contrôle de la formation de ces biofilms.

  D’étudier la régulation génétique globale de la morphogénèse, et des facteurs impliqués dans la formation de la paroi, du fourreau et du flagelle.

Contacts : Valérie Barbe (Genoscope - Daniele Daffonchio (Université de Milan) - Philippe Normand (Université Claude Bernard Lyon 1)