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Ectocarpus siliculosus

Séquençage aléatoire global

Projet: Collaboratif
Etat du projet: En cours



Collaborations :
UMR7139 CNRS-Goëmar-UPMC
Végétaux Marins et Biomolécules
Station Biologique
Roscoff, France
Site web

La taille du génome d’Ectocarpus siliculosus a été estimée à 214 Mb. Le séquençage aléatoire global sera mené par le Genoscope à hauteur de 10 équivalents génomiques, soit un volume d’environ 4 300 000 lectures à partir de plusieurs banques plasmidiques construites au Genoscope et comprenant des inserts de tailles différentes (3 et 10 kb).

Le Genoscope réalisera en parallèle le séquençage de 100 000 ADNc issus de banques construites à partir de différents stades : sporophytes jeunes et matures, gamétophytes jeunes, protoplastes.

Contacts :

Patrick Wincker (Genoscope) - Mark Cock (UMR 7139, Roscoff)

mise à jour le 11 février 2008

© Genoscope - Centre National de Séquençage
2 rue Gaston Crémieux CP5706 91057 Evry cedex
Tél:  (+33) 0 1 60 87 25 00
Fax: (+33) 0 1 60 87 25 14

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