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Scyliorhinus canicula

Collection d’EST

Projet: Collaboratif
Etat du projet: En cours



Collaborations :

FRE 2815 - Immunologie et embryologie moléculaires
Institut de Transgénose
Orléans, France

Equipe ATIP Génome, Développement et Evolution
Laboratoire Populations, Génétique et Evolution (UPR9034), CNRS
Gif-sur-Yvette, France

Développement et Evolution du cerveau
Institut Alfred Fessard (UPR2197), CNRS
Gif-sur-Yvette, France

Le projet en cours vise à obtenir un échantillonnage important de séquences d’ADNc embryonnaires de lamproie et de roussette. L’analyse de ces données devrait permettre de préciser :

  • des problèmes phylogénétiques qui subsistent chez les chordés (monophylie des cyclostomes ; relation entre les vertébrés et les autres chordés),
  • la chronologie et les mécanismes des duplications géniques à l’origine des vertébrés,
  • le mode d’évolution moléculaire des systèmes génétiques modèles,
  • l’évolution des réseaux de régulation impliqués dans plusieurs processus développementaux étudiés par des équipes partenaires.

Dans ce but, le Genoscope entreprend des lectures systématiques d’ADNc clonés dans le vecteur pSPORT1 et préalablement ordonnés (une lecture par clone).

7 banques d’ADNc embryonnaires ont été construites :

  • Lamproie L. fluviatilis, 3 banques : stades embryonnaire, larvaire et adulte (cerveau/oeil/glande pinéale)
  • Roussete S. canicula, 4 banques : gastrulation, début d’organogénèse, stade post-natal, cerveau adulte

Au total, 300 000 lectures devraient être réalisées.

Contacts :
Patrick Wincker (Genoscope) - Sylvie Mazan (CNRS Orléans)

mise à jour le 11 janvier 2008

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