Saccharomyces cerevisiae EC1118

Séquençage aléatoire global

Projet: Collaboratif
Etat du projet: Fini

Publications :

Novo M, Bigey F, Beyne E, Galeote V, Gavory F, Mallet S, Cambon B, Legras JL, Wincker P, Casaregola S and Dequin S (2009). Eukaryote-to-eukaryote gene transfer events revealed by the genome sequence of the wine yeast Saccharomyces cerevisiae EC1118. Proc Natl Acad Sci U S A. 106(38):16333–16338.

Comprendre les bases moléculaires des propriétés fermentaires des levures oenologiques

Collaborations :

UMR 1083 INRA/ENSA/Université Montpellier I
Sciences pour l’œnologie
INRA, Montpellier, France.

CNRS UMR 2585/INRA UMR 1238
INRA, Thiverval Grignon, France.

En savoir plus :

Article de presse INRA (24/11/2009)

Accédez à :

Les séquences sont enregistrées dans les bases de données sous les numéros FN393058–FN393060, FN393062–FN393087, FN394216 et FN394217.

Le Genoscope entreprend le séquençage du génome de la levure œnologique Saccharomyces cerevisiae EC1118.

La taille du génome de cette souche est estimée à 13 Mb environ. Il sera séquencé à une profondeur de 6X, à partir de deux banques : 33 000 inserts de 3 kb clonés dans le vecteur multicopies pcdna2.1 et 18 000 inserts de 10 kb clonés dans le vecteur pCNS (faible nombre de copies).

Dans un second temps, le séquençage a été complété par 942 534 lectures de pyroséquençage (Roche/454) totalisant 211 Mb, soit une profondeur de 17,6X.

Contacts :
Valérie Barbe (Genoscope) - Sylvie Dequin (INRA)