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Ressources bioinformatiques du Genoscope

Les ressources bioinformatiques sur les organismes sont de plusieurs types :

Blast (Article, Lien) pour Basic Local Aligment Search Tool : méthode de comparaison de séquence d’ADN ou de protéines.
GGB pour Generic Genome Browser (Article, Lien) : interface graphique pour les diverses bases de données (sequence, annotation, synthénies...) sur un organisme.
MaGe pour Magnifying Genomes Microbial (Article, Lien) : système d’annotation de génomes de microorganismes.

Organisme	Projet	Serveur	Article	mise à jour
Procaryotes :		MaGe
Acinetobacter baylyi ADP1	Séquençage aléatoire global	GGB	2008	2008
Eucaryotes :
Arabidopsis thaliana	Chromosome 3	GGB	2000,	2004
	cDNA	GGB	2004	2004
Homo sapiens	Chromosome 14	GGB	2003	Fev. 2003
	Splicing alternatif	GGB	2006	Mai 2006
Oïkopleura dioica	Séquençage aléatoire global	GGB	2006	Oct. 2006
Paramecium tetraurelia	Séquençage aléatoire global	GGB	2006	Nov. 2006
Tetraodon nigroviridis	Séquençage aléatoire global	GGB	2004	Oct. 2004
Vitis vinifera	Séquençage aléatoire global	GGB	2007	Sept.07

mise à jour le 11 avril 2008

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