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Ressources bioinformatiques du Genoscope





 Les ressources bioinformatiques sur les organismes sont de plusieurs types :

  1. Blast (Article, Lien) pour Basic Local Aligment Search Tool : méthode de comparaison de séquence d’ADN ou de protéines.
  2. GGB pour Generic Genome Browser (Article, Lien) : interface graphique pour les diverses bases de données (sequence, annotation, synthénies...) sur un organisme.
  3. MaGe pour Magnifying Genomes Microbial (Article, Lien) : système d’annotation de génomes de microorganismes.
OrganismeProjetServeurArticlemise à jour
Procaryotes :MaGe
Acinetobacter baylyi ADP1Séquençage aléatoire globalGGB20082008
Eucaryotes :
Arabidopsis thalianaChromosome 3 GGB2000, 2004
cDNAGGB20042004
Homo sapiensChromosome 14GGB2003Fev. 2003
Splicing alternatifGGB2006Mai 2006
Oïkopleura dioicaSéquençage aléatoire globalGGB2010Dec.2010
Paramecium tetraureliaSéquençage aléatoire globalGGB2006Nov. 2006
Tetraodon nigroviridisSéquençage aléatoire globalGGB2004Oct. 2004
Vitis viniferaSéquençage aléatoire globalGGB2007Sept.07
Tuber melanosporumSéquençage aléatoire globalGGB2010Mar.2010
Blastocystis hominisSéquençage aléatoire globalGGB2011Mar.2011
mise à jour le 1er septembre 2011

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