Recherche de biocatalyseurs par l’exploration de la biodiversité enzymatique

Projet LCAB
Équipe LCAB

Il est maintenant bien établi que les biocatalyseurs sont des alternatives intéressantes à la chimie de synthèse pour l’industrie.

Une très grande majorité des activités enzymatiques décrites chez les procaryotes ont été montrées et caractérisées expérimentalement sur des bactéries cultivables en laboratoire. On estime en fait que les bactéries « cultivables » représentent en réalité 1% des bactéries. L’apparition il y a quelques années des données issues du séquençage d’ADN de métagénomes bactériens (consortiums de bactéries) donne donc accès à une vaste ressource encore inexplorée d’enzymes de bactéries non encore cultivées en laboratoire et donc d’activités enzymatiques potentiellement nouvelles. Compte tenu de l’amélioration des outils de biologie moléculaire, un certain nombre de stratégies ont été développées pour explorer cette ressource d’enzymes issues des séquences des génomes bactériens et des métagénomes. Ces études fonctionnelles devraient permettre, non seulement d’enrichir notre connaissance de la diversité du métabolisme bactérien, mais devraient également être une source extraordinaire de biocatalyseurs.
 
  Projets :
 

• Enzymes capables de former des liaisons C-C
    Dans les cellules vivantes, la formation ou la rupture des liaisons C-C sont essentielles dans le catabolisme et l’anabolisme d’une grande variété de carbohydrates et de quelques cétoacides. La nature a donc produit de nombreuses enzymes qui sont capables de casser ou de créer des liaisons C-C (Samland and Sprenger, 2006). Ces enzymes suscitent donc un grand intérêt pour les chimistes ; comme par exemple, pour la production des monosaccharides qui nécessite de nombreuses étapes de protection et de déprotection en synthèse chimique traditionnelle.
  • Projet « Enzymes à thiamine »
      collaboration : Isthmus, Laboratoire de Valorisation et Applications (Genoscope)
  • Projet ANR « GenoZyme »
      Partenaires : Equipe Biocatalyse et Métabolisme (SEESIB, Université Blaise Pascal) ; Isthmus
• Projet « Nitrilases »
    collaboration : Anne Zaparucha (LCOB)
• Projet « Baeyer-Villigerases »
    collaboration : Véronique Alphand (Equipe biosciences ; iSm2 ; Université Cézanne)