Populus trichocarpa x deltoides

Dans le cadre du projet ForEST, plusieurs banques d’ADNc ont été construites à partir de racines mycorhizées ou non mycorhizées, de feuilles et de bois sur des arbres soumis ou non à une sécheresse modérée. Le Genoscope doit réaliser le séquençage en 5’ de plus de 55 000 ESTs issus de ces banques. Présentement, près de 11 000 séquences ont été obtenues à partir des banques issues de feuilles, et plus de 2 000 séquences à partir des banques issues de bois. La taille des inserts varie de 0,4 à 1,8kb. Cet effort de séquençage vient en complément du projet Lignome lancé quelques années plus tôt avec la production de 10 000 EST de bois de peuplier et sera lui-même complété avec le séquençage de plus de 500 ADNc pleine longueur dans le cadre de l’AIP séquençage 2006. La distribution relative des différentes séquences dans les banques d’ADNc ainsi que des analyses globales d’expression sur puce entière peuplier de type Affymétrix (programme Génoplante 2010 « Popsec ») permettront d’identifier des gènes candidats importants pour l’adaptation des arbres aux stress abiotiques, sur lesquels des analyses plus poussées seront effectuées :

• Localisation fine dans le bois par des techniques immunologiques,
• approche de la fonction par génie génétique,
• évaluation de la variabilité allélique dans les populations naturelles de peuplier.

Contacts :
Patrick Wincker (Genoscope) - Christophe Plomion (INRA) - Francis Martin (INRA) - Jean-Charles Bastien (INRA)