Pinus pinaster

Dans le cadre du projet ForEST, 9 000 EST ont été séquencées en 5’ à partir d’ARNm extrait de bourgeon végétatifs (inserts de 1 kb dans pBlu eScriptIISK). Ceci a permis d’augmenter le catalogue existant (9 000 EST de racines et 9 000 EST de xylème en différentiation). L’ensemble de ces étiquettes a été analysé et annoté à l’aide de la chaîne d’analyse bioinformatique EPA. Un unigène de 12 000 éléments va être produit en 2007 dans le cadre du réseau d’excellence EVOLTREE. Par ailleurs, une base de données de marqueurs microsatellites et SNP a été réalisée et servira de support à la cartographie de gènes chez les Pinaceae.

Contacts :
Patrick Wincker (Genoscope) - Christophe Plomion (INRA) - Antoine Kremer (INRA)