Ostros recursos

A TRADUIRE

• NCBI

• Genbank : GenBank® est une base de données de séquences d’ADN librement accessible (page d’acceuil du NCBI). Elle contient les séquences de plus de 170 000 organismes différents. Sa couverture est mondiale et ses mises à jour sont quotidiennes et disponibles par ftp.
• UniGene permet aux chercheurs de parcourir des bibliothèques d’ADNc par étapes de développement, de tissus, de visualiser des profils d’expression, etc.

• COG (Clusters of Orthologous Groups of proteins). Cette base de donnée de groupes de protéines orthologues est une tentative de classification phylogénique des protéines codées dans les génomes. Chaque COG inclut les protéines qui sont considérées comme orthologues. 138 458 protéines sont réparties en 4873 COGs. La base de donnée est riche de 50 génomes bactériens, 13 génomes d’Archées et de 3 génomes eucaryotes unicellulaires.

• EMBL Nucleotide Sequence Database Cette base de donnée de séquences nucléotidiques est maintenue par l’institut Européen de Bioinformatique (EBI), en collaboration avec le DDBJ (Banque de donnée de séquence ADN du Japon), et de GenBank (NCBI, USA). De nouvelles versions sont proposées chaque trimestre.

• Ensembl : Ensembl est un projet commun entre EMBL-EBI et le Sanger pour développer l’annotation automatique sur les génomes de métazoaires.

A TRADUIRE

• TIGR Gene Indices : Les «Expressed Sequence Tags»(ESTs) ont fourni un premier aperçu de la collection de séquences transcrites dans un grand nombre d’organismes.. Une analyse peut fournir des informations fonctionnelles, structurales ainsi que sur l’évolution.

• ASDB - Alternative Splicing Database : Cette base de données d’épissage alternatif se compose d’une base de données proteique et une base nucléotidique. Les données de protéines de SwissProt sont regroupées dans des clusters qui correspondent aux différentes variantes d’un gène épissé. La base nucléotidique comprend les gènes entiers, annotés dans GenBank avec en prime les informations sur l’épissage alternatif. L’interrogation de la base permet de faire le lien entre tous les variants à travers SwissProt and GenBank.