Marinobacter hydrocarbonoclasticus ATCC49840

Le séquençage complet de la souche Marinobacter hydrocarbonoclasticus qui appartient à un genre marin et qui est de plus en plus ubiquiste dans l’environnement marin permettrait d’étudier les gènes impliqués dans le cycle de l’azote, la production d’énergie (aérobie, anaérobie), la sécrétion de protéines, la dégradation de sources de carbone labile et récalcitrante (hydrocarbure), la formation de biofilm et la résistance à la pression osmotique. Au travers de cette étude, une avancée majeure dans la connaissance des métabolismes fondamentaux d’un micro-organisme marin ubiquiste serait réalisée.

Dans ce but, le Genoscope entreprend le séquençage aléatoire global du génome de la souche Marinobacter hydrocarbonoclasticus ATCC 49840 à partir de trois banques de sous-clones : une banque plasmidique d’environ 15 000 clones dans le vecteur multicopies pcdna2.1 (inserts 3 kb), une banque plasmidique de près de 5 000 clones dans le vecteur à faible nombre de copies pCNS (inserts 10 kb) et une banque miniBACs d’environ 2 500 clones dans le vecteur pBeloBAC11 (inserts 25 kb).

Contacts :
Valérie Barbe (Genoscope) - Valérie Michotey (Université de Marseille)