Hemiascomycetes

Cette étude consacrée à la génomique comparative de 13 espèces représentatives de la classe des Hémiascomycètes est achevée. Les informations déduites de l’analyse bioinformatique de près de 50 Mb de séquences génomiques sont publiées sous forme de 21 articles dans le numéro spécial de FEBS Letters n° 487, issue 1, 22 décembre 2000.

Les principales conclusions portent sur conclusions :

• l’identification de 20 000 nouveaux gènes homologues de Saccharomyces cerevisiae
• l’analyse des gènes Ascomycètes spécifiques
• l’analyse de la redondance génique chez les Hémiascomycètes
• l’analyse comparative des cartes chromosomiques et de la conservation de la synténie par rapport à Saccharomyces cerevisiae,
• l’étude détaillée des 13 levures Hémiascomycètes

Les données de séquences comme les résultats des analyses comparatives sont accessibles sur le site Génolevures. Egalement un lien vers la CLIB (la Collection de Levures d’Intérêt Biotechnologique de l’INRA).

Ces espèces sont les suivantes (entre parenthèse figure le nombre d’étiquettes pour chaque génome) [Le préfixe des noms de séquences] :

• Candida tropicalis (2500) [BD]
• Debaromyces hansenii (2500) [BC]
• Hansenula polymorpha (5000) [BB]
• Kluyveromyces lactis (5000) [BA]
• Kluyveromyces marxianus var. marxianus (2500) [AZ]
• Kluyveromyces thermotolerans (2500) [AY]
• Pichia sorbitophila (5000) [AX]
• Saccharomyces exiguus (2500) [AV]
• Saccharomyces kluyveri (2500) [AU]
• Saccharomyces sevazzi (2500) [AT]
• Saccharomyces uvarum (5000) [AS]
• Yarrowia lipolytica (5000) [AW]
• Zygosaccharomyces rouxii (5000) [AR]

Ce projet est une collaboration avec les laboratoires suivants :

• Génétique et Microbiologie UPRES-A 7010 ULP/CNRS, Strasbourg
• Laboratoire de Génétique Moléculaire, IGM, Orsay
• Centre de Génétique Moléculaire et Cellulaire, UMR 5534 CNRS, Université Claude Bernard, Lyon
• Unité de Génétique Moléculaire des Levures, Département des Biotechnologies, Institut Pasteur
• Génétique Moléculaire et Cellulaire INRA-CNRS, Grignon
• Laboratoire de Biologie Cellulaire de la levure, IBGC CNRS, Bordeaux