Helicoverpa armigera

Le projet international « Bombyx plus » implique le séquençage complet du génome du ver à soie Bombyx mori (achèvement prévu en 2004) et l’exploration partielle et conjointe d’autres lépidoptères. Dans ce programme concerté, il est proposé le séquençage d’une série de BACs choisis des noctuelles Helicoverpa armigera et Spodoptera frugiperda pour :

• évaluer la microsynthénie entre leur génomes et celui du Bombyx (validation du Bombyx comme espèce modèle) ;
• comparer la structure des régions régulatrices des gènes de lépidoptères (analyse de l’expression génétique chez les invertébrés) ;
• obtenir la séquence de gènes d’intérêt agronomique et biomédical présents sur les BACs choisis à dessein ;
• élargir la découverte de gènes nouveaux (près de 40 % des séquences du Bombyx n’ont pas d’homologues chez les diptères).

Dans ce cadre, le Genoscope entreprend le séquençage de 60 BACs de chacune des noctuelles Helicoverpa armigera et Spodoptera frugiperda. Chaque BAC fera l’objet d’un sous-clonage (inserts 5 kb clonés dans pcdna2.1) puis d’un shotgun à une couverture de 10x et enfin d’une étape de finition.

Contacts :
Nathalie Choisne (Genoscope) - Sylvie Samain (Genoscope) - René Feyereisen (INRA)