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Projet:
Etat du projet:
Laboratoire d’Ecologie Microbienne de la Rhizosphère (LEMIR)
UMR 6191, CNRS-CEA-Université de la Méditerranée
DEVM, CEA Cadarache
Saint Paul Lez Durance, France
Institut de Génétique et Microbiologie
Université Paris-Sud
Orsay, France
Le Genoscope entreprend le séquençage de la bacterie Deinococcus deserti VCD115, une bactérie radio-tolérante.
La taille du génome de cette bactérie est estimée à 3,8 Mb. Le génome sera séquencé à une profondeur de 12X, à partir de trois banques : environ 24 000 inserts de 3 kb clonés dans le vecteur pcdna2.1 (grand nombre de copies), environ 8 000 inserts de 10 kb clonés dans le vecteur pCNS (faible nombre de copies) et près de 4 000 inserts de 20-25 kb clonés dans un vecteur BAC (pBeloBAC11).
Une étape de finition manuelle sera effectuée au Genoscope.
Contacts :
Valérie Barbe (Genoscope)
Thierry Heulin (CEA) - Arjan de Groot (CEA)
© Genoscope - Centre National de Séquençage
2 rue Gaston Crémieux CP5706 91057 Evry cedex
Tél: (+33) 0 1 60 87 25 00
Fax: (+33) 0 1 60 87 25 14
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