Collection de souches procaryotes

Projet LCAB
Équipe LCAB

Le nombre de génomes procaryotes séquencés connait une progression exponentielle depuis quelques années et on estime que pour chacun de ces nouveaux génomes, un tiers de leurs gènes sont de fonction inconnue. Cet ensemble de données est donc une ressource précieuse à explorer.
 
 
  Le Genoscope se constitue donc une collection de souches en constante progression qui a actuellement plus de 640 génomes bactériens dont 10% archées.
 
  Nous utilisons également l’ADN du métagénome du bassin anaérobie de la station d’épuration d’Évry (projet « Cloaca Maxima », du LMP ») qui a été séquencé au Genoscope et qui donne accès à plusieurs milliers de gènes dont la plupart des bactéries sont encore inconnues.
  Image de la représentativité de la biodiversité de la collection de souches