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Bradyrhizobium sp. ORS278

Séquençage aléatoire global

Projet: Collaboratif
Etat du projet: Fini



Collaborations :

LSTM Laboratoire des Symbioses Tropicales et Méditerranéennes (UMR IRD/CIRAD/INRA/ENSA-M/UM2)

Laboratoire de Bioénergétique Cellulaire (CEA)

The Microbial Ecology Laboratory (University of Minnesota)

The National Center for Soybean Technology (University of Missouri, USA)

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La séquence complète du génome de Bradyrhizobium sp. ORS278

Le génome de Bradyrhizobium ORS278 est composé d’un unique chromosome circulaire estimé à 7 Mb. Son contenu moyen en G+C serait de 66 à 68%.

Trois banques sont en cours de construction au Genoscope avec des fragments génomiques de tailles 3, 10 et 25 kb respectivement dans les vecteurs pcdna2.1, pCNS et pBBC et 150 000 lectures sont prévues, soit une profondeur de 12x.

Les trous et les régions de moindre qualité dans la séquence assemblée feront l’objet d’un travail de finition au Genoscope.

Contacts : Valérie Barbe (Genoscope) - Eric Giraud (IRD)

mise à jour le 5 juin 2009

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