Blastocystis hominis

Blastocystis hominis, unique Straménophile potentiellement pathogène humain, possède un génome de 10 Mb dont très peu de gènes ont, jusqu’alors, été identifiés.

Fourni par l’UMR ENVL-INRA 598, l’ADN sera extrait des bandes caryotypiques par l’équipe clermontoise, puis utilisé pour la construction de 2 banques plasmidiques (inserts 3 kb dans le vecteur multicopies pcdna2.1 et inserts 10 kb dans le vecteur à faible nombre de copies pCNS) et d’une banque miniBACs (inserts 25-30 kb dans le vecteur pBBC) et le séquençage (volume de lectures prévu : 180 000 environ) par Genoscope.

L’assemblage et l’annotation seront réalisés par l’équipe clermontoise. L’exploitation post-génomique sera orientée vers les adaptations métaboliques et l’évolution d’un eucaryote anaérobie, ainsi que vers la mise en évidence de facteurs de virulence et de transfert zoonotique.

Contacts :
Patrick Wincker (Genoscope) - Christian Vivares (Université de Clermont-Ferrand)