Bacillus cereus F0837/76

Le séquençage du génome de Bacillus cereus F0837/76, un pathogène opportuniste humain, a pour but la comparaison de cette souche avec trois génomes du groupe cereus déjà disponibles (Bce ATCC14579, Bce ATCC10987 et B. anthracis Ames). Comme la souche F0837/76 est la souche connue la plus proche de B. anthracis, tout en étant clairement différente (1-2 % de divergence au niveau nucléotidique), cette comparaison doit montrer les différences vraiment importantes entre le pathogène mortel B. anthracis et le pathogène diarrhéique très toxique F0837/76.

Genoscope entreprend donc le séquençage aléatoire global du génome de Bacillus cereus F0837/76.
Pour ce faire, deux banques plasmidiques (inserts : 3 et 10 kb) et une banque de miniBACs (inserts 25 kb) seront construites à Genoscope. Le séquençage des extrémités des clones obtenus devrait produire environ 80 000 lectures. La finition de la séquence du génome sera réalisée par le séquençage de produits de LR PCR en utilisant l’information disponible sur les génomes proches. Cette étape sera effectuée par le laboratoire collaborant.

Contacts :
Patrick Wincker (Genoscope) - Alexei Sorokine (INRA)