Avril 2009 - Articles publiés

Focus sur...
Un modèle bactérien d’importance remis à jour : Bacillus subtilis

Des chercheurs du Genoscope (IG, CEA/Evry) et de l’Institut Pasteur ont re-séquencé le génome de Bacillus subtilis avec l’une des dernières technologies de séquençage, le pyroséquencage, et prédit, de novo, la fonction des gènes en utilisant la plateforme d’annotation « MicroScope » (Interface graphique MaGe). Le génome de cette bactérie modèle avait été séquencé une première fois en 1997 par un consortium composé de 30 laboratoires. Mais ces premiers travaux présentaient des expertises de qualités inégales qui ralentissaient l’avancée de nombreux domaines inférant à ce modèle, comme la phylogénie, la génétique bactérienne, l’étude des bactéries pathogènes (staphylocoques, streptocoques) et la recherche de biocatalyseurs pour l’industrie (amylase pour le pain, protéases pour les détergents, etc.). Une validation expérimentale de la fonction des gènes, prédite par comparaison de séquences, devrait, par la suite, confirmer les annotations expertes/manuelles du génome de B. subtilis.

Barbe V, Cruveiller S, Kunst F, Lenoble P, Meurice G, Sekowska A, Vallenet D, Wang T, Moszer I, Médigue C, Danchin A, From a consortium sequence to a unified sequence : The Bacillus subtilis 168 reference genome a decade later. Microbiology , (2009), Apr 21.

 
 
  Les autres articles publiés au mois d’avril :

• Le Roux F, Zouine M, Chakroun N, Binesse J, Saulnier D, Bouchier C, Zidane N, Ma L, Rusniok C, Lajus A, Buchrieser C, Médigue C, Polz MF and Mazel D, Genome sequence of Vibrio splendidus : an abundant planctonic marine species with a large genotypic diversity. Environmental Microbiology . Published Online : 1 Apr 2009

• Lescat M, Calteau A, Hoede C, Barbe V, Touchon M, Rocha E, Tenaillon O, Medigue C, Johnson JR, and Denamur E, A module located at a chromosomal integration hotspot is responsible for the multiple-resistance of a reference strain from Escherichia coli clonal group A. Antimicrob Agents Chemother 13 Apr 2009.

• Nouvel LX, Marenda M, Sirand-Pugnet P, Sagne E, Glew M, Mangenot S, Barbe V, Barre A, Claverol S, and Citti C, Occurrence, plasticity and evolution of the vpma gene family, a genetic system devoted to high frequency surface variation in Mycoplasma agalactiae. J Bacteriol 17 Apr 2009.