Thesis
Seminars on 2009
2008 2007 2006
2005 2004 2003
2002 2001 2000
1999 1998 1997
2008
- Jeudi 25 septembre 2008 - 11 h 00
“Induction of glutathione synthesis pathway in response to cadmium in yeast.”
Dr. J. LABARRE - CEA/iBiTec-S/Saclay - 91191 Gif sur Yvette
Abstract:
In response to cadmium (Cd) intoxication, yeast cells induce the synthesis of strong amounts of glutathione (GSH) to detoxify the metal : GSH forms complexes with Cd (Cd-GS_2 ) which are transported into the vacuole through the ABC pump Ycf1.
We used comparative proteome and metabolome approaches associated to a mathematical modelisation of the sulfur pathway to get insights into the mechanisms and regulation of the metabolic response. The analyses showed that the responses could be classified according to the Cd dose used in the study. We distinguished 2 types of Cd concentration : weak doses (from 0.2 to 2 mM) and high doses (e. g. 50 mM).
At high concentration, most enzymes of the GSH pathway were induced. The metabolite pools and flux in the pathway were also strongly increased, particularly g-glutamyl-cysteine. A kinetic analysis showed sequencial and dramatic changes in intermediate sulfur metabolite pools within the first hours of the treatment. This metabolic response was concomitant with a marked decrease in sulfur incorporation in proteins due to both a global decrease of protein synthesis and a reduced utilization of sulfur amino acid in the proteome expressed under cadmium conditions. At this concentration, enzyme expression, metabolite pools and fluxes were all increased showing a high correlation. Interestingly, we identified at this dose a novel metabolite, g-glutamyl-cystathionine specifically produced under Cd conditions that we showed synthesized through Cys3 enzyme activity.
At low concentrations, a significant increase of GSH production is observed (factor 2 to 3) whereas no modification of the proteome is evidenced. The primary effect of low doses of Cd is a 20%/30% increase of sulfate assimilation, leading to increased sulfur available for GSH production. At intermediate doses, the sulfate assimilation remains high and Cd slightly inhibits protein synthesis, thus enhancing the amount of sulfur available for GSH synthesis. Consistently, a further increase in GSH production is observed (factor 3 to 5). The proteome analysis shows that only Cys3 enzyme is significantly induced under these conditions. It then appears that at low concentrations, the increase of GSH synthesis does not seem to be linked to enhanced enzyme amounts but rather to sulfur availability as confirmed by a simple model of the pathway.
The results highlight the importance of combining metabolome, proteome and modeling approaches for the comprehensive and integrative description of cellular metabolism.
Invité par Vincent Schächter- CEA - IG (Genoscope)
- Mercredi 24 septembre 2008 - 11 h 30
“La biocatalyse, du milligramme au kilogramme : l’exemple des réactions de Baeyer-Villiger asymétriques.”
Dr. Véronique ALPHAND - Responsable du Laboratoire Biosciences - Institut des Sciences Moléculaires de Marseille (iSM2)
Invitée par Véronique de Berardinis- CEA - IG (Genoscope)
- Mardi 8 juillet 2008 - 11 h 30 Ce séminaire a été annulé
“Metagenomics as a resource for new biocatalysts, metabolic pathways, and drugs.”
Pr. Rolf DANIEL - Georg-August-Universität Göttingen
Institut für Mikrobiologie und Genetik - Göttingen, Germany (Allemagne)
Invité par Frank Kunst- CEA - IG (Genoscope)
- Vendredi 27 juin 2008 - 11 h 00
"Velvet : Assemblage de novo de génomes grâce aux séquenceurs nouvelle-génération
".
Daniel Zerbin -EMBL-EBI - Wellcome Trust Genome Campus - Hinxton - U.K
Abstract:
De nouvelles technologies (Solexa, SOLiD, etc.) sont en train de révolutionner l’utilisation du séquençage dans les laboratoires.
Les coûts en temps et en argent étant divisés par environ 1000, toute une gamme de nouvelles expériences devient désormais envisageable : ChIPseq, génotypage, étude des CNVs, etc. Dans tous ces exemples, l’alignement des fragments de petite taille (30-50bp) à une référence peut être réalisé de manière fiable et efficace. Cependant, dans le cas du séquençage de nouveaux génomes, et donc en l’absence de référence, les difficultés combinatoires et pratiques s’accumulent. Dans ce but, nous avons développé Velvet, un logiciel spécialisé dans l’assemblage de très courts fragments d’ADN, qui permet déjà à certains laboratoires de séquencer des génomes bactériens. Je présenterai les graphes de Bruijn qui servent de base à Velvet, puis discuterai des solutions expérimentales et algorithmiques possibles pour s’attaquer au problème bien plus complexe des génomes eucaryotes.
Invité par François Artiguenave - CEA - IG (Genoscope)
- Jeudi 19 juin 2008 - 11 h 00
“Clusters fer-soufre et biocatalyse radicalaire : une chimie bio-inorganique fascinante”.
Marc Fontecave - Directeur de l’Institut IRTSV (CEA Grenoble) et Chef du Laboratoire de Chimie et Biologie des métaux
“Génétique de la biogénèse des protéines Fe/S chez E. coli”.
Frédéric Barras - Dir. Laboratoire Chimie bactérienne (IBSM/CNRS) de Marseille
Invité par Véronique de Berardinis - CEA - IG (Genoscope)
- Mardi 17 juin 2008 - 11 h 30
“Bases génétiques de la distorsion de ségrégation méiotique sex-ratio chez Drosophila simulans : apports du séquençage de la région chromosomique impliquée”.
Lucie Fouvry, David Ogereau et Catherine Montchamp-Moreau
CNRS UPR 9034 - Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation (LEGS)
Invités par Sylvie Samain - CEA - IG (Genoscope)
- Vendredi 7 mars 2008
“Protein mining through activity-based (meta)genomics”.
Peter Golyshin -Helmholtz Institute de Braunschweig (Allemagne)
Departement de microbiologie environnementale
Abstract:
The presentation will address activity-based analyses of genomic and
metagenomic libraries to reveal the function of genes, as an approach
complementary to high-throughput sequencing and sequence analysis. A
number of examples of analyses of metagenomic expression libraries
from different microbial communities (e.g. deep hypersaline anoxic
basins and calf rumen), as well as expression libraries from
individual bacteria and archaea (e.g. Alcanivorax, Oleispira and
Ferroplasma) will illustrate the ability of this approach to discover
new enzymes with a given activity, and (after sequencing these) to
attribute functions to conserved proteins with unknown function.
Invité par Thomas Bruls- CEA - IG (Genoscope)
2007
-
23 novembre
“Point sur les nouvelles technologies de séquençage”
Patrick WINCKER
Genoscope, Evry, France - 10 juillet
“Radicals in enzymatic catalysis”
Prof. Wolfgang BUCKEL
Philipps-University of Marburg, Marburg, Allemagne -
21 juin
“Extreme Comparative Genomics: Neanderthals and Human Evolution”
Edward RUBIN, M.D., Ph.D
Division Director, Genomics Division, Genome Sciences Department
Lawrence Berkeley, National Laboratory, Berkeley, California, USA
Director, DOE, Joint Genome Institute, Walnut Creek, California, USA - 29 mai
“What are foraminifers?”
Emmanuelle GESLIN
University of Angers, Faculty of Science, Department of Geology, Angers
“Nitrate respiring foraminifers”
Nils RISGAARD-PETERSEN
National Environmental Research Institute, University of Aarhus.
Dept. of Marine Ecology, Vejsløvej 25, DK-8600 Silkeborg, Danemark -
10 mai
«The genome of Kuenenia stuttgartiensis and beyond – moving the frontiers of microbiology »
Marc STROUS
Dept. of Microbiology, Radboud University Nijmegen, Pays-Bas - 9 mai
«Les virus symbiotes de guêpes parasites sont-ils réellement des virus ? »
Jean-Michel DREZEN
Institut de Recherche sur la Biologie de l’Insecte, UMR CNRS 6035
Faculté des Sciences, Parc de Grandmont, Tours - 4 mai
« Analyse fonctionnelle de gènes responsables de paraplégies familiales chez le poisson zèbre »
Jamilé HAZAN
INSERM U513, Faculté de Médecine de Créteil - 25 avril
« Métabolisme microbien de l’arsenic : les apports récents de la génomique »
Pr. Philippe BERTIN
Université Louis Pasteur, Strasbourg -
24 janvier
« Enigmatic uncultured bacteria in nature and biotechnology »
Dr. Holger DAIMS
Department f&uulm;r Mikrobielle Okologie, Universität Wien, Vienne, Autriche - 23 février
« Impact of nucleotide modification on tRNA structure and function»
Carina FRAUER
Institut f&uulm;r Pharmazie und Molekulare Biotechnologie, Universit&aulm;t Heidelberg
Allemagne
(Niveau 1) - 5 février
« UniPathway: a metabolic door to UniProtKB/Swiss-Prot »
Anne MORGAT
Swiss Institute of Bioinformatics (SIB) – Genève – Suisse
INRIA Rhône-Alpes - Grenoble - 2 février
«Conference on Systems Biology»
organisée par Vincent SCHACHTER (Genoscope, France), E. BIRNEY (EMBL-EBI, UK), P. KAHLEM (EMBL-EPI, UK) - 16 janvier
« Microbiologie de la digestion anaérobie (biogaz, résilience, diversité) »
Jean-Jacques GODON
INRA LBE - Laboratoire de Biotechnologie de l’Environnement
Avenue des Etangs - 11100 Narbonne
2006
- 21 décembre
«Genetics and evolution of metabolic fluxes in the light of metabolic control theory »
Christine DILLMANN et Dominique de VIENNE
Université Paris Sud – INRA-UPS-CNRS-INA PG – Ferme du Moulon – 91190 Gif-sur-Yvette -
29 novembre
«L’analyse du métabolome : un nouvel outil pour l’exploration des systèmes biologiques »
Christophe JUNOT et Eric EZAN
Laboratoire d’Etude du Métabolisme des Médicaments
DSV/DRM/SPI – CEA – Saclay -
8 novembre
«Intégration de données bioinformatiques verticale : De la syntaxe à la visualisation » ou «Comment arrive-t-on à intégrer visuellement des données bioinformatiques après l’avoir fait syntaxiquement ».
Pierre-Emmanuel GROS
LIMSI-CNRS (Orsay) - 11 octobre
« Le projet Encode : Présentation – analyses du transcriptome humain »
France DENOEUD (Genoscope) etSylvain FOISSAC (Centre de Régulation Génomique, Barcelone) -
18 septembre
Compte rendu du meeting : « ISME 2006 - 11th International Symposium on Microbial Ecology » (August 20-25, 2006 Vienna, Austria)
Sonda GUERMAZI, Delphine RIVIERE, Eric PELLETIER et Denis
LE PASLIER -
4 juillet
« Un nouveau modèle de recombinaison à l’œuvre dans les intégrons »
Didier MAZEL
Unité Postulante « Plasticité du Génome Bactérien » CNRS – URA 2171
Département Génomes et Génétique, Institut Pasteur, Paris -
29 mai
« Métabolisme de Corynebacterium glutamicum en conditions de limitation nutritionnelle »
Bruno BOST
Laboratoire de Physiologie et Métabolisme des Corynebactéries, Université Paris Sud (Orsay) -
21 juin
« Les mystères d’une voie méconnue : le cas de la voie du recyclage de la méthionine chez les bactéries »
Dr. Agnieszka SEKOWSKA
Laboratoire de Signalisation, Phosphoprotéome et Communautés Bactériennes
Institut de Génétique et Microbiologie, Orsay -
7 juin
« Biologie systémique des réponses aux stress oxydant et métallique de la cyanobactérie Synechocystis »
Corinne CASSIER-CHAUVAT et Franck CHAUVAT
Service de Biologie Moléculaire Systémique – DSV/DBJC – CEA Saclay - 25 avril
« The impact of microbial genomics on biotechnology »
Gerhard GOTTSCHALK
Institute for Microbiology and Genetics, Goettingen, Germany (Allemagne) - 21 avril
« Genomic functional cores specific to different microbes and detection of essential metabolic pathways »
Alessandra CARBONE
Génomique Analytique, Paris 6 -
7 avril
« La compréhension et l’exploitation des fonctions microbiennes anaérobies de dépollution des déchets solides »
Théodore BOUCHEZ
Microbiologie appliquée à l’environnement / HBAN – CEMAGREF – Groupement d’Antony (92) -
22 mars
« Adaptation du parasite Trypanosoma brucei aux sources de carbone disponible »
Virginie COUSTOU
Laboratoire de Génomique Fonctionnelle des Trypanosomatides – UMR – CNRS 5162 – Université Victor Segalen Bordeaux 2 – Bordeaux - 22 mars
Les rétroposons de trypanosomatides : organisation, évolution et « domestication »
Frédéric BRINGAUD
Laboratoire de Génomique Fonctionnelle des Trypanosomatides – UMR – CNRS 5162 – Université Victor Segalen Bordeaux 2 – Bordeaux -
2 février
« L’évolution des familles de protéines analysée par réseau Bayésien »
Daniel KAHN
Biométrie et Biologie Evolutive – UMR CNRS 5558 – Université Lyon 1 –
Villeurbanne (69)
2005
- 9 décembre
“Le génome agité : séquences d’insertion et plasticité génomique”
Dr. Michael CHANDLER
Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaires, CNRS, Toulouse - 6 décembre
“ Databases and Algorithms for Pathway Bioinformatics”
Peter KARP
Director Bioinformatics
SRI International, USA - 25 octobre
“Membrane proteins in vivo and in silico: getting the best of two worlds”
Pr. Gunnar von HEIJNE
Stockholm Bioinformatics Center
Department of Biochemistry and Biophysics
Stockholm University
SE-10691 Stockholm, Suède - 12 octobre
« Selector Technology – for multiplex DNA analysis »
Dr. Fredrik DAHL
Department of Genetics and Pathology, Rudbeck Laboratory, Uppsala, Suède - 12 juillet
« Compte-rendu du Meeting BioPathways’05 et de la Conférence ISMB’05 – Detroit, Michigan, USA – 23 au 29 juin 2005
Maxime DUROT et Vincent SCHÄCHTER
Genoscope
(Réunion UMR uniquement) - 5 juillet
«Construction de gènes mosaïques par la méthode CLERY (Combinatorial Library Enhancement by Recombination in Yeast) et analyse des signatures de séquences et des variations de fonction.»
Gilles TRUAN
Laboratoire d’Ingénierie des Protéines Membranaires (LIPM)
CNRS - CGM – Gif-sur-Yvette - 1er juillet
«Genome duplications and the impossible South American Rodents»
Milton GALLARDO
Université Austral,
Valdivia, Chili - 23 juin
«Genome Reviews and Integr8 : integrated views of complete genomes and proteomes»
Paul KERSEY
European Bioinformatics Institute
EMBL-EBI, Hinxton, Cambridge, U. K. - 21 juin
«Approches pour l’analyse du métabolome des stérols et des stéroïdes dans le modèle levure : l’apport des méthodes de LC-MS couplées au marquage isotopique froid pour l’analyse des réseaux complexes»
Denis POMPON
Directeur du Laboratoire d’Ingénierie des Protéines Membranaires (LIPM)
CNRS - CGM – Gif-sur-Yvette - 21 juin
«Ingénierie métabolique de la levure S. cerevisiae pour la production de médicaments stéroïdiens»
Denis POMPON
Directeur du Laboratoire d’Ingénierie des Protéines Membranaires (LIPM)
CNRS - CGM – Gif-sur-Yvette - 17 juin
«MicroScope : bases de données pour la (ré)annotation de génomes bactériens»
Claudine MEDIGUE
Atelier de Génomique Comparative – Genoscope/CNRS-UMR 8030 - 16 juin
« Compte-rendu du : Cold Spring Harbor Meeting – « The Biology of Genomes », Cold Spring Harbor, USA, 11-15 mai 2005.
Jean WEISSENBACH et Olivier JAILLON
Genoscope
(Réunion UMR uniquement) - 16 juin
« Compte-rendu du Meeting ASM 2004 »
(Réunion Chercheurs UMR uniquement)
Véronique De BERARDINIS et Marcel SALANOUBAT
Genoscope - 1er avril
«Histoires comme ça : que me dit mon voisin ?»
Antoine DANCHIN
Génétique des Génomes Bactériens – URA 2171 CNRS – Institut Pasteur - Paris
2004
- 13 octobre
« Méthodes in silico pour la reconstruction de voies métaboliques »
Frédéric BOYER
Docteur en Bioinformatique
Laboratoire de Biométrie et de Biologie Evolutive
Université Claude Bernard Lyon 1 et
Projet HELIX
INRIA – Rhône Alpes - 19 juillet
« Compte-rendu de la « 2nd International E. coli Alliance Conference », Banff, Canada – 18 au 22 juin 2004
Vincent SCHÄCHTER
Genoscope - 16 juin
«Persistance de la mémoire : à propos de l’ADN ancien dans la grotte Chauvet »
Jean-Marc ELALOUF
Département de Biologie Joliot-Curie
Laboratoire de PhysioGénomique
CEA, Saclay, Gif-sur-Yvette - 16 mars
«Assemblage des transcriptomes avec zEST »
Hubert WASSNER
E.S.I.E.A.
Ecole Supérieure d’Informatique, d’Electronique et d’Automatique (Paris) - 9 mars
« Experimental evolution of halophily »
Pr. Rupert MUTZEL
Freie Universität Berlin, Institut für Biologie
Berlin - 18 février
« Caractérisation des transcriptomes du système nerveux chez Xenopus tropicalis par séquençage d’ADNc »
Nicolas POLLET
Laboratoire de Transgenèse et Génétique des Amphibiens
CNRS UMR 8080 – Développement et Evolution
IBAIC – Université Paris Sud - 28 janvier
« Discovery of cis-regulatory motifs using comparative genomic in higher eukaryotes »
Laurence ETTWILLER
European Bioinformatics Institute, Hinxton, Cambridge, U.K. - 26 janvier
« Compte-rendu du Congrès PSB 2004 – Pacific Symposium on Biocomputing 2004 – sessions Alternative Splicing et Computational and Symbolic Systems Biology »
Vincent SCHÄCHTER
Genoscope
2003
- 13 octobre
« Emploi de modèles de Markov dans l’analyse des séquences biologiques»
Bernard PRUM
Laboratoire “Statistique et Génome” (UMR CNRS 8071) - 10 octobre
« L’adressage des ARN messagers nucléaires à la mitochondrie : une
séquelle de l’évolution ?»
Philippe MARC, PhD
G.M. Church Lab, Harvard Medical School, Boston, USA - 6 octobre
« Une interface utilisateur pour Biofacet (Lassap) »
Société GENE-IT
92500 Rueil Malmaison - 2 octobre
« Integration of experimental high-throughput data in cellular »
Benno SCHWIKOWSKI
Assistant Professor, Institute for Systems Biology
Seattle, WA, USA - 26 septembre
« The modular evolution of proteins and networks »
Eric BORNBERG-BAUER
Bioinformatics Group, School of Biological Sciences
The University of Manchester, Manchester, U.K. - 18 juin
« Les voies métaboliques de dégradation des produits pétroliers par les micro-organismes »
Dr. F. MONOT
Directeur du Département de Microbiologie, Institut Français du Pétrole
Rueil Malmaison - 5 juin
« Toward complete, experimentally validated genome annotation »
Dr. Michael BRENT
Associate Professor of Computer Science, Director, Laboratory for Computational Genomics
Washington, University, Saint Louis, USA - 16 avril
« Rôles multiples de HU, une protéine de type-histone conservée au cours de l’ évolution chez les bactéries »
Josette ROUVIERE-YANIV
Institut de Biologie Physico-Chimique, Laboratoire de Physiologie Bactérienne – CNRS UPR 9073, 13, rue Pierre et Marie Curie, 75005 Paris - 2 avril
« Molecular evolution of the sense of smell in humans and other primates »
Yoav GILAD
Max-Planck Institute for Evolutionary Anthropology
Inselstrasse 22, Leipzig D-04103, Germany - 1er avril
« Caractérisation moléculaire des gènes de virulence de Streptococcus agalactiae : approche génomique »
Mohamed ZOUINE
Institut Pasteur, Laboratoire Génomique des Microorganismes Pathogènes
25 rue du Dr. Roux, 75015 Paris - 28 mars
« Ensembl : Annotation de génomes et intégration de données »
Emmanuel MONGIN
Bioinformaticien, Responsable annotation Anophele, ENSEMBL - 26 mars
« La réplication à la base de la structuration des chromosomes bactériens »
Eduardo ROCHA
CNRS – Unité Génétique des Génomes Bactériens, I. Pasteur de Paris
Atelier de Bio-Informatique, Université Pierre et Marie Curie, 12 rue Cuvier
75005 Paris - 14 février
« Analyse comparative des propriétés compositionnelles des génomes de D. rerio, F. rubripes et T. nigroviridis »
Kamel JABBARI
Laboratoire de Génétique Moléculaire, Institut Jacques Monod
Paris - 12 février
« Some Genomic Questions Posed by Acinetobacter Metabolism »
Prof. L. Nicholas ORNSTON
Cellular and Developmental Biology, Yale University
New Haven, USA - 22 janvier
Compte rendu du congrès PSB 2003 (Lihue – Hawaï, 3 au 7 janvier 2003 -Pacific Symposium on Biocomputig 2003)
Ralph ECKENBERG
Genoscope
2002
- 11 décembre
« Microbiology of planctomycete-like Anammox bacteria »
Markus SCHMID
Department of Microbiology, University of Nijmegen, The Netherlands. - 3 décembre
Compte rendu du : « First World HUPO Congress » (Versailles , 21 au 24 novembre 2002)
Michaël KATINKA
Genoscope - 10 octobre
« Environmental Genomics : the tip of the iceberg »
Dr. Oded BEJA
Department of Biology, Technion – Israel Institute of Technology
Haifa 32000, ISRAEL. - 15 mai
« The Sanger Institute Gene Resources Project »
Gareth HOWELL and Jennifer ASHURST
The Sanger Institute, Cambridge, U.K. - 3 avril
« Discovery and in situ characterization of uncultured but biotechnologically or medically important microorganisms »
Dr. Michael WAGNER
Microbial Ecology Group, Technical University of Munich, Freising, Allemagne - 20 mars
« De la phylogénie à l’identification et au suivi épidémiologique des souches bactériennes »
Catherine DAUGA
Chercheur à l’Institut Pasteur, 75015 Paris - 26 février
"Ecologie moléculaire des eucaryotes : découverte de nouveaux groupes et implications évolutives »
Lopez-Garcia PURIFICATION
Université Pierre et Marie Curie – UMR 7622 – 75005 Paris
2001
- 5 décembre
“Teleost models in comparative genomic and transgenic analysis of cis-regulatory elements”
Ferenc MULLER
Institute of Toxicology and Genetics - Karlsruhe (Allemagne). - 28 novembre
“Application of in situ hybridization and chip technology for the identification and functional analysis of organisms in complex environmental habitats”
Dr. Angelika LEHNER
Technische Universität München (Allemagne). - 20 novembre
“Stratégies d’annotation de séquences génomiques de micro-organismes”
Claudine MEDIGUE
CNRS UMR 8030, Paris. - 29 octobre
« Unusual Retrotransposons From Fish »
Dr. Russel POULTER
Department of Biochemistry, University of Otago, Dunedin, (Nouvelle-Zélande). - 12 septembre
« Traduction et phylogénie des Eubactéries »
Céline BROCHIER
Equipe « Phylogénie, Bio-informatique et Génome » - UMR 7622, Univ. P. & M. Curie – Paris. - 26 juin
« Un pas vers la compréhension de la surdominance polaire du phénotype callipyge : séquençage comparatif d’un nouveau domaine imprinté »
Pr. Michel GEORGES
Department of Genetics, Faculty of Veterinary Medicine, University of Liege (Belgique). - 13 juin
Compte-rendu du “101st ASM General Meeting”, ASM, Orlando, USA, 20-24 may 2001 »
Abdelghani SGHIR, Rakia CHOUARI, Genoscope. - 11 avril
« Human chromosome 21 : DNA sequence, gene catalogue and impact for molecular medicine »
Marie-laure YASPO, Max-Planck-Institut für Molekulare Genetik, Berlin (Allemagne). - 14 mars
« Molecular microbial ecology - the links between community composition, function and stability»
Dr. Michael WAGNER
Lehrstuhl für Mikrobiologie, Technische Universität München, Freising, (Allemagne). - 8 mars
« Compte-rendu de : « International Plant and Animal Genome IX Conference »
Scherago, San Diego, USA, 12-18 janvier 2001»
Cécile FISCHER, Genoscope, Evry. - 27 février
« Cluster and alignment of EST sequences»
John BURKE, Double Twist, Paris. - 14 février
« Parallélisation d’algorithmes pour l’alignement de séquences avec la technique du pavage (tiling) optimal»
Roumen ANDONOV
ISTV / LAMIH / UMR CNRS, 8530 Parallélisme et optimisat° comb. –Univ. Valenciennes. - 1er février
« High-Throughput Genomics Using the MJ Base Station (Présentation Base Station de mJ Research)»
Evan SHROWRONSKI, Director of Sequencing Operations MJ Gene Works - 31 janvier
« fugu : fishy tales of evolution »
Dr. Melody CLARK, MRC HGMP Resource Centre, Hinxton, Cambridge, (UK)
2000
- 11 décembre
« Identification de nouvelles cibles de l’aldostérone et de la vasopressine par l’analyse en série de l’expression des gènes dans les cellules épithéliales rénales »
Jean-Marc ELALOUF, Dept. de Biologie Cellulaire & Moléculaire, CEA, Saclay. - 1er décembre
« Carte de la diversité génétique du Maïs »
Maud LE THIERRY, Dept. of Ecology and Evolutionary Biology, U.C. Irvine (USA). - 20 novembre
« Plasticité génomique et évolution des chromosomes sexuels chez le poisson Xiphorus »
Jean-Nicolas VOLFF, Biocenter/Physiological Chemistry I, Wuerzburg, (Allemagne). - 25 octobre
« Compte-rendu du "Symposium Biotechnology 2000, 3-8 septembre 2000, Berlin, Allemagne »
Annett KREIMEYER, Genoscope, Evry - 23 octobre
« De la génétique à la génomique médicale : la porte étroite »
Pr. Arnold MUNNICH
Unité de Recherche sur les Handicaps Génétiques de l’Enfant, INSERM U393, Hôpital Necker Enfants Malades, Paris. - 12 octobre
« Molecular sexing and differentially expressed genes during gonad development in fish »
Lazlo ORBAN, boratory of Fish Biotechnology, Institute of Molecular Agrobiology, National University of Singapore (Singapour). - 6 octobre
«Of cultured and uncultured prokaryotes : the role of sequences in classification and ecology »
Pr. Erko STACKEBRANDT , Directeur de la DSMZ, Braunschweig, (Allemagne). - 12 juillet
« Clonage positionnel du gène “osteosclerosis” chez la souris : un modèle d’ostéoporose autosomique récessive létale »
Pr. Georges CARLE, Instabilité et altération des génomes, LGCF-UMR 6549 CNRS, Nice. - 11 juillet
« Compte-rendu des 4èmes journées “Evolution biologique”, Muséum d’histoire naturelle, Marseille, 21-23 juin 2000 »
Hugues ROEST CROLLIUS, Genoscope. - 5 juillet « Compte-rendu du : “4th International symposium on the interface between analytical chemistry and microbiology”, Ifremer, Trégastel, 4-8 juin 2000 »
Denis LE PASLIER, Genoscope. - 7 juin
« Biodégradation des produits pétroliers dans l’environnement »
Dr Jean Paul VANDECASTEEL, Institut Français du Pétrole, Rueil Malmaison. - 22 juin
« Comte-rendu du : 100th ASM General Meeting, ASM, Los Angeles, USA, 20-25 may 2000 »
Abdelghani SGHIR, Genoscope. - 31 mai
« Compte-rendu du “13th Annual Meeting on Genome Sequencing & Biology” (Cold Spring Harbor, USA, 10-14 mai 2000) »
Jean WEISSENBACH, Hugues ROEST CROLLIUS , Genoscope, Evry
Jean-François DENEFLE, Sylvain RICARD, Aventis, Evry. - 24 mai
« HAPPY mapping - a simple way to make genome maps »
Dr Paul H. DEAR, MRC Laboratory of Molecula Biology, Cambridge, (UK). - 3 mai
« L’analyse protéomique : un complément à l’analyse du génome »
R. JOUBERT-CARON et M. CARON
Laboratoire de Biochimie des Protéines et Protéomique, Université Paris 13, Bobigny. - 25 avril
« Human gene number estimated from analysis of EST »
Phil GREEN, Washington University, Seattle, (USA). - 17 avril
« Cartographie génétique de Loop-tail (Lp), un mutant murin de défaut du tube neural »
Caroline PATERNOTTE
Neural Development Unit, Institute of Child Health, university College, Londres, (U.K.). - 13 avril
« Localisation d’un gène de susceptibilité des maladies bipolaires »
Nicholas BARDEN, Département des Neurosciences, Centre de Recherche du CHUL, (Québec). - 14 mars
« Dix mille générations de plasticité génomique chez E. coli »
Michel BLOT, Université J. Fourier, Grenoble. - 2 mars
« Tools to help EST mapping at EBI »
Patricia RODRIGUEZ-TOME, EBI, Hinxton, (UK).
**1er mars
« Progression du séquençage complet des génomes de riz et d’Arabidopsis. Compte-rendu de réunion (8-14 février 2000, Japon) »
Francis QUETIER et Marcel SALANOUBAT, Genoscope. - 24 février
« Le traitement des eaux résiduaires : un défi écologique »
Philippe GINESTET, CIRSEE - Lyonnaise des Eaux. - 25 janvier
« Applied Genome Technology Center at the University of Georgia - New Technology and Bioinformatics »
Lee PRATT, Applied Genome Technology Center, University of Georgia, (USA). - 5 janvier
« Étude de la biodiversité du monde microbien dans un environnement “naturel” »
Denis LE PASLIER et Abdelghani SGHIR, Genoscope, Evry.
1999
- 20 décembre
« Biodiversité de la flore du côlon humain »
Abdelghani SGHIR, Genoscope, Evry. - 14 décembre
« Organisation et évolution du génome des vertébrés »
Pr Giorgio BERNARDI
Institut Jacques MONOD, Paris et Laboratoire d’Evolution, Naples (Italie). - 23 novembre
« Compte-rendu de la 2nd Georgia Tech International conference on Bioinformatics « In Silico Biology - Sequence & Structure & Function » (Atlanta, USA, november 11-14, 1999) »
Olivier JAILLON, Hugues ROEST CROLLIUS, Genoscope, Evry. - 19 octobre
« Compte-rendu de la« 11th International Genome Sequencing and Analysis » (Miami, USA, September 16-22, 1999) »
Philippe BROTTIER, Laurence CATTOLICO, Hervé CRESPEAU et Delphine SAMSON, Genoscope, Evry. - 8 octobre
« Compte-rendu de la « Gordon research Conference on Genetic Toxicology » (Oxford, UK, August 1-6, 1999) »
Peter BROOKS, Genoscope, Evry. - 6 septembre
« Compte-rendu du dernier meeting stratégique sur le séquençage du génome humain (Hinxton, UK, 1er septembre 1999) »
Jean WEISSENBACH, Genoscope, Evry. - 25 août
« Compte-rendu des conférences « BIOPERL’99 » (5 août 1999), « 7th ISMB » (6-11 août 1999, Hedelberg, « Bioinformatics & Genome Research’99 » (San Francisco, USA, 14-15 juin 1999) »
François ARTIGENAVE, Thomas BRULS et William SAURIN
Genoscope, Evry. - 23 août
« Compte-rendu de l’« ASM Conference on Microbial Biodiversity » (Chicago, USA, August 5-9, 1999) »
Denis LE PASLIER, Genoscope, Evry. - 15 juillet
« Compte-rendu de la « 2nd European Cytogenetic Conference » (Vienne, Autriche, July 3-6, 1999) »
Cécile FISCHER, Genoscope, Evry. - 9 juillet
« Symbiose racinaire chez Medicago trunculata. Grandes lignes du projet EST et perspectives. »
Etienne-Pascal JOURNET, INRA, Toulouse. - 8 juillet
« Human and bacterial genome sequencing projects at the University of Oklahoma »
Bruce A. ROE, University of Oklahoma, (USA). - 25 juin
« Compte-rendu du « 99th General Meeting of the American Society for Microbiology » (Chicago, Illinois, USA, May 30-June 3, 1999) »
Denis LE PASLIER et Jean WEISSENBACH, Genoscope, Evry. - 12 mai
« Séquençage du Chromosome 14 humain »
Thomas BRULS, Gabor GYAPAY, Roland HEILIG et Jean WEISSENBACH, Genoscope, Evry. - 10 juin
« Les microsporidies, organismes eucaryotes exotiques à petit génome »
Michaël KATINKA, Genoscope, Evry. - 14 juin
« La mutagénèse par insertion d’ADN-T chez Arabidopsis : un outil pour l’étude génétique et moléculaire de la physiologie et du développement des plantes »
Loic LEPINIEC, Laboratoire de Biologie des Semences, INRA, Versailles. - 17 juin
« Compte-rendu du « 12th Annual Meeting on Genome Sequencing & Biology » (Cold Spring Harbor, USA, 19-23 mai 1999) »
Cécile FISCHER et Hugues ROEST CROLLIUS, Genoscope, Evry. - 19 avril
« Evolution expérimentale des génomes : enjeux et obstacles »
Philippe MARLIERE, Institut Pasteur, Paris. - 15 avril
« Analyse du génome de Tetraodon nigroviridis »
Alain BERNOT, Cécile FISCHER et Hugues ROEST CROLLIUS, Genoscope, Evry. - 14 avril
« Une horloge moléculaire liée à la segmentation des vertébrés »
Olivier POURQUIÉ, Laboratoire de Génétique et de Physiologie du Développement, Marseille Luminy. - 19 mars
« Séquençage et analyse du génome de Pyrococcus abyssi »
Valérie BARBE, Roland HEILIG et William SAURIN, Genoscope, Evry. - 17 mars
« Le syndrome de la souris DDK»
Charles BABINET, Institut Pasteur, Paris - 4 mars
« Compte-rendu du congrès « Microbial Genomes III : sequencing, functional analysis and comparative genomics » (Chantilly, USA, 29 janvier – 1er février 1999) »
Valérie BARBE et Roland HEILIG , Genoscope, Evry. - 4 février
« Les minisatellites, des empreintes génétiques à Chernobyl »
Gilles VERGNAUD, Institut de Génétique et Microbiologie, Orsay. - 11 février
« Pourquoi séquencer le génome de Mycoplasma pulmonis, l’agent de la mycoplasmose respiratoire murine ? »
Alain BLANCHARD, Unité d’Oncologie Virale, Institut Pasteur, Paris. - 13 janvier
« Un génome chimiquement déviant : le cas du cyanophage S-2L »
Alexandre KAMINSKI, Institut Pasteur, Paris. - 7 janvier
« Recherche de gènes suppresseurs impliqués dans les leucémies aigües lymphoblastiques »
Bernard GRANDCHAMP, Faculté Bichat, Paris.
Last update on 20 April 2009