Arabidopsis thaliana siliculosis

Comme solution alternative à la cartographie par empreinte de fragments de restriction (fingerprinting), et en collaboration avec l’Université de Pennsylvanie, membre du Consortium SPP, et le centre de séquençage TIGR, le Genoscope détermine les séquences d’extrémités des clones de BAC provenant des banques TAMU et IGF.

Ce projet facilite le choix des clones de BAC à séquencer, afin de limiter les zones de recouvrement avec les clones de BAC adjacents.

La contribution du Genoscope porte sur la détermination des séquences d’extrémités de plus d’environ 9 000 clones des banques TAMU et IGF. 8 735 séquences d’extrémités de clones de BAC de la banque TAMU, et de 7 625 séquences d’extrémités de BAC de la banque IGF ont été déterminées.

1. Visualisation des séquences et des chromatogrammes
2. Accès aux séquences d’extrémités de BAC
3. Protocole pour la préparation d’ADN de BAC
4. Recherche par BLAST